Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 (hlac0)
Chromosome : 1
Gene : ACM55755.1
DDBJ : DNA polymerase II, large subunit DP2
Swiss-Prot:
Homologs Archaea 45/68 : Bacteria 0/915 : Eukaryota 0/199 : Viruses 0/175 --->[See Alignment]
b.86.1
g.41.9
:1366 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB 688->719 2apoB PDBj 3e-06 31.2 %
:RPS:PDB 690->737 3egdB PDBj 5e-04 20.5 %
:RPS:PDB 941->1059 2cw8A PDBj 2e-19 23.5 %
:RPS:SCOP 689->721 1i3qL g.41.9.2 * 6e-05 21.2 %
:RPS:SCOP 939->1111 1dq3A1 b.86.1.2 * 2e-15 20.3 %
:HMM:SCOP 939->1118 1dq3A1 b.86.1.2 * 6.7e-26 28.6 %
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:RPS:PFM 993->1114 PF07591 * DUF1557 2e-04 40.4 %
:RPS:PFM 1161->1245 PF10154 * DUF2362 5e-04 34.2 %
:HMM:PFM 6->938 PF03833 * PolC_DP2 0 53.5 892/900
:HMM:PFM 986->1065 PF01079 * Hint 6e-05 21.2 80/217
:BLT:SWISS 1->1366 DP2L_HALMA 0.0 71.0 %
:SEG
SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID ACM55755.1
GT:GENE ACM55755.1
GT:PRODUCT DNA polymerase II, large subunit DP2
GT:DATABASE GIB00862CH01
GT:ORG hlac0
GB:ACCESSION GIB00862CH01
GB:CHROMOSOME 1
GB:LOCATION 156012..160112
GB:FROM 156012
GB:TO 160112
GB:DIRECTION +
GB:PRODUCT DNA polymerase II, large subunit DP2
GB:NOTE KEGG: hsl:OE4293R DNA-directed DNA polymerase type III subunit 2 (intein-containing); TIGRFAM: DNA polymerase II, large subunit DP2; PFAM: DNA polymerase II large subunit DP2-like; SMART: Hedgehog/intein hint domain protein
GB:PROTEIN_ID ACM55755.1
GB:DB_XREF GI:222451490 InterPro:IPR003587 InterPro:IPR004475 InterPro:IPR006141 InterPro:IPR016033
LENGTH 1366
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GT:EXON 1|1-1366:0|
BL:SWS:NREP 1
BL:SWS:REP 1->1366|DP2L_HALMA|0.0|71.0|1347/1395|
SEG 309->324|esdgddaddadsetdg|
SEG 524->545|vdafealadavaagdvvegvla|
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RP:PFM:NREP 3
RP:PFM:REP 7->938|PF03833|0.0|62.8|874/884|PolC_DP2|
RP:PFM:REP 993->1114|PF07591|2e-04|40.4|99/126|DUF1557|
RP:PFM:REP 1161->1245|PF10154|5e-04|34.2|73/494|DUF2362|
HM:PFM:NREP 2
HM:PFM:REP 6->938|PF03833|0|53.5|892/900|PolC_DP2|
HM:PFM:REP 986->1065|PF01079|6e-05|21.2|80/217|Hint|
RP:SCP:NREP 2
RP:SCP:REP 689->721|1i3qL|6e-05|21.2|33/46|g.41.9.2|
RP:SCP:REP 939->1111|1dq3A1|2e-15|20.3|153/168|b.86.1.2|
HM:SCP:REP 939->1118|1dq3A1|6.7e-26|28.6|161/169|b.86.1.2|1/1|Hedgehog/intein (Hint) domain|
OP:NHOMO 49
OP:NHOMOORG 45
OP:PATTERN -----------------------121122111111111111111111111111111111111111111 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
STR:NPRED 267
STR:RPRED 19.5
SQ:SECSTR ####################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################cccccccccccEEcTTTccEEcccccccccccccccccccccTccccccTTHHHGGGGTccc########################################################################################################################################################################cccHHHHTHHHHHTTccE#EEcTTccHHHHHHcEcTTcEEEEEETTEEEEEEHHHHHHHHTTGGGcEEETTEEEEEcccEEEEEEcTTTccEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEETTccEEEEETTcEEEEEETTEEEEEETTTccTTcEEEEEcHHHHHTccHHHHHHHcTTEEEEEEEEEE##EEEEEEEEEEEEccccEEEETTEEE############################################################################################################################################################################################################################################################
DISOP:02AL 1366-1367|
PSIPRED ccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEEEccccccEEEEEEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHcccEEEccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHcccccccccccHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHccccccccccccccEEEEcccHHHHcccccccccccEEEEccEEEcccEEEEEccccEEEEEEcccccccEEEcccccEEEEccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHcccccccccccEEcccHHHHHHHHHHHHHcccccccEEccccccHHHHHHHHcccEEEEccEEEEEcHHHHHHHHccccccccEEcccccHHHHHHcccHHHHHHHHHHHccEEEEccccEEEEHHcccccccccccccccccEEccHHHcccccccHHHHHccccccccEEEEEEEEEEEEcccccEEccEEEccccccccccEEEcccccccccccccccEEcccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHcccEEEcccEEEEEccccccccccHHHccccHHHHHHccccccccccccccHHHHHEEEHHHEEEcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHcccccccEEEcccccccccEEcccccccEEEEEcccEEEEEEHHHHHHHHHcccccccccEEEEcccccEEEEEEcccccEEEEEEEEEEEEcccccEEEEEEccccEEEEcccccEEEEEccEEEEEEHHHcccccEEEEEEcccccccccccccccccccccccEEEEEEEEccccEEEEEEEcccccEEcccEEEcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccEEEEEEccHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEcccccccHHHHccccccHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHcccEEEEEcccccccccccccccccccccEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHcc
//
[GTOP]
