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Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 (hlac0)
Chromosome : 1
Gene : ACM55624.1
DDBJ      :             valyl-tRNA synthetase
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  68/68 : Bacteria  911/915 : Eukaryota  197/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.27.1b.51.1c.122.1c.26.1
:892 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:BLT:PDB   6->749 1gaxA PDBj 1e-91 34.0 %
:RPS:PDB   5->806 2bteA PDBj 1e-74 18.8 %
:RPS:SCOP  6->199 1ileA3  c.26.1.1 * 1e-28 22.8 %
:RPS:SCOP  196->346 1gaxA2  b.51.1.1 * 5e-37 31.9 %
:RPS:SCOP  361->590 1li5A2  c.26.1.1 * 3e-11 10.4 %
:RPS:SCOP  597->809 1gaxA5  a.27.1.1 * 4e-22 26.3 %
:RPS:SCOP  790->874 1nxuA  c.122.1.1 * 4e-04 17.3 %
:HMM:SCOP  5->594 1ffyA3 c.26.1.1 * 4.4e-106 34.2 %
:HMM:SCOP  595->833 1ivsA2 a.27.1.1 * 4.4e-38 31.4 %
:RPS:PFM   14->580 PF00133 * tRNA-synt_1 e-100 38.4 %
:RPS:PFM   637->771 PF08264 * Anticodon_1 9e-07 28.7 %
:HMM:PFM   15->581 PF00133 * tRNA-synt_1 1.6e-128 34.0 553/601  
:HMM:PFM   626->778 PF08264 * Anticodon_1 1.2e-33 37.6 141/152  
:BLT:SWISS 4->889 SYV_HALMA 0.0 65.7 %
:PROS 46->57|PS00178|AA_TRNA_LIGASE_I
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID ACM55624.1 GT:GENE ACM55624.1 GT:PRODUCT valyl-tRNA synthetase GT:DATABASE GIB00862CH01 GT:ORG hlac0 GB:ACCESSION GIB00862CH01 GB:CHROMOSOME 1 GB:LOCATION 15448..18126 GB:FROM 15448 GB:TO 18126 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT valyl-tRNA synthetase GB:NOTE TIGRFAM: valyl-tRNA synthetase; KEGG: hwa:HQ1051A valyl-tRNA synthetase GB:PROTEIN_ID ACM55624.1 GB:DB_XREF GI:222451359 InterPro:IPR001412 InterPro:IPR002300 InterPro:IPR002303 InterPro:IPR013155 InterPro:IPR015413 LENGTH 892 SQ:AASEQ 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3333322222222222222-22222222222222222222333233232333232333333333222222322222223333333333223322222113322223323233333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333233344444444344444433333344433334333333334333333333343333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333343333333333333333333333333334333333434343343333333332333343333333333333333333333333333133333333333343333334433333333333333322333333333333334333333333333223323333333333333333333333333333333445543333555533333333333334333333333333233333333333333333333333333333333333333333333333353333334333333333333333333333333333333333333333333333333333333-3333333233333332322222222222-22222222222222222222222233222222222222222223222223223333333333333333333333333333334333333332333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333332333333233333323333333333-33433323333333333333333333333333 3322554-62222232343444534453354244443444344434533442422326343344344313444334414443343355-3233323333332355424A6558576A244235475483v*62756444494583554436116543446FF55583846B95455355p5555556A94555575855 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 796 STR:RPRED 89.2 SQ:SECSTR 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cccccccHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccEEEEEEccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEcccccccccccHHHHHHHHHccccHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEccccEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEcccEEEEccccccccccHHHHHHccccccEEEEEEEEEccccccccccEEEEEEccccHHHHcEEEEEcccccHHHcccccEEEEccccccccEEEccEEcccccccEEEEcccccHHHHHHHHHccccccccccccccccccccHHcccEEEcccHHHHHHHHHcccEEEcccccccccEEcccccEEEEEEccHHHccHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEcccccEEEEEEEEccccEEEEccccccccHHHHccccccccccccHHHccccccEEEEEHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHccccEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHEEEccEEEcccccEEEccccccccHHHHHHHcccHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccEEccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccEEEEEEEcccccccHHEEcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHcccEEcccEEEEcccEEEEEEccccccHHHcccccEEEEEcccc //