Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 (hlac0)
Chromosome : 1
Gene : ACM55624.1
DDBJ : valyl-tRNA synthetase
Swiss-Prot:
Homologs Archaea 68/68 : Bacteria 911/915 : Eukaryota 197/199 : Viruses 0/175 --->[See Alignment]
a.27.1
b.51.1
c.122.1
c.26.1
:892 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:BLT:PDB 6->749 1gaxA PDBj 1e-91 34.0 %
:RPS:PDB 5->806 2bteA PDBj 1e-74 18.8 %
:RPS:SCOP 6->199 1ileA3 c.26.1.1 * 1e-28 22.8 %
:RPS:SCOP 196->346 1gaxA2 b.51.1.1 * 5e-37 31.9 %
:RPS:SCOP 361->590 1li5A2 c.26.1.1 * 3e-11 10.4 %
:RPS:SCOP 597->809 1gaxA5 a.27.1.1 * 4e-22 26.3 %
:RPS:SCOP 790->874 1nxuA c.122.1.1 * 4e-04 17.3 %
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:HMM:SCOP 595->833 1ivsA2 a.27.1.1 * 4.4e-38 31.4 %
:RPS:PFM 14->580 PF00133 * tRNA-synt_1 e-100 38.4 %
:RPS:PFM 637->771 PF08264 * Anticodon_1 9e-07 28.7 %
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:SEG
SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID ACM55624.1
GT:GENE ACM55624.1
GT:PRODUCT valyl-tRNA synthetase
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GB:TO 18126
GB:DIRECTION +
GB:PRODUCT valyl-tRNA synthetase
GB:NOTE TIGRFAM: valyl-tRNA synthetase; KEGG: hwa:HQ1051A valyl-tRNA synthetase
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LENGTH 892
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GT:EXON 1|1-892:0|
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PROS 46->57|PS00178|AA_TRNA_LIGASE_I|PDOC00161|
SEG 434->447|dlpvdplsddppvd|
SEG 618->636|adedlreldrwllaelddr|
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SEG 750->760|agaaatavvga|
BL:PDB:NREP 1
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RP:PFM:NREP 2
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HM:PFM:NREP 2
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HM:PFM:REP 626->778|PF08264|1.2e-33|37.6|141/152|Anticodon_1|
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RP:SCP:NREP 5
RP:SCP:REP 6->199|1ileA3|1e-28|22.8|193/452|c.26.1.1|
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HM:SCP:REP 5->594|1ffyA3|4.4e-106|34.2|421/451|c.26.1.1|1/1|Nucleotidylyl transferase|
HM:SCP:REP 595->833|1ivsA2|4.4e-38|31.4|210/218|a.27.1.1|1/1|Anticodon-binding domain of a subclass of class I aminoacyl-tRNA synthetases|
OP:NHOMO 3860
OP:NHOMOORG 1176
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PSIPRED cccccccHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccEEEEEEccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEcccccccccccHHHHHHHHHccccHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEccccEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEcccEEEEccccccccccHHHHHHccccccEEEEEEEEEccccccccccEEEEEEccccHHHHcEEEEEcccccHHHcccccEEEEccccccccEEEccEEcccccccEEEEcccccHHHHHHHHHccccccccccccccccccccHHcccEEEcccHHHHHHHHHcccEEEcccccccccEEcccccEEEEEEccHHHccHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEcccccEEEEEEEEccccEEEEccccccccHHHHccccccccccccHHHccccccEEEEEHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHccccEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHEEEccEEEcccccEEEccccccccHHHHHHHcccHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccEEccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccEEEEEEEcccccccHHEEcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHcccEEcccEEEEcccEEEEEEccccccHHHcccccEEEEEcccc
//
[GTOP]
