Homo sapiens (cDNA) (huge0)
Gene : KIAA0562
DDBJ : KIAA0562
Swiss-Prot:K0562_HUMAN RecName: Full=Uncharacterized protein KIAA0562;
Homologs Archaea 0/68 : Bacteria 0/915 : Eukaryota 90/199 : Viruses 0/175 --->[See Alignment]
a.118.1
a.281.1
b.18.1
d.58.1
:931 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB 742->841 1du3A PDBj 2e-04 36.9 %
:RPS:PDB 200->254 1e52A PDBj 6e-04 18.9 %
:RPS:PDB 536->657 2c1mA PDBj 9e-06 9.9 %
:RPS:PDB 760->859 2b7rA PDBj 2e-04 14.4 %
:RPS:SCOP 12->123 1jhjA b.18.1.9 * 4e-05 18.9 %
:RPS:SCOP 210->301 2pihA1 a.281.1.1 * 4e-17 21.6 %
:RPS:SCOP 443->667 1u6gC a.118.1.2 * 2e-05 13.3 %
:RPS:SCOP 753->856 2fug34 d.58.1.5 * 4e-04 11.5 %
:HMM:SCOP 4->160 1tvgA_ b.18.1.9 * 1.5e-08 18.5 %
:HMM:SCOP 444->656 1b3uA_ a.118.1.2 * 7.3e-06 19.3 %
:RPS:PFM 221->284 PF04245 * NA37 6e-04 33.3 %
:RPS:PFM 452->646 PF12348 * CLASP_N 3e-07 25.8 %
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:BLT:SWISS 7->931 K0562_HUMAN 0.0 100.0 %
:SEG
SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links HUGE Abbreviations Back to title page
GT:ID KIAA0562
GT:ORG huge0
GT:GENE KIAA0562
GT:PRODUCT KIAA0562
GT:DATABASE huge2038
LENGTH 931
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SW:ID K0562_HUMAN
SW:DE RecName: Full=Uncharacterized protein KIAA0562;
SW:GN Name=KIAA0562;
SW:KW Alternative splicing; Coiled coil; Complete proteome; Phosphoprotein;Polymorphism; Repeat.
SW:EXACT F
SW:FUNC +
BL:SWS:NREP 1
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SEG 684->707|aemrarrkaateeaekqkkeeika|
BL:PDB:NREP 1
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RP:PFM:NREP 2
RP:PFM:REP 221->284|PF04245|6e-04|33.3|57/332|NA37|
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HM:PFM:NREP 3
HM:PFM:REP 453->640|PF12348|6e-06|23.3|176/227|CLASP_N|
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GO:PFM:NREP 1
GO:PFM GO:0009295|"GO:nucleoid"|PF04245|IPR007358|
RP:SCP:NREP 4
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HM:SCP:REP 4->160|1tvgA_|1.5e-08|18.5|135/0|b.18.1.9|1/1|Galactose-binding domain-like|
HM:SCP:REP 444->656|1b3uA_|7.3e-06|19.3|197/0|a.118.1.2|1/1|ARM repeat|
OP:NHOMO 153
OP:NHOMOORG 90
OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 12----1-5221112----------------------------------------------------------------------------------------212--2-2-211221111111121316911313111121112-111-111312112223211-111-13231-2118111112-------112113 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
STR:NPRED 298
STR:RPRED 32.0
SQ:SECSTR #######################################################################################################################################################################################################ccc#TTccccc#cccHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcHHHHTTHHHHHHHHHHHHH#########################################################################################################################################################################################################################################################################################HHHHHHHHTcccHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHTTcHHH#HHHHTTcTTcHHHHHHHHHHHHHHHTccTTHHHHHHHTTHHHHHHHHTTcccHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHHTTcHHcHHHHHHGG###########################################################################ccccTTcccTTEEEccccTccGGGcccTccTTccccTTcHHHHHHHHHHccHHHHHTTcccccccTTcccccccccGGGTccccccccGGGGTccccccTcc#####Tcccccccccccc######################################################################
DISOP:02AL 1-5,183-196,309-385,399-423,470-478,686-745,881-932|
PSIPRED ccccccccHHcccEEEEEccccccccHHHHHHcccccccccccccccccEEEEEEEccEEEEEEEEEEEEccccccEEEEEEccccHHHcccccHHHHHccEEEEccccccccccccccEEEEccccEEEEEEEEEccccccccccccEEEEEEEcccccccccccccccHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHccccccccccccccHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHcccHHHccccccHHHHHHHHHHHHcccccHHHHcccccccccccccccHHHHHHHcccHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHccHHHcccHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHcccccHHHccccHHHHHHHHccccccccccccHHHHccccccccccccccccccccHHHccccccccccccccccccHHHcc
//
[GTOP]
