Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 (hlac0)
Chromosome : 1
Gene : ACM55624.1
DDBJ : valyl-tRNA synthetase
Swiss-Prot:
Homologs Archaea 68/68 : Bacteria 911/915 : Eukaryota 197/199 : Viruses 0/175 --->[See Alignment]
a.27.1
b.51.1
c.122.1
c.26.1
















:892 amino acids




















































































































:SECSTR
































































































































:PSIPRED


:BLT:PDB 6->749 1gaxA PDBj 1e-91 34.0 %


:RPS:PDB 5->806 2bteA PDBj 1e-74 18.8 %


:RPS:SCOP 6->199 1ileA3 c.26.1.1 * 1e-28 22.8 %


:RPS:SCOP 196->346 1gaxA2 b.51.1.1 * 5e-37 31.9 %


:RPS:SCOP 361->590 1li5A2 c.26.1.1 * 3e-11 10.4 %


:RPS:SCOP 597->809 1gaxA5 a.27.1.1 * 4e-22 26.3 %


:RPS:SCOP 790->874 1nxuA c.122.1.1 * 4e-04 17.3 %


:HMM:SCOP 5->594 1ffyA3 c.26.1.1 * 4.4e-106 34.2 %


:HMM:SCOP 595->833 1ivsA2 a.27.1.1 * 4.4e-38 31.4 %


:RPS:PFM 14->580 PF00133 * tRNA-synt_1 e-100 38.4 %


:RPS:PFM 637->771 PF08264 * Anticodon_1 9e-07 28.7 %


:HMM:PFM 15->581 PF00133 * tRNA-synt_1 1.6e-128 34.0 553/601


:HMM:PFM 626->778 PF08264 * Anticodon_1 1.2e-33 37.6 141/152


:BLT:SWISS 4->889 SYV_HALMA 0.0 65.7 %


:PROS 46->57|PS00178|AA_TRNA_LIGASE_I








:SEG
SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID ACM55624.1
GT:GENE ACM55624.1
GT:PRODUCT valyl-tRNA synthetase
GT:DATABASE GIB00862CH01
GT:ORG hlac0
GB:ACCESSION GIB00862CH01
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GB:LOCATION 15448..18126
GB:FROM 15448
GB:TO 18126
GB:DIRECTION +
GB:PRODUCT valyl-tRNA synthetase
GB:NOTE TIGRFAM: valyl-tRNA synthetase; KEGG: hwa:HQ1051A valyl-tRNA synthetase
GB:PROTEIN_ID ACM55624.1
GB:DB_XREF GI:222451359 InterPro:IPR001412 InterPro:IPR002300 InterPro:IPR002303 InterPro:IPR013155 InterPro:IPR015413
LENGTH 892
SQ:AASEQ MPSGEYDPDTVEPRWQRRWVDEETYAYPDDDPVDPNTVFSIDTPPPTVSGSLHMGHLYGFTLQDFVARFERMNGGETFFPFGYDDNGIASERLTEDELDIRHQDFERREFQAKCREVCAEYEAQFTENVQSLGVSVDWDHTYQTIEPRVQRISQLSFLDLYDQGREYREKAPAIWCPECETAISQVETEDDEQASHFHDIAFPVVGGDATDDGAEEFVISTTRPELLPACVAVFVHPDDDENQNLVGESAEVPLFGHEVPIIADERVDMETGSGIVMCCTFGDQNDIEWYQVHDLNLRVAIDESGHMTDVAEGYEGMHADEAREAIVEDLDGAGALLDRRDITHTVNVHERCGTSVEFLVTEQWYVEMLDKTDEYLEIGREMEWSPEKMFTRYEHWVEGLQWDWLISRQRSSGIPFPVWYCEDCGEIVVAEKADLPVDPLSDDPPVDACPECGHDEFEPEDDVLDTWATSSLTPLINAGWDWDEDAGEFTMEHPELYQFDLRPQGHDIISFWLFHTLVKCYEHTGEVPFEETMINGHVLDENREKMSKSVGNVVEPEAVLAEFPVDATRYWAAGTAVGDDFPFKEKDLRAGEKLIRKLWNASKLVESLAPEPYPDTPADEDLRELDRWLLAELDDRIERLTGLFEDRAFSKARDELRSFFWNTFCDDYLEIVKQREDDAAAYTLRTAHRRFLKLFAPLLAHVTEELWHDMYADGASDPDAVDAAVADGARDSIHLADWPEPLGLEADHEAGAAATAVVGALRKYKSKNQLPLNAELDAVEVYADVRGFEEDITGVMHVADLTVHPDEDAPVETVITGIDLDYATVGPKYGDQVGDIEAALAKEEYEIDGEELHVTGVTLVEEEFAIEEERQYQGDGELLEADDVVVIVRNEA
GT:EXON 1|1-892:0|
BL:SWS:NREP 1
BL:SWS:REP 4->889|SYV_HALMA|0.0|65.7|863/901|
PROS 46->57|PS00178|AA_TRNA_LIGASE_I|PDOC00161|
SEG 434->447|dlpvdplsddppvd|
SEG 618->636|adedlreldrwllaelddr|
SEG 712->732|adgasdpdavdaavadgards|
SEG 750->760|agaaatavvga|
BL:PDB:NREP 1
BL:PDB:REP 6->749|1gaxA|1e-91|34.0|692/862|
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RP:PFM:NREP 2
RP:PFM:REP 14->580|PF00133|e-100|38.4|552/593|tRNA-synt_1|
RP:PFM:REP 637->771|PF08264|9e-07|28.7|122/153|Anticodon_1|
HM:PFM:NREP 2
HM:PFM:REP 15->581|PF00133|1.6e-128|34.0|553/601|tRNA-synt_1|
HM:PFM:REP 626->778|PF08264|1.2e-33|37.6|141/152|Anticodon_1|
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RP:SCP:NREP 5
RP:SCP:REP 6->199|1ileA3|1e-28|22.8|193/452|c.26.1.1|
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HM:SCP:REP 5->594|1ffyA3|4.4e-106|34.2|421/451|c.26.1.1|1/1|Nucleotidylyl transferase|
HM:SCP:REP 595->833|1ivsA2|4.4e-38|31.4|210/218|a.27.1.1|1/1|Anticodon-binding domain of a subclass of class I aminoacyl-tRNA synthetases|
OP:NHOMO 3860
OP:NHOMOORG 1176
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v*62756444494583554436116543446FF55583846B95455355p5555556A94555575855 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
STR:NPRED 796
STR:RPRED 89.2
SQ:SECSTR EEcccccHHHHHHHHHHHHcHHHTcccccccccTTcEEEGEEEccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcEEEcccccccccHHHHHHHHHEccTTTTTHHHHHTTccHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTccccGGGcccTTcHHHHHHHHHHHHHHHHTTcEEEEEEEEEEETTTTEEEcGGGcTTcEEEEEEEEEcGGGGHHHEccccccEEEEEEccGGGGGGccEEEEcTTcTcccEEEEEEEEcTTTccEEEEEEcTTccTTcTTcEEEEcGGGcHHHHHHHHHTTccccccEcccccEEcccGGGTTccHHHHHHHHHHHHHHHTcEEEEEEccccccccEEccccccHHcccEEEETTTEEEcTTccccccccccHHHHccccccGGGGcHHHHHEEEccccccEETTTHHHHTTcTTcccccccHHHHHHHccccEEEEcGGGHHHHHHHHTTcccccccccccEEcccEEEcEEEEEEEEETTccHHEEEccHHHHHHHcccccEEEHHHHHHTTcEEEEcTTccEEEEEcccccTTTTccccHHHHHHHccHHHHHHHHccccTTccEEEcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHcHTcccccccTTccTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTcHHHHHHHHHTTH##########TTTTcTHccccGGGTcccccccccHHHHccccEEEEEEETTEEEEEEEEcccccHHHHHHHHTTccccHHHHHcccccEEEEETT######################################################################################
PSIPRED cccccccHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccEEEEEEccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEcccccccccccHHHHHHHHHccccHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEccccEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEcccEEEEccccccccccHHHHHHccccccEEEEEEEEEccccccccccEEEEEEccccHHHHcEEEEEcccccHHHcccccEEEEccccccccEEEccEEcccccccEEEEcccccHHHHHHHHHccccccccccccccccccccHHcccEEEcccHHHHHHHHHcccEEEcccccccccEEcccccEEEEEEccHHHccHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEcccccEEEEEEEEccccEEEEccccccccHHHHccccccccccccHHHccccccEEEEEHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHccccEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHEEEccEEEcccccEEEccccccccHHHHHHHcccHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccEEccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccEEEEEEEcccccccHHEEcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHcccEEcccEEEEcccEEEEEEccccccHHHcccccEEEEEcccc
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