Caenorhabditis elegans (nematode) (cele0)
Gene : F47G9.4
DDBJ : Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
Swiss-Prot:RN207_CAEEL RecName: Full=Probable RING finger protein 207 homolog;
Homologs Archaea 0/68 : Bacteria 0/915 : Eukaryota 42/199 : Viruses 0/175 --->[See Alignment]
d.104.1
g.43.1
g.44.1
:822 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:BLT:PDB 5->32 2csyA PDBj 6e-04 35.7 %
:BLT:PDB 86->149 2junA PDBj 3e-04 28.1 %
:RPS:PDB 3->31 2cmzA PDBj 2e-04 10.3 %
:RPS:PDB 119->172 2egmA PDBj 1e-04 25.0 %
:RPS:SCOP 2->31 1borA g.44.1.1 * 4e-05 43.3 %
:RPS:SCOP 126->172 2didA1 g.43.1.1 * 3e-04 29.7 %
:RPS:SCOP 598->642 1vqzA2 d.104.1.3 * 2e-04 24.4 %
:HMM:SCOP 1->63 1chcA_ g.44.1.1 * 3.6e-06 27.0 %
:HMM:PFM 69->114 PF00643 * zf-B_box 1.9e-09 32.5 40/42
:HMM:PFM 126->159 PF00643 * zf-B_box 5.4e-06 34.5 29/42
:HMM:PFM 386->553 PF03915 * AIP3 3.7e-06 19.8 167/422
:HMM:PFM 188->322 PF07693 * KAP_NTPase 0.00076 24.2 124/325
:BLT:SWISS 1->822 RN207_CAEEL 0.0 100.0 %
:SEG
SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links DAD WormBase Abbreviations Back to title page
GT:ID CAA98481.2
GT:GENE F47G9.4
GT:PRODUCT Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
GT:ORG cele0
GT:DATABASE WS208
WP:CE CE43062
WP:PRODUCT Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
WP:LOCUS WBGene00009831
GB:PROTEIN_ID CAA98481.2
LENGTH 822
SQ:AASEQ MEENPLQCTICKNEFEEPILLSCQHTTCRKCSTGSPSCKSCSPIPSTSRSHTPHPDKLAAFLLDASKEEMEECANCEQISLPMFYCETCQQSLCLVCRNVTHQARMFSSHKIISSDERSKVYSSSLCKDHNEPYILYCSDVRKLVCIQCFNGRPLEERHSFISIEQGHRLCLERIEQSAAKLRFYQSERQEELNVRQRVLDENASNFDDARASLYQLCQQIIDTVMTTRETLAKELVKQQEQSDEQCKRQIKEIEAVMGPVRLCLFSAQILCTTASKLDVLQLCPQLQKRIGVLLDKTIDKLPVSSTPDSIEVRSDLAKALEPFLGMSAAWCPISVSREGSSSNSYKRGSGSHKAISMLSKFQATIDLAGAFGELFGKVEHPLRQLVTALSSTSQQVLETQRDLTIRRCIIEKEDVEKLVKTCKKIEAGLGMHSAALDGMQSEMQEIWQEQLDRVRRQQIIYREKVEEILNLRETARQILTAAKQLVPYVSCILNMNAMIDPKRCHPPDPAPMESICLEITGIEPNSQNRILAIEKEEENRRLNQEAKKKEELAGQSAVMKTLKHGKIKRKEMNRMMLNTNRERSPGGTDTALTSPCIRRLTTALKEETASELDAEEFLDEIFELSGEQYDEVVDGTLTEEDRCSSALLLSMEISSDSISPLPSLEQLLGRIPLASRVTSNIGFSRGAMLQSLNDVFALQKPPTPENISVSEERNVLASAVRNAEKRKSGAGLPTNSDKDEVIEKEEIEKETEKEKKKVIRRRVKKVSEPSEEEVTTFTFNAPPDCPFVPQEIFESDEKLGTFEAKERVLQSLKQKMNQKTE
SW:ID RN207_CAEEL
SW:DE RecName: Full=Probable RING finger protein 207 homolog;
SW:GN ORFNames=F47G9.4;
SW:KW Coiled coil; Complete proteome; Metal-binding; Repeat; Zinc;Zinc-finger.
SW:EXACT T
SW:FUNC +
BL:SWS:NREP 1
BL:SWS:REP 1->822|RN207_CAEEL|0.0|100.0|822/822|
GO:SWS:NREP 1
GO:SWS GO:0046872|"GO:metal ion binding"|Metal-binding|
SEG 35->48|spsckscspipsts|
SEG 340->352|gsssnsykrgsgs|
SEG 653->666|eissdsisplpsle|
SEG 741->780|eviekeeieketekekkkvirrrvkkvsepseeevttftf|
BL:PDB:NREP 2
BL:PDB:REP 5->32|2csyA|6e-04|35.7|28/81|
BL:PDB:REP 86->149|2junA|3e-04|28.1|64/101|
RP:PDB:NREP 2
RP:PDB:REP 3->31|2cmzA|2e-04|10.3|29/409|
RP:PDB:REP 119->172|2egmA|1e-04|25.0|44/57|
HM:PFM:NREP 4
HM:PFM:REP 69->114|PF00643|1.9e-09|32.5|40/42|zf-B_box|
HM:PFM:REP 126->159|PF00643|5.4e-06|34.5|29/42|zf-B_box|
HM:PFM:REP 386->553|PF03915|3.7e-06|19.8|167/422|AIP3|
HM:PFM:REP 188->322|PF07693|0.00076|24.2|124/325|KAP_NTPase|
RP:SCP:NREP 3
RP:SCP:REP 2->31|1borA|4e-05|43.3|30/56|g.44.1.1|
RP:SCP:REP 126->172|2didA1|3e-04|29.7|37/40|g.43.1.1|
RP:SCP:REP 598->642|1vqzA2|2e-04|24.4|45/241|d.104.1.3|
HM:SCP:REP 1->63|1chcA_|3.6e-06|27.0|63/0|g.44.1.1|1/1|RING/U-box|
OP:NHOMO 68
OP:NHOMOORG 42
OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------1--82121811---1--11-11141-111-1-121121-11--1--112112-----32-1--111-------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
STR:NPRED 117
STR:RPRED 14.2
SQ:SECSTR #cTTccccGGGGcTTTccccEEEEEEEEEEcH#####################################################ETTTTEEEcHHHHHHHcccccccccccccccccccccTTcccTTTcccccEEETTTTEEEcHHHHHTT#HcHHHcEEEHHHcccEEc##########################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################
PSIPRED ccHHHcccHHHHHHccccEEEccHHHHHHHcccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHccccccHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEcccHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccHHHHccHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEEEccccccHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHccccccccHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccccccHHcccccHHHcccccccHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHccccccccccccEEEEEEEEccccccccccHHHHHHcccHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccEEEEcccccccccccHHHHHcHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHccc
//
[GTOP]
