[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Caenorhabditis elegans (nematode) (cele0)
Gene : C49H3.10
DDBJ      :             monocarboxylate transporter like
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  148/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.118.1c.1.10c.1.8d.159.1
:950 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   27->758 3ibvB PDBj 2e-28 24.7 %
:RPS:PDB   189->312 3ebvA PDBj 1e-04 11.9 %
:RPS:SCOP  189->261 1e9lA1  c.1.8.5 * 9e-05 16.9 %
:RPS:SCOP  276->466 1uf3A  d.159.1.6 * 4e-04 21.0 %
:RPS:SCOP  784->889 2fiqA1  c.1.10.7 * 3e-06 22.8 %
:HMM:SCOP  12->857 1wa5C_ a.118.1.1 * 5.9e-41 19.6 %
:RPS:PFM   100->243 PF08389 * Xpo1 1e-04 25.4 %
:HMM:PFM   98->244 PF08389 * Xpo1 1.2e-26 27.3 143/148  
:BLT:SWISS 1->898 XPOT_PONAB 9e-89 27.7 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links DAD WormBase Abbreviations Back to title page
GT:ID AAF99897.3 GT:GENE C49H3.10 GT:PRODUCT monocarboxylate transporter like GT:ORG cele0 GT:DATABASE WS208 WP:CE CE29726 WP:PRODUCT monocarboxylate transporter like WP:LOCUS WBGene00002080 GB:PROTEIN_ID AAF99897.3 LENGTH 950 SQ:AASEQ MFGTNGNAGIAVTDPTKQAEIYRALESLKKDESGWKKSVDSFIGPHKPSPEEQFLLLQVIEDYLNKRYHSSSQGDVSVIRTFLLHYTKNSRSSTVDQPAFLTNKMAHIFSLVFAADFPERWSSFFNDLFFSDNINDRKVAFFYLKVLLAIDTEVVNRDIQRSKNESDRNIKIKDAMREICINEIAKSWLTIANALPEDNVIQCLVLDNIASYVDWIELDLVANDYVMPLIISKFQNPATSESATAAVCSLLEKGMPAEKKVGLTLTIMTVLRSNGLLTVNDNNDEEEVTRVGSLVNTLGLVLLDVQNKLCASSILEKEQECCVQEMAGLAEPALVVLNNEDPDLSCMCIDYIRAYCSFLLKFHPNETNFIEKVIRAGLQRYVMNDDMTVGGDGEDEVEFQEFRRELRSMLNVIGLKRPEAIINAVEPWTAEVTSGGSSIPVNRIEALLNVIFHLHEIIPSNMLQSPREGISQRAARLPIVILEGLVLDGRCPAIHVLYFELACRYERLLVLQPQPVVIPHIAAAFLDQRGISISSANVRTRIVYLFCRFVKSHKTVLGPLVSEVITRLAPLLAVSPQADTNQLLSPEDQGYIFEATATLIVFGDLTSEMKSQYVGELASTLAMKFENGLVELNTARARKADEETIQAILQFMSNIIGYSSRMSKAFNNAQSMKACNCIDIYLRLIKLYLETLSPQNAFLLESTRQFAHRLVVSMENELMPYMNGIFDKLALVSTDLDSMHHLLIFCHQTVAKYKKAMLTSGVDLGNVLAIAARASLQEQENNIPAKDDSQRALLYVQRAFVQLLYTVIASDCTPALNTTPGLLDHVLESAARLALSSDQTAQKVALSCLAKISLITPSWSARTLRVALEIPSLSHITPSDAGSTLVVHEVCATLTSLHQSDPDGFTRALRELVPNGFSDQLLSALTNLKGKNLDKQVMNLYSSLRNQSAQ BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 1->898|XPOT_PONAB|9e-89|27.7|875/962| SEG 122->136|ssffndlffsdnind| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 27->758|3ibvB|2e-28|24.7|693/902| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 189->312|3ebvA|1e-04|11.9|118/285| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 100->243|PF08389|1e-04|25.4|134/147|Xpo1| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 98->244|PF08389|1.2e-26|27.3|143/148|Xpo1| RP:SCP:NREP 3 RP:SCP:REP 189->261|1e9lA1|9e-05|16.9|71/302|c.1.8.5| RP:SCP:REP 276->466|1uf3A|4e-04|21.0|181/228|d.159.1.6| RP:SCP:REP 784->889|2fiqA1|3e-06|22.8|92/410|c.1.10.7| HM:SCP:REP 12->857|1wa5C_|5.9e-41|19.6|662/0|a.118.1.1|1/1|ARM repeat| OP:NHOMO 175 OP:NHOMOORG 148 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----111-----1111111111111111111-111111111111111111111111-1111111111111-11111--1-111111-1----1-------1--111-1-1-2111311111111121311C1-121111111111111111-1-11211-511111-----1111-1----11111132111---11-- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 776 STR:RPRED 81.7 SQ:SECSTR ######HHHHHTccccHHHHHHHHHHHHHHcTTHHHHHHHHTTccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccTTTcHHHHHHHHHHHHHHHHcT##TcTTccHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTcTTHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHEEccGGGccTTHcHHHHHHHHTGGGccEcHEEEccccccEcTTccEEcTTcHHHHHHHHHHHHTTTccGGGHHHEEEEEEccTTccccccccHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccTTccEETccHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHTcccHHHHHTTHHHHTTcccccHHHHHHHHHHHHHHHHT##TcccccccccccccccTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTccHHHHHHHHH##HHHHHHHHccccccGGGTcccccccHHHHHHHHHHHTGGGHHHHHHHHHHHHHTGGG##GGTccTTHHHHHHHHTcTTTTTcccTTHHHHHHHHHHHHHHHTTTGGGTTHHHHHHHHGGGccccccccHHHHHHTTTHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHH#######HHHHGGGccccHHHHHHHHHHHHHHTcccccccHHHHHHHHHHHH##HHHHHHHHTTT######ccHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHcTTHHHHH#HHHHHcccTTTHHHHHHHHHHHHHHTTTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcccHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcTGGGGc################################################################################################################################################ DISOP:02AL 1-18, 161-165, 467-470, 632-642, 664-670, 947-950| PSIPRED ccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEHHHHHHHHccHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHcccHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHccccccHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccc //