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Caenorhabditis elegans (nematode) (cele0)
Gene : C23G10.8
DDBJ      :             S. pombe adenylyl cyclase-associated protein (weak)
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  2/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
d.336.1
:937 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   233->349 2b3wA PDBj 2e-06 29.0 %
:RPS:PDB   228->358 2b3wA PDBj 4e-14 24.2 %
:RPS:SCOP  228->375 2b3wA1  d.336.1.1 * 6e-18 23.8 %
:HMM:SCOP  1->190 2b3wA1 d.336.1.1 * 2.6e-24 27.9 %
:HMM:SCOP  198->404 2b3wA1 d.336.1.1 * 2.2e-24 35.3 %
:HMM:SCOP  418->616 2b3wA1 d.336.1.1 * 1.9e-21 32.9 %
:RPS:PFM   229->352 PF08719 * DUF1768 6e-14 37.8 %
:HMM:PFM   25->188 PF08719 * DUF1768 3.8e-07 24.4 131/157  
:HMM:PFM   231->373 PF08719 * DUF1768 6.4e-16 28.7 136/157  
:HMM:PFM   439->616 PF08719 * DUF1768 1.4e-09 28.8 139/157  
:HMM:PFM   775->817 PF00577 * Usher 0.0004 32.6 43/783  
:BLT:SWISS 200->370 YL58_CAEEL 9e-09 27.7 %
:REPEAT 2|20->235|236->445
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links DAD WormBase Abbreviations Back to title page
GT:ID AAF99879.1 GT:GENE C23G10.8 GT:PRODUCT S. pombe adenylyl cyclase-associated protein (weak) GT:ORG cele0 GT:DATABASE WS208 WP:CE CE25784 WP:PRODUCT S. pombe adenylyl cyclase-associated protein (weak) WP:LOCUS WBGene00016015 GB:PROTEIN_ID AAF99879.1 LENGTH 937 SQ:AASEQ 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200->370|YL58_CAEEL|9e-09|27.7|166/242| NREPEAT 1 REPEAT 2|20->235|236->445| SEG 395->406|lllmelreklsl| SEG 527->542|lqllleqhpallrall| SEG 778->797|gpssstgpsisappipsrpg| SEG 807->838|rerdreeerekdrerlqsqlstsssgpqgsas| SEG 887->902|sppsrkaapspakkpa| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 233->349|2b3wA|2e-06|29.0|107/168| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 228->358|2b3wA|4e-14|24.2|120/168| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 229->352|PF08719|6e-14|37.8|119/153|DUF1768| HM:PFM:NREP 4 HM:PFM:REP 25->188|PF08719|3.8e-07|24.4|131/157|DUF1768| HM:PFM:REP 231->373|PF08719|6.4e-16|28.7|136/157|DUF1768| HM:PFM:REP 439->616|PF08719|1.4e-09|28.8|139/157|DUF1768| HM:PFM:REP 775->817|PF00577|0.0004|32.6|43/783|Usher| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 228->375|2b3wA1|6e-18|23.8|126/160|d.336.1.1| HM:SCP:REP 1->190|2b3wA1|2.6e-24|27.9|147/0|d.336.1.1|1/3|YbiA-like| HM:SCP:REP 198->404|2b3wA1|2.2e-24|35.3|156/0|d.336.1.1|2/3|YbiA-like| HM:SCP:REP 418->616|2b3wA1|1.9e-21|32.9|152/0|d.336.1.1|3/3|YbiA-like| OP:NHOMO 2 OP:NHOMOORG 2 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 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ccccEEEEEEccccEEEccccEEEEccccccccHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHcccccccHHEEEEEEccccccccHHHHHHHHHHHHHHHcEEEEEEEccccHHHHHHHHHcccEEEEEEcccccEEEEcccHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEEcccccccccEEEEccccEEEEEEccccccccccccEEEccEEEccHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHccccEEEEccccccEEEcccccHHHHHHccHHHcccHHHcccccccccHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEHHHHccccccccccccEEEEccHHHHcccccccEEEcccccccccHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHccccEEEEEEHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHccccEEEHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEcEEEEEEccccHHHHHHHHHHccccEEEEEcHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHccccccccccccccccccccccccccEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHcEEEccccHHHHccccHHHcccccccccccccccccHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHcccccEEccccccc //