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Homo sapiens (cDNA) (huge0)
Gene : KIAA0562
DDBJ      :             KIAA0562
Swiss-Prot:K0562_HUMAN  RecName: Full=Uncharacterized protein KIAA0562;

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  90/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.118.1a.281.1b.18.1d.58.1
:931 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   742->841 1du3A PDBj 2e-04 36.9 %
:RPS:PDB   200->254 1e52A PDBj 6e-04 18.9 %
:RPS:PDB   536->657 2c1mA PDBj 9e-06 9.9 %
:RPS:PDB   760->859 2b7rA PDBj 2e-04 14.4 %
:RPS:SCOP  12->123 1jhjA  b.18.1.9 * 4e-05 18.9 %
:RPS:SCOP  210->301 2pihA1  a.281.1.1 * 4e-17 21.6 %
:RPS:SCOP  443->667 1u6gC  a.118.1.2 * 2e-05 13.3 %
:RPS:SCOP  753->856 2fug34  d.58.1.5 * 4e-04 11.5 %
:HMM:SCOP  4->160 1tvgA_ b.18.1.9 * 1.5e-08 18.5 %
:HMM:SCOP  444->656 1b3uA_ a.118.1.2 * 7.3e-06 19.3 %
:RPS:PFM   221->284 PF04245 * NA37 6e-04 33.3 %
:RPS:PFM   452->646 PF12348 * CLASP_N 3e-07 25.8 %
:HMM:PFM   453->640 PF12348 * CLASP_N 6e-06 23.3 176/227  
:HMM:PFM   219->252 PF08112 * ATP-synt_E_2 0.00017 44.1 34/56  
:HMM:PFM   255->287 PF02151 * UVR 0.00055 27.3 33/36  
:BLT:SWISS 7->931 K0562_HUMAN 0.0 100.0 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links HUGE Abbreviations Back to title page
GT:ID KIAA0562 GT:ORG huge0 GT:GENE KIAA0562 GT:PRODUCT KIAA0562 GT:DATABASE huge2038 LENGTH 931 SQ:AASEQ AAQTCRMPHKIGFVVVSSSGHEDGFSARELMIHAPTVSGWRSPRFCQFPQEIVLQMVERCRIRKLQLLAHQYMISSKIEFYISESLPEYFAPYQAERFRRLGYVSLCDNEKTGCKARELKSVYVDAVGQFLKLIFHQNHVNKYNIYNQVALVAINIIGDPADFSDESNTASREKLIDHYLGHNSEDPALEGTYARKSDYISPLDDLAFDMYQDPEVAQIIRKLDERKREAVQKERYDYAKKLKQAIADLQKVGERLGRYEVEKRCAVEKEDYDLAKEKKQQMEQYRAEVYEQLELHSLLDAELMRRPFDLPLQPLARSGSPCHQKPMPSLPQLEERGTENQFAEPFLQEKPSSYSLTISPQHSAVDPLLPATDPHPKINAESLPYDERPLPAIRKHYGEAVVEPEMSNADISDARRGGMLGEPEPLTEKALREASSAIDVLGETLVAEAYCKTWSYREDALLALSKKLMEMPVGTPKEDLKNTLRASVFLVRRAIKDIVTSVFQASLKLLKMIITQYIPKHKLSKLETAHCVERTIPVLLTRTGDSSARLRVTAANFIQEMALFKEVKSLQIIPSYLVQPLKANSSVHLAMSQMGLLARLLKDLGTGSSGFTIDNVMKFSVSALEHRVYEVRETAVRIILDMYRQHQASILEYLPPDDSNTRRNILYKTIFEGFAKIDGRATDAEMRARRKAATEEAEKQKKEEIKALQGQLAALKEIQAEVQEKESDAVKPKNQDIQGGKAAPAEALGIPDEHYLDNLCIFCGERSESFTEEGLDLHYWKHCLMLTRCDHCKQVVEISSLTEHLLTECDKKDGFGKCYRCSEAVFKEELPRHIKHKDCNPAKPEKLANRCPLCHENFSPGEEAWKAHLMGPAGCTMNLRKTHILQKAPALQPGKSSAVAASGPLGSKAGSKIPTPKGGLSKSSSRTYAKR SW:ID K0562_HUMAN SW:DE RecName: Full=Uncharacterized protein KIAA0562; SW:GN Name=KIAA0562; SW:KW Alternative splicing; Coiled coil; Complete proteome; Phosphoprotein;Polymorphism; Repeat. SW:EXACT F SW:FUNC + BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 7->931|K0562_HUMAN|0.0|100.0|925/925| SEG 684->707|aemrarrkaateeaekqkkeeika| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 742->841|1du3A|2e-04|36.9|84/90| RP:PDB:NREP 3 RP:PDB:REP 200->254|1e52A|6e-04|18.9|53/56| RP:PDB:REP 536->657|2c1mA|9e-06|9.9|121/424| RP:PDB:REP 760->859|2b7rA|2e-04|14.4|90/568| RP:PFM:NREP 2 RP:PFM:REP 221->284|PF04245|6e-04|33.3|57/332|NA37| RP:PFM:REP 452->646|PF12348|3e-07|25.8|182/206|CLASP_N| HM:PFM:NREP 3 HM:PFM:REP 453->640|PF12348|6e-06|23.3|176/227|CLASP_N| HM:PFM:REP 219->252|PF08112|0.00017|44.1|34/56|ATP-synt_E_2| HM:PFM:REP 255->287|PF02151|0.00055|27.3|33/36|UVR| GO:PFM:NREP 1 GO:PFM GO:0009295|"GO:nucleoid"|PF04245|IPR007358| RP:SCP:NREP 4 RP:SCP:REP 12->123|1jhjA|4e-05|18.9|106/161|b.18.1.9| RP:SCP:REP 210->301|2pihA1|4e-17|21.6|88/123|a.281.1.1| RP:SCP:REP 443->667|1u6gC|2e-05|13.3|210/1146|a.118.1.2| RP:SCP:REP 753->856|2fug34|4e-04|11.5|104/143|d.58.1.5| HM:SCP:REP 4->160|1tvgA_|1.5e-08|18.5|135/0|b.18.1.9|1/1|Galactose-binding domain-like| HM:SCP:REP 444->656|1b3uA_|7.3e-06|19.3|197/0|a.118.1.2|1/1|ARM repeat| OP:NHOMO 153 OP:NHOMOORG 90 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 12----1-5221112----------------------------------------------------------------------------------------212--2-2-211221111111121316911313111121112-111-111312112223211-111-13231-2118111112-------112113 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 298 STR:RPRED 32.0 SQ:SECSTR #######################################################################################################################################################################################################ccc#TTccccc#cccHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcHHHHTTHHHHHHHHHHHHH#########################################################################################################################################################################################################################################################################################HHHHHHHHTcccHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHTTcHHH#HHHHTTcTTcHHHHHHHHHHHHHHHTccTTHHHHHHHTTHHHHHHHHTTcccHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHHTTcHHcHHHHHHGG###########################################################################ccccTTcccTTEEEccccTccGGGcccTccTTccccTTcHHHHHHHHHHccHHHHHTTcccccccTTcccccccccGGGTccccccccGGGGTccccccTcc#####Tcccccccccccc###################################################################### DISOP:02AL 1-5,183-196,309-385,399-423,470-478,686-745,881-932| PSIPRED ccccccccHHcccEEEEEccccccccHHHHHHcccccccccccccccccEEEEEEEccEEEEEEEEEEEEccccccEEEEEEccccHHHcccccHHHHHccEEEEccccccccccccccEEEEccccEEEEEEEEEccccccccccccEEEEEEEcccccccccccccccHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHccccccccccccccHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHcccHHHccccccHHHHHHHHHHHHcccccHHHHcccccccccccccccHHHHHHHcccHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHccHHHcccHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHcccccHHHccccHHHHHHHHccccccccccccHHHHccccccccccccccccccccHHHccccccccccccccccccHHHcc //