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Caenorhabditis elegans (nematode) (cele0)
Gene : F37A4.4
DDBJ      :             Complement factor H precursor like
Swiss-Prot:YPT4_CAEEL   RecName: Full=Ankyrin repeat-containing protein F37A4.4;

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  2/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
c.1.12c.15.1d.211.1
:1163 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   823->950 2qyjA PDBj 1e-07 32.2 %
:BLT:PDB   952->1018 1l0bA PDBj 6e-04 27.3 %
:RPS:PDB   844->893 2b0oH PDBj 4e-12 28.0 %
:RPS:PDB   894->1029 3cojX PDBj 4e-10 13.6 %
:RPS:SCOP  27->156 1fiyA  c.1.12.3 * 4e-04 16.7 %
:RPS:SCOP  811->893 1iknD  d.211.1.1 * 4e-12 14.5 %
:RPS:SCOP  892->1028 1wf6A  c.15.1.5 * 1e-07 9.8 %
:HMM:SCOP  844->910 1ot8A_ d.211.1.1 * 2.4e-11 31.3 %
:HMM:SCOP  937->1047 1jnxX1 c.15.1.3 * 1.8e-24 33.9 %
:RPS:PFM   29->96 PF02206 * WSN 3e-10 41.2 %
:HMM:PFM   27->94 PF02206 * WSN 3.2e-25 47.1 68/69  
:HMM:PFM   935->1012 PF00533 * BRCT 9.5e-09 30.0 70/78  
:HMM:PFM   856->883 PF00023 * Ank 8.6e-10 42.9 28/33  
:HMM:PFM   87->155 PF06152 * Phage_min_cap2 0.00033 23.2 69/361  
:BLT:SWISS 1->1163 YPT4_CAEEL 0.0 100.0 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links DAD WormBase Abbreviations Back to title page
GT:ID AAA50632.2 GT:GENE F37A4.4 GT:PRODUCT Complement factor H precursor like GT:ORG cele0 GT:DATABASE WS208 WP:CE CE24953 WP:PRODUCT Complement factor H precursor like WP:LOCUS WBGene00018134 GB:PROTEIN_ID AAA50632.2 LENGTH 1163 SQ:AASEQ MKLCHAIFSTFVVFFVASGAGEKQGESQLQQIYDELSILSRVTNAIALQAAALSKTVKIREVITELLKVDNGNFSNLLSLDPAHLVKNLDELHKKSLQAVSGSNEQLQQDLKEMIAMNGLLAAVESENYTEKATVNSLIVLKKVDEKMEICDESLITIMFNISQAMSGVPFAESDEMKIFSSMKTMKKAFYKCISKFPAFMQKLYEYNYPLSGFLELNDTMNTIKALNELDIANKIPNMLQKFKTPFLNILAVGDHRNKGNTGKLLQSAITLFKKTVYSNSSTRLFLTAGFPESGDMKRVAKDLTSDWFKKKVSRGKSTAELETALKPFNQFAESMAHVFKSWNNFRDDFQTDSALLATIPDLLSQIDDYDRNVDKKKFLENFEATFRTCFKNYKNALDQGEETKFLKNFSAVYLLVRSVQAVEQWASEISTMFDEKAMDVYFEELEKLTPSNIKEQVEKITNFDDFLKIINKFTMLKSLQTQYESAYKTSNSSELSLSKIITDAGLVDTSKCLEKDKLDSSKLLKMLQFMQHMMQLDIDYSTLKANLDNFFELKKKMLETEKLVKGFTSRSARAASNSGSPVLKIKDSQKHADHLGNGLLAIKKMIISLKEKATILKSTMFNAKANQEIREKNPIDYIKEFWTNPGPSIEKLVSDLEKLEQSSKSYRKADLLTIRKVFEDGSKIVGIPEVFSYIDSQFEKKGSQYSNERKITQALSTLDLNFASHKGALSAASLSVDNLKLYFDDLFGLTPKVSVQSESTSPIVVVLICVAIVLVLVILAIVGYGFTSNGRNQYINLYLYYFGKTSDYEKRWRYSLFMDRVDGKNVLIDSVREINATNLLKAVKRGAYINVCNKYGNTALHVATRRGYQNLVEILIKHGADRSFLNPQNKTAEQMIPVNYQETHKEKIERFKSIESIYNKYRKKKFKLCVPEKFPVSSFHIYIEDRTDDNVTNEFTTKFQSITSDEAMITTTHVVVKTTEDGILETDDLNLLIWIFHGSIIVRDTWMVDCLRDEKLIEKDCDYLVEKVKYKGIIYDTVTQWSNAMAKATTPFLYGVHVALCMKNCPYLASLTAIIQGQGGTMLDKFPDKDAFNKGSHPYLHKNLGPIFLLHDGTGDLDLYRSDPDKMFTLFTEQQFMDLLFKREINKDTNPKIIPVLVDEED SW:ID YPT4_CAEEL SW:DE RecName: Full=Ankyrin repeat-containing protein F37A4.4; SW:GN ORFNames=F37A4.4; SW:KW ANK repeat; Complete proteome; Repeat. SW:EXACT T SW:FUNC + BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 1->1163|YPT4_CAEEL|0.0|100.0|1163/1163| TM:NTM 3 TM:REGION 1->20| TM:REGION 42->64| TM:REGION 763->785| SEG 511->528|skclekdkldsskllkml| SEG 553->566|elkkkmleteklvk| SEG 570->577|srsaraas| SEG 764->783|ivvvlicvaivlvlvilaiv| BL:PDB:NREP 2 BL:PDB:REP 823->950|2qyjA|1e-07|32.2|115/154| BL:PDB:REP 952->1018|1l0bA|6e-04|27.3|66/190| RP:PDB:NREP 2 RP:PDB:REP 844->893|2b0oH|4e-12|28.0|50/262| RP:PDB:REP 894->1029|3cojX|4e-10|13.6|125/208| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 29->96|PF02206|3e-10|41.2|68/70|WSN| HM:PFM:NREP 4 HM:PFM:REP 27->94|PF02206|3.2e-25|47.1|68/69|WSN| HM:PFM:REP 935->1012|PF00533|9.5e-09|30.0|70/78|BRCT| HM:PFM:REP 856->883|PF00023|8.6e-10|42.9|28/33|Ank| HM:PFM:REP 87->155|PF06152|0.00033|23.2|69/361|Phage_min_cap2| RP:SCP:NREP 3 RP:SCP:REP 27->156|1fiyA|4e-04|16.7|126/874|c.1.12.3| RP:SCP:REP 811->893|1iknD|4e-12|14.5|83/215|d.211.1.1| RP:SCP:REP 892->1028|1wf6A|1e-07|9.8|123/132|c.15.1.5| HM:SCP:REP 844->910|1ot8A_|2.4e-11|31.3|67/0|d.211.1.1|1/1|Ankyrin repeat| HM:SCP:REP 937->1047|1jnxX1|1.8e-24|33.9|109/109|c.15.1.3|1/1|BRCT domain| OP:NHOMO 29 OP:NHOMOORG 2 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AJ-------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 247 STR:RPRED 21.2 SQ:SECSTR ##################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################ccTTcccHHHHHHHTTcHHHHHHHHHTTccTTcccTTcccHHHHHTccGGGHHHHHHHHHcccTTcccTTcccHHHHHHHTTcHHHHHHHHHTTccTTcccTTcccHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHcEETTEEHHHHHHTcTTHHHHHHHHHHHccHHHHHHTTcEEEccGGGccccTTcEEEEEEcccHHHGGGccccccGGGTccccEEETHHHHHHHHHTcccccGTGGccccccccc################################################################################################################################## DISOP:02AL 95-107, 260-270, 274-282, 554-591, 638-643, 661-670, 697-711, 929-934, 1159-1163| PSIPRED cHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHccccccHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEccccccHHHHHHHHHHccHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEcccccccccEEEEcHHHHHHHHHHHHcccccccHHHcccccEEEEHHccHHccHHHHHcccEEEccccccHHHHHHHHccHHHHHHHHHccccccccccccccHHHHHHHcccHHHHHHHHHccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccEEEEEEccccccccHHHHHHHHHHHcccEEEEHHHHHHHHcccccccccccEEEEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHccccccccccEEEEEEcccccHHHHHHHHHHcccEEEcccccccccccccccccHHccccEEEEcccHHHHHHHHccccccEEEccHHHHHHHHHHccccccccccccEEEEcccc //