[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Caenorhabditis elegans (nematode) (cele0)
Gene : T05E7.3
DDBJ      :             haemoglobinase like
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  80/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
:997 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   415->566 3eweB PDBj 2e-04 24.2 %
:RPS:PFM   18->929 PF10266 * Strumpellin 1e-84 30.5 %
:HMM:PFM   17->964 PF10266 * Strumpellin 2.9e-264 31.8 937/1081  
:BLT:SWISS 9->711 STRUM_DICDI 2e-58 27.6 %
:PROS 817->834|PS00214|FABP
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links DAD WormBase Abbreviations Back to title page
GT:ID AAB54215.1 GT:GENE T05E7.3 GT:PRODUCT haemoglobinase like GT:ORG cele0 GT:DATABASE WS208 WP:CE CE13235 WP:PRODUCT haemoglobinase like WP:LOCUS WBGene00020259 GB:PROTEIN_ID AAB54215.1 LENGTH 997 SQ:AASEQ MTEEINIFLSKLILHGESILAEIFRLSSFIPKDFRDPTKSSKFKNIVQLDFKYLSKVDQIEKELESHLRLQTQFYSTFEPVLIAFEQLFSSISEFVQSFISYTKEAEIINGETRMDVNRTSELEAYCLYISGILIIYMDTYIPAPIRERIYIAIYRKSDVRENAEFLVDFLKATVPGNDSMIRRIPLPESFITSTINAIEIIEGTSLQIPKAQLMYVALQFDRQTLTNDSAIMTKIANSIYRETWVINLGFGVIANVFDGWYNFKSAWNAINSTITQQDAQRIMEKHLKMMNETSFPQVINEMIDFEQNLKKISMCNRSLKWLFLHSKISQKTSRPLNKYRLPSDDQLFQWLLHVSRCEILLLNLYTTTLENRDVEGTERKQNIRTLLHQLAEFFEHGFVKMGESQKTNFVKWVRNLSETVEKIDLNDTTESVETIQQIIRRVKQVGDQLGLSINLTLKDCLSTLDTDLRALMSVLSLSDSMIPEVYSKMESTYLWPLISQLIPRIQQNLVSTSNTDVVRQIFTKLSISCYMLKLKLSNFSDKDHVASRIANTYSYALEKNLKTVLQSVPQHLFGIMYNVIMPGLGKTFEPYIEKTELRELSEFVTNSRLVETTSLIANTSMGISRMMLTRVGTIEINPKELLEEGMIRQLYKEIKKMIGTTSATSSIENLLKMCDNIETMRCSFLYLCDYMNLDGEHVWSVAMDDFFSRISEERAFARSSGELEKNYIAELFIKITNPKASRFSESSLSWKDVKMSKTVLSFDVFDRIEKIVPFHILTSIETHITVELEKMLIEYISNARKIGVSFNLQNSVTHESAFQFFTGPNYERLVKSIQPQSAALAAILAQIGQYLIILRTICNAKQLANRHKEDSIQRDLIEMSISMARDPTDLPTEMGTILKLMMQYSLYDPERMIFRLKDEPSPLFIIALVQCLLPKIGDPYFVCPKQLEVGIRFVLRQSRLLPYFLPIIREQLPQSSRPKKRVSDVDRFLRHLISNL BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 9->711|STRUM_DICDI|2e-58|27.6|686/1164| PROS 817->834|PS00214|FABP|PDOC00188| SEG 361->370|lllnlytttl| SEG 834->855|iqpqsaalaailaqigqyliil| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 415->566|3eweB|2e-04|24.2|149/395| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 18->929|PF10266|1e-84|30.5|898/1065|Strumpellin| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 17->964|PF10266|2.9e-264|31.8|937/1081|Strumpellin| OP:NHOMO 94 OP:NHOMOORG 80 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----111-111------------------------------------------------------------------------------------------------1-1212112111-1111221112411122111-1-11111111111111111--21111-1112-121-----111-1111---1-111111 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 149 STR:RPRED 14.9 SQ:SECSTR ##############################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################HHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTcccHHHHTTcccHHHHHHHHHHHHT###TcHHHHHHHHTTccccHHHHHHHHHHHTTcccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHH############################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################### DISOP:02AL 1-2, 376-382, 975-981| PSIPRED cccHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHccHHHcccccccHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHcccccHHHHHcccccHHHHHccHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHcccHHHHHHHHHHcccccEEEEEccEEEEHHHHHHcHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHccccccEEEEccccHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHcccHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHccccccccEEccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHc //