[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Homo sapiens (cDNA) (huge0)
Gene : KIAA0010
DDBJ      :             KIAA0010
Swiss-Prot:UBE3C_HUMAN  RecName: Full=Ubiquitin-protein ligase E3C;         EC=6.3.2.-;

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  196/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
d.148.1
:1086 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   726->1063 1c4zA PDBj 6e-47 36.3 %
:RPS:PDB   727->1078 1c4zA PDBj 6e-71 32.6 %
:RPS:SCOP  696->1078 1nd7A  d.148.1.1 * 3e-88 31.1 %
:HMM:SCOP  703->1080 1nd7A_ d.148.1.1 * 2e-106 44.4 %
:RPS:PFM   708->786 PF09822 * ABC_transp_aux 1e-04 41.8 %
:RPS:PFM   788->1086 PF00632 * HECT 4e-72 48.4 %
:HMM:PFM   783->1086 PF00632 * HECT 3.4e-91 40.5 296/308  
:HMM:PFM   50->67 PF00612 * IQ 2.2e-06 55.6 18/21  
:BLT:SWISS 4->1086 UBE3C_HUMAN 0.0 99.9 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links HUGE Abbreviations Back to title page
GT:ID KIAA0010 GT:ORG huge0 GT:GENE KIAA0010 GT:PRODUCT KIAA0010 GT:DATABASE huge2038 LENGTH 1086 SQ:AASEQ AARMFSFEGDFKTRPKVSLGGASRKEEKASLLHRTQEERRKREEERRRLKNAIIIQSFIRGYRDRKQQYSIQRSAFDRCATLSQSGGAFPIANGPNLTLLVRQLLFFYKQNEDSKRLIWLYQNLIKHSSLFVKQLDGSERLTCLFQIKRLMSLCCRLLQNCNDDSLNVALPMRMLEVFSSENTYLPVLQDASYVVSVIEQILHYMIHNGYYRSLYLLINSKLPSSIEYSDLSRVPIAKILLENVLKPLHFTYNSCPEGARQQVFTAFTEEFLAAPFTDQIFHFIIPALADAQTVFPYEPFLNALLLIESRCSRKSGGAPWLFYFVLTVGENYLGALSEEGLLVYLRVLQTFLSQLPVSPASASCHDSASDSEEESEEADKPSSPEDGRLSVSYITEECLKKLDTKQQTNTLLNLVWRDSASEEVFTTMASVCHTLMVQHRMMVPKVRLLYSLAFNARFLRHLWFLISSMSTRMITGSMVPLLQVISRGSPMSFEDSSRIIPLFYLFSSLFSHSLISIHDNEFFGDPIEVVGQRQSSMMPFTLEELIMLSRCLRDACLGIIKLAYPETKPEVREEYITAFQSIGVTTSSEMQQCIQMEQKRWIQLFKVITNLVKMLKSRDTRRNFCPPNHWLSEQEDIKADKVTQLYVPASRHVWRFRRMGRIGPLQSTLDVGLESPPLSVSEERQLAVLTELPFVVPFEERVKIFQRLIYADKQEVQGDGPFLDGINVTIRRNYIYEDAYDKLSPENEPDLKKRIRVHLLNAHGLDEAGIDGGGIFREFLNELLKSGFNPNQGFFKTTNEGLLYPNPAAQMLVGDSFARHYYFLARMLGKALYENMLVELPFAGFFLSKLLGTSADVDIHHLASLDPEVYKNLLFLKSYEDDVEELGLNFTVVNNDLGEAQVVELKFGGKDIPVTSANRIAYIHLVADYRLNRQIRQHCLAFRQGLANVVSLEWLRMFDQQEIQVLISGAQVPISLEDLKSFTNYSGGYSADHPVIKVFWRVVEGFTDEEKRKLLKFVTSCSRPPLLGFKELYPAFCIHNGGSDLERLPTASTCMNLLKLPEFYDETLLRSKLLYAIECAAGFELS SW:ID UBE3C_HUMAN SW:DE RecName: Full=Ubiquitin-protein ligase E3C; EC=6.3.2.-; SW:GN Name=UBE3C; Synonyms=KIAA0010; SW:KW Alternative splicing; Complete proteome; Ligase; Nucleus; Proteasome;Ubl conjugation pathway. SW:EXACT F SW:FUNC + BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 4->1086|UBE3C_HUMAN|0.0|99.9|1083/1083| GO:SWS:NREP 3 GO:SWS GO:0016874|"GO:ligase activity"|Ligase| GO:SWS GO:0005634|"GO:nucleus"|Nucleus| GO:SWS GO:0000502|"GO:proteasome complex"|Proteasome| SEG 37->48|eerrkreeerrr| SEG 358->386|spasaschdsasdseeeseeadkpssped| SEG 499->517|iiplfylfsslfshslisi| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 726->1063|1c4zA|6e-47|36.3|322/350| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 727->1078|1c4zA|6e-71|32.6|341/350| RP:PFM:NREP 2 RP:PFM:REP 708->786|PF09822|1e-04|41.8|67/252|ABC_transp_aux| RP:PFM:REP 788->1086|PF00632|4e-72|48.4|287/297|HECT| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 783->1086|PF00632|3.4e-91|40.5|296/308|HECT| HM:PFM:REP 50->67|PF00612|2.2e-06|55.6|18/21|IQ| GO:PFM:NREP 3 GO:PFM GO:0005622|"GO:intracellular"|PF00632|IPR000569| GO:PFM GO:0006464|"GO:protein modification process"|PF00632|IPR000569| GO:PFM GO:0016881|"GO:acid-amino acid ligase activity"|PF00632|IPR000569| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 696->1078|1nd7A|3e-88|31.1|363/374|d.148.1.1| HM:SCP:REP 703->1080|1nd7A_|2e-106|44.4|369/0|d.148.1.1|1/1|Hect, E3 ligase catalytic domain| OP:NHOMO 2915 OP:NHOMOORG 196 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 453465H-B35266745556666666666676666566563665656666666646656555555555-5555555533555456587-46555664444674A9C2GL7XYdTdUgOLKMLQMkbGkG**YFjQ*LGMJWFLVPJPOOFZHLnIZQPOIZhFIJGDPFFU9APJ4898*76467C6DC58977TTQQF ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 370 STR:RPRED 34.1 SQ:SECSTR ####################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################HHHHHHHHHHTTccccEHcEEEccccHHHHHHHHHHHHHHccHcGGGGGccccEEETTcccccccHHHHHHHHHHHHHHTcGGGccEEEETTTTEEEEcTTcccEEcHcHHHHHHHHHHHHHHHHTTccccccccHHHHHHHTTccHHccHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHccccHHHTccccEEEEccTTccEEEEccTTTTTccccTTTHHHHHHHHHHHHHTcTTHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccTHHHHHHHHccccccccTTTcTTcEEEcccccccHHHHHHHHHHHTccHHHHHHHHHHHcccccccTTcGGGGcHHcEEEEEEEccccccEEEGGGTEEEEEEcccHHHHHHHHHHHHH######## DISOP:02AL 1-1,14-29,40-46,357-388,532-540,586-586,589-594,710-726,1085-1085| PSIPRED ccccEEEccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHccccEEEEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHEEEEEccccccHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHcccccccHHccccccHHHHHHHHHcccHHHccccccccccHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHcccHHHHHHHcccccccHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHccccccccccccccHHHHHccccHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccEEEEEcHHHHHHHHHHHHHcccHHHHccEEEEEEEEEEccccccccccccHHHHHHHHHHHHHccccccEEEcccccEEEcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHcccccEEEccccccEEEEEEccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHcccHHHHHHHHccccccccHHHHHHHcEEccccccccHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHcccccccccccccccEEEEEcccccccccccccccccEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHcccccccc //