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Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 (hlac0)
Chromosome : 1
Gene : ACM55755.1
DDBJ      :             DNA polymerase II, large subunit DP2
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  45/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
b.86.1g.41.9
:1366 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   688->719 2apoB PDBj 3e-06 31.2 %
:RPS:PDB   690->737 3egdB PDBj 5e-04 20.5 %
:RPS:PDB   941->1059 2cw8A PDBj 2e-19 23.5 %
:RPS:SCOP  689->721 1i3qL  g.41.9.2 * 6e-05 21.2 %
:RPS:SCOP  939->1111 1dq3A1  b.86.1.2 * 2e-15 20.3 %
:HMM:SCOP  939->1118 1dq3A1 b.86.1.2 * 6.7e-26 28.6 %
:RPS:PFM   7->938 PF03833 * PolC_DP2 0.0 62.8 %
:RPS:PFM   993->1114 PF07591 * DUF1557 2e-04 40.4 %
:RPS:PFM   1161->1245 PF10154 * DUF2362 5e-04 34.2 %
:HMM:PFM   6->938 PF03833 * PolC_DP2 0 53.5 892/900  
:HMM:PFM   986->1065 PF01079 * Hint 6e-05 21.2 80/217  
:BLT:SWISS 1->1366 DP2L_HALMA 0.0 71.0 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID ACM55755.1 GT:GENE ACM55755.1 GT:PRODUCT DNA polymerase II, large subunit DP2 GT:DATABASE GIB00862CH01 GT:ORG hlac0 GB:ACCESSION GIB00862CH01 GB:CHROMOSOME 1 GB:LOCATION 156012..160112 GB:FROM 156012 GB:TO 160112 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT DNA polymerase II, large subunit DP2 GB:NOTE KEGG: hsl:OE4293R DNA-directed DNA polymerase type III subunit 2 (intein-containing); TIGRFAM: DNA polymerase II, large subunit DP2; PFAM: DNA polymerase II large subunit DP2-like; SMART: Hedgehog/intein hint domain protein GB:PROTEIN_ID ACM55755.1 GB:DB_XREF GI:222451490 InterPro:IPR003587 InterPro:IPR004475 InterPro:IPR006141 InterPro:IPR016033 LENGTH 1366 SQ:AASEQ MRPDDERYFAQIEDRLDEAWDVAEAAKEQGHDPKPKIEIPIARDMADRVENILGIDGVAERVRELEGEMSREEAALELVTDFVEGTVGDYDSRAGKVEGAVRTAVALLTEGVVAAPIEGIDRVELLENDDGTEFVNVYYAGPIRSAGGTAQALSVLVADYARSLLDIDEYKPRDVEVERYAEEISLYDKETGLQYSPKDKESKFIAQHMPVMLDGEATGDEEVSGFRDLERVDTNSARGGMCLVAAEGIALKAPKIQRYTRDLDEVDWPWLQDLIDGTIGKDGGGASDEAPENAGAEGDDDSEDTAGNESDGDDADDADSETDGPAGPLRPKSSQKFLRDLIAGRPVFTHPSEAGGFRLRYGRARNHGFATGGVHPATMHLVDDFLAAGTQIKTERPGKAHGVIPVDSIEGPTVRLANGEVRRIDDPEEAKEIRNGVEKVLDLGEYLVNYGEFVENNHPLAPASYVYEWWVQEFETAGADVQAMRDDPHVDLEHPDVDEALAWAREYDCPLHPEYTYLWHDVSVDAFEALADAVAAGDVVEGVLAIERTETTQHALESLLVQHVATPDALRIPTWRPLARSLGIDDGLRKTWSADDLSAAAREWDDGENAVKAINEVAPFEIRERAPTRIGNRMGRPEKSESRDLSPAVHTLFPINEAGGPQRDVAEAAGTMDDSGHRGRLDLEVSDRVCPDCGEHTYRAQCPDCGVHTDLHYECGDCGTVCEPDEAGRVECPRCEWEVTAATYQEVDLNDAYRSALETVGERESAFEILKGVQGLTSRNKTPEPIEKGVLRAKNGVTSFKDGTVRYDMTDLPVTSVRAEELDITADHLREIGYETDIDGEPLRHDDQLVELRVQDIVLSDGAAEHMLKTAGFVDDLLEQFYGLDRFYEFNERDDLVGELVFGMAPHTSAATVGRVVGFTSAAVGYAHPYFHAAKRRNCFHPETEIEYRDDAGWHRETIEKFVEERLNDPQTDDFGTLVNELDGNVEVPSIDEHGNKSTQPVTAVSKHLSQDHLVQVETQRGRSIRVTPDHTMLRVADGGVQKVAANELEIGDSVPTTTLRHEMSVGATVDVTTDGGIEADTVASVDFLESDIEHTYNLTVAETHTLAANDLLVAQCDGDEDCVMLLMDGLLNFSKTFLPDQRGGRMDAPLVMSSRIDPSEIDDEAHNVDIAREYPREFYDATLEMADPESVEDLIQIGEDTLGTDEEYHGFGHTHDTTDIAMGPDLSAYKTLGDMMEKMDAQLELARKLRAVDETDVAERVIEYHFLPDIIGNLRAFSRQKTRCLDCGEKYRRMPLSGDCRECGGRVNLTVHEGSVSKYVDTAIEVADRFGCRPYTKQRLKVLDQSLESIFEDDTNKQSGIADFM 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DISOP:02AL 1366-1367| PSIPRED ccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEEEccccccEEEEEEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHcccEEEccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHcccccccccccHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHccccccccccccccEEEEcccHHHHcccccccccccEEEEccEEEcccEEEEEccccEEEEEEcccccccEEEcccccEEEEccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHcccccccccccEEcccHHHHHHHHHHHHHcccccccEEccccccHHHHHHHHcccEEEEccEEEEEcHHHHHHHHccccccccEEcccccHHHHHHcccHHHHHHHHHHHccEEEEccccEEEEHHcccccccccccccccccEEccHHHcccccccHHHHHccccccccEEEEEEEEEEEEcccccEEccEEEccccccccccEEEcccccccccccccccEEcccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHcccEEEcccEEEEEccccccccccHHHccccHHHHHHccccccccccccccHHHHHEEEHHHEEEcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHcccccccEEEcccccccccEEcccccccEEEEEcccEEEEEEHHHHHHHHHcccccccccEEEEcccccEEEEEEcccccEEEEEEEEEEEEcccccEEEEEEccccEEEEcccccEEEEEccEEEEEEHHHcccccEEEEEEcccccccccccccccccccccccEEEEEEEEccccEEEEEEEcccccEEcccEEEcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccEEEEEEccHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEcccccccHHHHccccccHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHcccEEEEEcccccccccccccccccccccEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHcc 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