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Homo sapiens (cDNA) (huge0)
Gene : KIAA0086
DDBJ      :             KIAA0086
Swiss-Prot:DCR1A_HUMAN  RecName: Full=DNA cross-link repair 1A protein;         Short=hSNM1A;         Short=hSNM1;

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  182/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
d.157.1
:1044 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   731->825 3bk2A PDBj 8e-06 35.9 %
:RPS:PDB   705->1019 3bk1A PDBj 5e-25 18.7 %
:RPS:SCOP  733->1042 2i7tA1  d.157.1.10 * 5e-24 18.3 %
:HMM:SCOP  711->865 1x8hA_ d.157.1.1 * 9.2e-28 28.9 %
:RPS:PFM   731->826 PF00753 * Lactamase_B 2e-05 37.2 %
:RPS:PFM   868->922 PF08732 * HIM1 3e-04 41.5 %
:RPS:PFM   922->1022 PF07522 * DRMBL 4e-19 40.6 %
:HMM:PFM   918->1023 PF07522 * DRMBL 1.1e-37 48.1 106/110  
:HMM:PFM   733->830 PF00753 * Lactamase_B 1.3e-05 24.7 97/194  
:BLT:SWISS 5->1044 DCR1A_HUMAN 0.0 99.9 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links HUGE Abbreviations Back to title page
GT:ID KIAA0086 GT:ORG huge0 GT:GENE KIAA0086 GT:PRODUCT KIAA0086 GT:DATABASE huge2038 LENGTH 1044 SQ:AASEQ NHFAMLEDISEEDIWEYKSKRKPKRVDPNNGSKNILKSVEKATDGKYQSKRSRNRKRAAEAKEVKDHEVPLGNAGCQTSVASSQNSSCGDGIQQTQDKETTPGKLCRTQKSQHVSPKIRPVYDGYCPNCQMPFSSLIGQTPRWHVFECLDSPPRSETECPDGLLCTSTIPFHYKRYTHFLLAQSRAGDHPFSSPSPASGGSFSETKSGVLCSLEERWSSYQNQTDNSVSNDPLLMTQYFKKSPSLTEASEKISTHIQTSQQALQFTDFVENDKLVGVALRLANNSEHINLPLPENDFSDCEISYSPLQSDEDTHDIDEKPDDSQEQLFFTESSKDGSLEEDDDSCGFFKKRHGPLLKDQDESCPKVNSFLTRDKYDEGLYRFNSLNDLSQPISQNNESTLPYDLACTGGDFVLFPPALAGKLAASVHQATKAKPDEPEFHSAQSNKQKQVIEESSVYNQVSLPLVKSLMLKPFESQVEGYLSSQPTQNTIRKLSSENLNAKNNTNSACFCRKALEGVPVGKATILNTENLSSTPAPKYLKILPSGLKYNARHPSTKVMKQMDIGVYFGLPPKRKEEKLLGESALEGINLNPVPSPNQKRSSQCKRKAEKSLSDLEFDASTLHESQLSVELSSERSQRQKKRCRKSNSLQEGACQKRSDHLINTESEAVNLSKVKVFTKSAHGGLQRGNKKIPESSNVGGSRKKTCPFYKKIPGTGFTVDAFQYGVVEGCTAYFLTHFHSDHYAGLSKHFTFPVYCSEITGNLLKNKLHVQEQYIHPLPLDTECIVNGVKVVLLDANHCPGAVMILFYLPNGTVILHTGDFRADPSMERSLLADQKVHMLYLDTTYCSPEYTFPSQQEVIRFAINTAFEAVTLNPHALVVCGTYSIGKEKVFLAIADVLGSKVGMSQEKYKTLQCLNIPEINSLITTDMCSSLVHLLPMMQINFKGLQSHLKKCGGKYNQILAFRPTGWTHSNKFTRIADVIPQTKGNISIYGIPYSEHSSYLEMKRFVQWLKPQKIIPTVNVGTWKSRSTMEKYFREWKLEAGY SW:ID DCR1A_HUMAN SW:DE RecName: Full=DNA cross-link repair 1A protein; Short=hSNM1A; Short=hSNM1; SW:GN Name=DCLRE1A; Synonyms=KIAA0086, SNM1, SNM1A; SW:KW Cell cycle; Cell division; Complete proteome; DNA damage; DNA repair;Mitosis; Nucleus; Phosphoprotein; Polymorphism. SW:EXACT F SW:FUNC + BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 5->1044|DCR1A_HUMAN|0.0|99.9|1040/1040| GO:SWS:NREP 6 GO:SWS GO:0007049|"GO:cell cycle"|Cell cycle| GO:SWS GO:0051301|"GO:cell division"|Cell division| GO:SWS GO:0006974|"GO:response to DNA damage stimulus"|DNA damage| GO:SWS GO:0006281|"GO:DNA repair"|DNA repair| GO:SWS GO:0007067|"GO:mitosis"|Mitosis| GO:SWS GO:0005634|"GO:nucleus"|Nucleus| SEG 190->203|pfsspspasggsfs| SEG 631->645|ssersqrqkkrcrks| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 731->825|3bk2A|8e-06|35.9|92/535| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 705->1019|3bk1A|5e-25|18.7|310/537| RP:PFM:NREP 3 RP:PFM:REP 731->826|PF00753|2e-05|37.2|94/171|Lactamase_B| RP:PFM:REP 868->922|PF08732|3e-04|41.5|53/368|HIM1| RP:PFM:REP 922->1022|PF07522|4e-19|40.6|101/108|DRMBL| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 918->1023|PF07522|1.1e-37|48.1|106/110|DRMBL| HM:PFM:REP 733->830|PF00753|1.3e-05|24.7|97/194|Lactamase_B| GO:PFM:NREP 1 GO:PFM GO:0016787|"GO:hydrolase activity"|PF00753|IPR001279| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 733->1042|2i7tA1|5e-24|18.3|300/404|d.157.1.10| HM:SCP:REP 711->865|1x8hA_|9.2e-28|28.9|152/0|d.157.1.1|1/1|Metallo-hydrolase/oxidoreductase| OP:NHOMO 403 OP:NHOMOORG 182 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 11--112-2-1-2222121122212121122122221111-112211222211122112222212111-21111211-1-1---2111-12111221111-11212-33395534442223332A63315C314342332322531321131152343221123232111-21331232D33333332826321-1111 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 341 STR:RPRED 32.7 SQ:SECSTR #########################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################cccGGGccccccTTTTccEEEEccHHHHHcGGGEEEcccccHHHHTTHHHHTcccEEEEEEEcHHHHHHHHHHHHHTTccTTcEEEETTTEEEEEEEcccccccEEEEEEETTEEEEEEccccccccccTTcccccHcccEEEEEcTcTTcccccccHHHHHHHHHHHHHTcHHccccEEEEccTTcHHHHHHHHHHHHHTTcEEEEcHHHHTccccccccccHHHHTTccGGGEEEEEccTTcccHHHTTcccccccTTcEEEccccTTcHHHHHHHHHHHHTTcEEEcTTTccccccccccHHHHHHHHHHHcccEEEEEEEEEccccHHHHHHcHHHH###### DISOP:02AL 1-2,20-68,73-116,189-196,219-229,241-267,330-367,388-407,426-455,471-563,576-609,622-702| PSIPRED ccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccHHHHHcccccHHHHHHHcccccccccccccEEEccccccHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccHHHHHcccccccHHHHcccccccHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHcccccccccccccHHHHccccccccEEEcccccccccccccccccccEEEEcccccccccccccccccccccccEEccccccHHHHHcccHHHHHHHHcccccHHHHccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHcccccccccccccEEccHHHcccccccHHHHHcccccccccccHHHHHHHccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHcccccHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEEcccccccccccccHHHHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHcccccccccccHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHcccccEEEEcccccccccccEEEEccHHHHHHHHHHHHccccEEccHHHHHHHHHHccccccEEEEcccccEEEEccEEEEEEEccccccccEEEEEEccccEEEEEccccccccccccccccccccEEEEcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEcccccHHHHHHHHHHHHccEEEEEHHHHHHHHHccccHHHccccccccccEEEEEcHHHccHHHHHHHHHHHccccccEEEEEcccccccccEEEcccccccccccEEEEEEEccccccHHHHHHHHHHHcccEEEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHHccc //