[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Homo sapiens (cDNA) (huge0)
Gene : KIAA0090
DDBJ      :             KIAA0090
Swiss-Prot:K0090_HUMAN  RecName: Full=Uncharacterized protein KIAA0090;Flags: Precursor;

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  185/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
b.69.1b.69.4b.70.1
:991 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   636->757 2cv8A PDBj 4e-14 16.8 %
:RPS:SCOP  43->163 1k8kC  b.69.4.1 * 8e-05 7.6 %
:RPS:SCOP  535->638 1gofA3  b.69.1.1 * 6e-04 6.7 %
:HMM:SCOP  27->223 1kb0A2 b.70.1.1 * 1.7e-10 18.9 %
:RPS:PFM   784->990 PF07774 * DUF1620 7e-58 56.0 %
:HMM:PFM   784->990 PF07774 * DUF1620 8.2e-69 45.4 207/217  
:HMM:PFM   54->76 PF01011 * PQQ 3.7e-05 34.8 23/38  
:HMM:PFM   137->207 PF10949 * DUF2777 0.00063 21.4 70/184  
:BLT:SWISS 1->991 K0090_HUMAN 0.0 100.0 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links HUGE Abbreviations Back to title page
GT:ID KIAA0090 GT:ORG huge0 GT:GENE KIAA0090 GT:PRODUCT KIAA0090 GT:DATABASE huge2038 LENGTH 991 SQ:AASEQ AAEWASRFWLWATLLIPAAAVYEDQVGKFDWRQQYVGKVKFASLEFSPGSKKLVVATEKNVIAALNSRTGEILWRHVDKGTAEGAVDAMLLHGQDVITVSNGGRIMRSWETNIGGLNWEITLDSGSFQALGLVGLQESVRYIAVLKKTTLALHHLSSGHLKWVEHLPESDSIHYQMVYSYGSGVVWALGVVPFSHVNIVKFNVEDGEIVQQVRVSTPWLQHLSGACGVVDEAVLVCPDPSSRSLQTLALETEWELRQIPLQSLDLEFGSGFQPRVLPTQPNPVDASRAQFFLHLSPSHYALLQYHYGTLSLLKNFPQTALVSFATTGEKTVAAVMACRNEVKSSSSEDGSMGSFSEKSSSKDSLACFNQTYTINLYLVETGRRLLDTTITFSLEQSGTRPERLYIQVFLKKDDSVGYRALVQTEDHLLLFLQQLAGKVVLWSREESLAEVVCLEMVDLPLTGAQAELEGEFGKKADGLLGMFLKRLSSQLILLQAWTSHLWKMFYDARKPRSQIKNEINIDTLARDEFNLQKMMVMVTASGKLFGIESSSGTILWKQYLPNVKPDSSFKLMVQRTTAHFPHPPQCTLLVKDKESGMSSLYVFNPIFGKWSQVAPPVLKRPILQSLLLPVMDQDYAKVLLLIDDEYKVTAFPATRNVLRQLHELAPSIFFYLVDAEQGRLCGYRLRKDLTTELSWELTIPPEVQRIVKVKGKRSSEHVHSQGRVMGDRSVLYKSLNPNLLAVVTESTDAHHERTFIGIFLIDGVTGRIIHSSVQKKAKGPVHIVHSENWVVYQYWNTKARRNEFTVLELYEGTEQYNATAFSSLDRPQLPQVLQQSYIFPSSISAMEATITERGITSRHLLIGLPSGAILSLPKALLDPRRPEIPTEQSREENLIPYSPDVQIHAERFINYNQTVSRMRGIYTAPSGLESTCLVVAYGLDIYQTRVYPSKQFDVLKDDYDYVLISSVLFGLVFATMITKRLAQVKLLNRAWR SW:ID K0090_HUMAN SW:DE RecName: Full=Uncharacterized protein KIAA0090;Flags: Precursor; SW:GN Name=KIAA0090; ORFNames=PSEC0263; SW:KW Alternative splicing; Complete proteome; Glycoprotein; Membrane;Polymorphism; Signal; Transmembrane. SW:EXACT F SW:FUNC + BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 1->991|K0090_HUMAN|0.0|100.0|991/993| GO:SWS:NREP 2 GO:SWS GO:0016020|"GO:membrane"|Membrane| GO:SWS GO:0016021|"GO:integral to membrane"|Transmembrane| TM:NTM 2 TM:REGION 6->28| TM:REGION 956->977| SEG 343->363|ssssedgsmgsfsekssskds| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 636->757|2cv8A|4e-14|16.8|119/156| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 784->990|PF07774|7e-58|56.0|207/214|DUF1620| HM:PFM:NREP 3 HM:PFM:REP 784->990|PF07774|8.2e-69|45.4|207/217|DUF1620| HM:PFM:REP 54->76|PF01011|3.7e-05|34.8|23/38|PQQ| HM:PFM:REP 137->207|PF10949|0.00063|21.4|70/184|DUF2777| RP:SCP:NREP 2 RP:SCP:REP 43->163|1k8kC|8e-05|7.6|119/354|b.69.4.1| RP:SCP:REP 535->638|1gofA3|6e-04|6.7|104/387|b.69.1.1| HM:SCP:REP 27->223|1kb0A2|1.7e-10|18.9|185/0|b.70.1.1|1/1|Quinoprotein alcohol dehydrogenase-like| OP:NHOMO 245 OP:NHOMOORG 185 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 11--111-311-111-11-1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-1111111111-11111111111-11122-12121112121111111221319F11334111111111111112113112-11-31111211121221-1-171111111221111111111 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 119 STR:RPRED 12.0 SQ:SECSTR ###########################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################EEEEccHHHHHHHHHHcccEEccccEEEEHHHHHHHHHT##TccEEEETTEEEcHHHHHHHHcTTHHHHHHHHHHHHHTTcEEEEcGGGTccEEEEcc#cccEEEEEEETTccccHHHHTTc########################################################################################################################################################################################################################################## DISOP:02AL 1-2,885-887,991-992| PSIPRED ccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccEEEEEEccccccEEEEEEcccEEEEEEcccccEEEEEEccccccccccEEEEcccEEEEEEccccEEEEEEcccccEEEEEEEccccccEEEEccccccEEEEEEEEccEEEEEEEEcccEEEEEEccccccEEEEEEEEccccEEEEEEEEccccEEEEEEEcccEEEEEEEEEEEEcccccccEEEEccccEEEEEcccccEEEEEEEccccHHHccccEEccccccccccEEEEEcccccccccccEEEEEccHHHHHHHHHHcccEEEccccccccEEEEEccccccHHHHccccccccccccccccEEEEEccccccHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEcccccccEEEEEEEEEEEEccccEEEEEEEccccEEEEEcccccEEEEEccHHHHccccccEEEccccccHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccEEcccccEEEEEEEccccEEEEEEccccEEEEEEEccccccccEEEEEEEEcccccccccccEEEEEcccccccEEEEcccccccEEEcccccccccEEEEEEcccccccccEEEEEEcccccEEEEcccHHHHHHHHHHcccEEEEEEEccccEEEEEEEccccccEEEEEEEEcccccEEEEEEcccccccccEEEEEccccEEEEEEccccEEEEEEEcccccccEEEEEEEEEEEEcEEEEEEEEEEcccccEEEEEEccEEEEEEEcccccccEEEEEEEEccccccccccccccccccccHHEEEEEEccccccEEEEEEEcccccccEEEEEcccccEEEEcHHHHcccccccccHHHHHcccccccccccccccEEEEEEEEcccccEEEEcccccccEEEEEEEEcEEEEEEEcccccEEcccccccEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccc //