[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Homo sapiens (cDNA) (huge0)
Gene : KIAA0595
DDBJ      :             KIAA0595
Swiss-Prot:PPRC1_HUMAN  RecName: Full=Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1;AltName: Full=PGC-1-related coactivator;         Short=PRC;

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  59/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
d.58.7
:1666 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   1536->1605 2dhsA PDBj 3e-06 39.1 %
:RPS:PDB   1526->1608 3d45A PDBj 2e-10 21.8 %
:RPS:SCOP  1547->1638 1wf0A  d.58.7.1 * 2e-11 24.4 %
:HMM:SCOP  1482->1602 1hl6A_ d.58.7.1 * 1.7e-14 20.7 %
:HMM:PFM   1547->1606 PF00076 * RRM_1 5.3e-11 36.7 60/70  
:HMM:PFM   1157->1191 PF09208 * Endonuc-MspI 0.00061 31.4 35/263  
:BLT:SWISS 3->1666 PPRC1_HUMAN 0.0 100.0 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links HUGE Abbreviations Back to title page
GT:ID KIAA0595 GT:ORG huge0 GT:GENE KIAA0595 GT:PRODUCT KIAA0595 GT:DATABASE huge2038 LENGTH 1666 SQ:AASEQ AKMAARRGRRDGVAPPPSGGPGPDPGGGARGSGWGSRSQAPYGTLGAVSGGEQVLLHEEAGDSGFVSLSRLGPSLRDKDLEMEELMLQDETLLGTMQSYMDASLISLIEDFGSLGESRLSLEDQNEVSLLTALTEILDNADSENLSPFDSIPDSELLVSPREGSSLHKLLTLSRTPPERDLITPVDPLGPSTGSSRGSGVEMSLPDPSWDFSPPSFLETSSPKLPSWRPPRSRPRWGQSPPPQQRSDGEEEEEVASFSGQILAGELDNCVSSIPDFPMHLACPEEEDKATAAEMAVPAAGDESISSLSELVRAMHPYCLPNLTHLASLEDELQEQPDDLTLPEGCVVLEIVGQAATAGDDLEIPVVVRQVSPGPRPVLLDDSLETSSALQLLMPTLESETEAAVPKVTLCSEKEGLSLNSEEKLDSACLLKPREVVEPVVPKEPQNPPANAAPGSQRARKGRKKKSKEQPAACVEGYARRLRSSSRGQSTVGTEVTSQVDNLQKQPQEELQKESGPLQGKGKPRAWARAWAAALENSSPKNLERSAGQSSPAKEGPLDLYPKLADTIQTNPIPTHLSLVDSAQASPMPVDSVEADPTAVGPVLAGPVPVDPGLVDLASTSSELVEPLPAEPVLINPVLADSAAVDPAVVPISDNLPPVDAVPSGPAPVDLALVDPVPNDLTPVDPVLVKSRPTDPRRGAVSSALGGSAPQLLVESESLDPPKTIIPEVKEVVDSLKIESGTSATTHEARPRPLSLSEYRRRRQQRQAETEERSPQPPTGKWPSLPETPTGLADIPCLVIPPAPAKKTALQRSPETPLEICLVPVGPSPASPSPEPPVSKPVASSPTEQVPSQEMPLLARPSPPVQSVSPAVPTPPSMSAALPFPAGGLGMPPSLPPPPLQPPSLPLSMGPVLPDPFTHYAPLPSWPCYPHVSPSGYPCLPPPPTVPLVSGTPGAYAVPPTCSVPWAPPPAPVSPYSSTCTYGPLGWGPGPQHAPFWSTVPPPPLPPASIGRAVPQPKMESRGTPAGPPENVLPLSMAPPLSLGLPGHGAPQTEPTKVEVKPVPASPHPKHKVSALVQSPQMKALACVSAEGVTVEEPASERLKPETQETRPREKPPLPATKAVPTPRQSTVPKLPAVHPARLRKLSFLPTPRTQGSEDVVQAFISEIGIEASDLSSLLEQFEKSEAKKECPPPAPADSLAVGNSGGVDIPQEKRPLDRLQAPELANVAGLTPPATPPHQLWKPLAAVSLLAKAKSPKSTAQEGTLKPEGVTEAKHPAAVRLQEGVHGPSRVHVGSGDHDYCVRSRTPPKKMPALVIPEVGSRWNVKRHQDITIKPVLSLGPAAPPPPCIAASREPLDHRTSSEQADPSAPCLAPSSLLSPEASPCRNDMNTRTPPEPSAKQRSMRCYRKACRSASPSSQGWQGRRGRNSRSVSSGSNRTSEASSSSSSSSSSSRSRSRSLSPPHKRWRRSSCSSSGRSRRCSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSRSRSRSPSPRRRSDRRRRYSSYRSHDHYQRQRVLQKERAIEERRVVFIGKIPGRMTRSELKQRFSVFGEIEECTIHFRVQGDNYGFVTYRYAEEAFAAIESGHKLRQADEQPFDLCFGGRRQFCKRSYSDLDSNREDFDPAPVKSKFDSLDFDTLLKQAQKNLRR SW:ID PPRC1_HUMAN SW:DE RecName: Full=Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1;AltName: Full=PGC-1-related coactivator; Short=PRC; SW:GN Name=PPRC1; Synonyms=KIAA0595; SW:KW Activator; Alternative splicing; Complete proteome; Nucleus;Polymorphism; RNA-binding; Transcription; Transcription regulation. SW:EXACT F SW:FUNC + BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 3->1666|PPRC1_HUMAN|0.0|100.0|1664/1664| GO:SWS:NREP 4 GO:SWS GO:0005634|"GO:nucleus"|Nucleus| GO:SWS GO:0003723|"GO:RNA binding"|RNA-binding| GO:SWS GO:0006350|"GO:transcription"|Transcription| GO:SWS GO:0045449|"GO:regulation of transcription"|Transcription regulation| SEG 11->38|dgvapppsggpgpdpgggargsgwgsrs| SEG 75->93|lrdkdlemeelmlqdetll| SEG 203->217|slpdpswdfsppsfl| SEG 220->246|sspklpswrpprsrprwgqspppqqrs| SEG 432->448|prevvepvvpkepqnpp| SEG 502->513|lqkqpqeelqke| SEG 524->533|rawarawaaa| SEG 598->617|avgpvlagpvpvdpglvdla| SEG 636->653|pvladsaavdpavvpisd| SEG 759->766|rrrrqqrq| SEG 822->845|vpvgpspaspspeppvskpvassp| SEG 860->880|psppvqsvspavptppsmsaa| SEG 886->910|gglgmppslpppplqppslplsmgp| SEG 933->953|psgypclpppptvplvsgtpg| SEG 957->977|vpptcsvpwapppapvspyss| SEG 1000->1006|pppplpp| SEG 1182->1196|ekseakkecpppapa| SEG 1242->1258|kplaavsllakakspks| SEG 1341->1351|paappppciaa| SEG 1367->1385|psapclapssllspeaspc| SEG 1423->1461|grrgrnsrsvssgsnrtseasssssssssssrsrsrsls| SEG 1468->1525|rrsscsssgrsrrcssssssssssssssssssssrsrsrspsprrrsdrrrryssyrs| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 1536->1605|2dhsA|3e-06|39.1|69/187| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 1526->1608|3d45A|2e-10|21.8|78/383| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 1547->1606|PF00076|5.3e-11|36.7|60/70|RRM_1| HM:PFM:REP 1157->1191|PF09208|0.00061|31.4|35/263|Endonuc-MspI| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 1547->1638|1wf0A|2e-11|24.4|78/88|d.58.7.1| HM:SCP:REP 1482->1602|1hl6A_|1.7e-14|20.7|121/0|d.58.7.1|1/1|RNA-binding domain, RBD| OP:NHOMO 197 OP:NHOMOORG 59 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------1533125322333376262CW31735-322323422322233241343211--11113113--1------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 122 STR:RPRED 7.3 SQ:SECSTR #####################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################cccccccEEcccccccccGGGEEEEEccTTccHHHHHHHGGGGcccEEEEccccTTcEcEEEEEcccHHHHHHHHHHTccccETcccccEEEccccccEEEccccccccccccccccccccc################### DISOP:02AL 1-28,156-203,212-308,322-341,353-1544,1551-1564,1663-1667| PSIPRED cccHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEEEEcccccccEEEHHHcccccHHccccHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHcccccccccccccccccHHcccccccccHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHccccccccccccccccccccHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEcccccccHHHHHHHHHHcccEEEEEEEEEccccEEEEEEEcccHHHHHHHHccccccccccccEEEEccccccccccccccccccHHHccccccccccccccHHHHHHHHHHHHcc //