[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Homo sapiens (cDNA) (huge0)
Gene : KIAA0796
DDBJ      :             KIAA0796
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  66/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.24.11a.48.2a.7.1
:1876 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   796->960 1u5pA PDBj 3e-05 26.7 %
:BLT:PDB   967->1256 1u4qB PDBj 2e-09 20.1 %
:RPS:PDB   25->312 3edvB PDBj 2e-07 11.8 %
:RPS:PDB   440->658 3bk9H PDBj 6e-20 10.9 %
:RPS:PDB   640->960 3edvA PDBj 2e-12 13.9 %
:RPS:PDB   961->1289 3edvA PDBj 2e-30 15.7 %
:RPS:PDB   1518->1737 3edvB PDBj 1e-06 10.0 %
:RPS:SCOP  66->212 1z8lA1  a.48.2.1 * 1e-07 7.4 %
:RPS:SCOP  431->531 2spcA  a.7.1.1 * 6e-06 13.2 %
:RPS:SCOP  507->645 1z8lA1  a.48.2.1 * 4e-11 10.6 %
:RPS:SCOP  823->951 1owaA  a.7.1.1 * 2e-08 14.5 %
:RPS:SCOP  928->1083 1z8lA1  a.48.2.1 * 8e-19 6.6 %
:RPS:SCOP  1130->1272 1owaA  a.7.1.1 * 4e-13 14.7 %
:RPS:SCOP  1522->1628 1u4qA1  a.7.1.1 * 9e-09 26.0 %
:RPS:SCOP  1600->1735 1g4uS1  a.24.11.1 * 5e-10 18.3 %
:HMM:SCOP  44->154 1owaA_ a.7.1.1 * 3.3e-10 24.8 %
:HMM:SCOP  102->207 1s35A2 a.7.1.1 * 4.5e-11 23.8 %
:HMM:SCOP  155->312 1owaA_ a.7.1.1 * 3.2e-17 26.8 %
:HMM:SCOP  424->540 1quuA2 a.7.1.1 * 4.9e-16 29.5 %
:HMM:SCOP  507->638 1owaA_ a.7.1.1 * 4.2e-16 26.9 %
:HMM:SCOP  645->747 1quuA1 a.7.1.1 * 7.2e-07 24.8 %
:HMM:SCOP  698->856 1owaA_ a.7.1.1 * 1.6e-14 28.4 %
:HMM:SCOP  864->963 1s35A1 a.7.1.1 * 1e-11 33.0 %
:HMM:SCOP  966->1080 1quuA1 a.7.1.1 * 1.7e-15 27.5 %
:HMM:SCOP  1074->1186 1hciA4 a.7.1.1 * 1.9e-14 23.6 %
:HMM:SCOP  1133->1289 1owaA_ a.7.1.1 * 5.6e-23 24.0 %
:HMM:SCOP  1464->1626 1owaA_ a.7.1.1 * 1.9e-21 23.1 %
:HMM:SCOP  1630->1742 1quuA1 a.7.1.1 * 6.5e-07 27.3 %
:RPS:PFM   538->639 PF00435 * Spectrin 2e-04 27.2 %
:RPS:PFM   870->960 PF00435 * Spectrin 1e-05 35.6 %
:RPS:PFM   1190->1289 PF00435 * Spectrin 5e-05 29.7 %
:RPS:PFM   1757->1814 PF05956 * APC_basic 2e-04 45.6 %
:RPS:PFM   1818->1875 PF10541 * KASH 4e-14 52.6 %
:HMM:PFM   20->97 PF00435 * Spectrin 8.5e-05 23.0 74/105  
:HMM:PFM   103->197 PF00435 * Spectrin 1.8e-10 21.3 94/105  
:HMM:PFM   219->309 PF00435 * Spectrin 8.5e-09 25.8 89/105  
:HMM:PFM   432->531 PF00435 * Spectrin 9.7e-12 28.9 97/105  
:HMM:PFM   536->634 PF00435 * Spectrin 2.9e-08 16.3 98/105  
:HMM:PFM   754->855 PF00435 * Spectrin 3.3e-06 21.8 101/105  
:HMM:PFM   862->961 PF00435 * Spectrin 1.1e-11 34.3 99/105  
:HMM:PFM   966->1075 PF00435 * Spectrin 1.3e-08 23.3 103/105  
:HMM:PFM   1079->1176 PF00435 * Spectrin 3.7e-08 19.8 96/105  
:HMM:PFM   1189->1289 PF00435 * Spectrin 2.3e-10 21.0 100/105  
:HMM:PFM   1519->1626 PF00435 * Spectrin 2.2e-13 23.8 105/105  
:HMM:PFM   1817->1876 PF10541 * KASH 6.4e-33 83.1 59/59  
:BLT:SWISS 1->1876 SYNE1_HUMAN 0.0 99.9 %
:TM
:REPEAT 3|512->712|836->1033|1055->1253
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links HUGE Abbreviations Back to title page
GT:ID KIAA0796 GT:ORG huge0 GT:GENE KIAA0796 GT:PRODUCT KIAA0796 GT:DATABASE huge2038 LENGTH 1876 SQ:AASEQ WISLMENVIQKDEDNIKNSIGYKAIHEYLQKYKGFKIDINCKQLTVDFVNQSVLQISSQDVESKRSDKTDFAEQLGAMNKSWQILQGLVTEKIQLLEGLLESWSEYENNVQCLKTWFETQEKRLKQQHRIGDQASVQNALKDCQDLEDLIKAKEKEVEKIEQNGLALIQNKKEDVSSIVMSTLRELGQTWANLDHMVGQLKILLKSVLDQWSSHKVAFDKINSYLMEARYSLSRFRLLTGSLEAVQVQVDNLQNLQDDLEKQERSLQKFGSITNQLLKECHPPVTETLTNTLKEVNMRWNNLLEEIAEQLQSSKALLQLWQRYKDYSKQCASTVQQQEDRTNELLKAATNKDIADDEVATWIQDCNDLLKGLGTVKDSLFVLHELGEQLKQQVDASAASAIQSDQLSLSQHLCALEQALCKQQTSLQAGVLDYETFAKSLEALEAWIVEAEEILQGQDPSHSSDLSTIQERMEELKGQMLKFSSMAPDLDRLNELGYRLPLNDKEIKRMQNLNRHWSLISSQTTERFSKLQSFLLQHQTFLEKCETWMEFLVQTEQKLAVEISGNYQHLLEQQRAHELFQAEMFSRQQILHSIIIDGQRLLEQGQVDDRDEFNLKLTLLSNQWQGVIRRAQQRRGIIDSQIRQWQRYREMAEKLRKWLVEVSYLPMSGLGSVPIPLQQARTLFDEVQFKEKVFLRQQGSYILTVEAGKQLLLSADSGAEAALQAELAEIQEKWKSASMRLEEQKKKLAFLLKDWEKCEKGIADSLEKLRTFKKKLSQSLPDHHEELHAEQMRCKELENAVGSWTDDLTQLSLLKDTLSAYISADDISILNERVELLQRQWEELCHQLSLRRQQIGERLNEWAVFSEKNKELCEWLTQMESKVSQNGDILIEEMIEKLKKDYQEEIAIAQENKIQLQQMGERLAKASHESKASEIEYKLGKVNDRWQHLLDLIAARVKKLKETLVAVQQLDKNMSSLRTWLAHIESELAKPIVYDSCNSEEIQRKLNEQQELQRDIEKHSTGVASVLNLCEVLLHDCDACATDAECDSIQQATRNLDRRWRNICAMSMERRLKIEETWRLWQKFLDDYSRFEDWLKSSERTAAFPSSSGVIYTVAKEELKKFEAFQRQVHECLTQLELINKQYRRLARENRTDSACSLKQMVHEGNQRWDNLQKRVTSILRRLKHFIGQREEFETARDSILVWLTEMDLQLTNIEHFSECDVQAKIKQLKAFQQEISLNHNKIEQIIAQGEQLIEKSEPLDAAIIEEELDELRRYCQEVFGRVERYHKKLIRLPLPDDEHDLSDRELELEDSAALSDLHWHDRSADSLLSPQPSSNLSLSLAQPLRSERSGRDTPASVDSIPLEWDHDYDLSRDLESAMSRALPSEDEEGQDDKDFYLRGAVALSGDHSALESQIRQLGKALDDSRFQIQQTENIIRSKTPTGPELDTSYKGYMKLLGECSSSIDSVKRLEHKLKEEEESLPGFVNLHSTETQTAGVIDRWELLQAQALSKELRMKQNLQKWQQFNSDLNSIWAWLGDTEEELEQLQRLELSTDIQTIELQIKKLKELQKAVDHRKAIILSINLCSPEFTQADSKESRDLQDRLSQMNGRWDRVCSLLEEWRGLLQDALMQCQGFHEMSHGLLLMLENIDRRKNEIVPIDSNLDAEILQDHHKQLMQIKHELLESQLRVASLQDMSCQLLVNAEGTDCLEAKEKVHVIGNRLKLLLKEVSRHIKELEKLLDVSSSQQDLSSWSSADELDTSGSVSPTSGRSTPNRQKTPRGKCSLSQPGPSVSSPHSRSTKGGSDSSLSEPGPGRSGRGFLFRVLRAALPLQLLLLLLIGLACLVPMSEEDYSCALSNNFARSFHPMLRYTNGPPPL BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 1->1876|SYNE1_HUMAN|0.0|99.9|1876/8797| TM:NTM 1 TM:REGION 1821->1843| NREPEAT 1 REPEAT 3|512->712|836->1033|1055->1253| SEG 150->161|ikakekevekie| SEG 245->259|vqvqvdnlqnlqddl| SEG 391->410|qqvdasaasaiqsdqlslsq| SEG 718->731|aeaalqaelaeiqe| SEG 1035->1046|dcdacatdaecd| SEG 1326->1344|sllspqpssnlslslaqpl| SEG 1467->1480|krlehklkeeeesl| SEG 1539->1550|eeeleqlqrlel| SEG 1557->1569|ielqikklkelqk| SEG 1738->1753|lldvsssqqdlsswss| SEG 1824->1843|lraalplqlllllliglacl| BL:PDB:NREP 2 BL:PDB:REP 796->960|1u5pA|3e-05|26.7|161/211| BL:PDB:REP 967->1256|1u4qB|2e-09|20.1|278/317| RP:PDB:NREP 5 RP:PDB:REP 25->312|3edvB|2e-07|11.8|280/321| RP:PDB:REP 440->658|3bk9H|6e-20|10.9|205/257| RP:PDB:REP 640->960|3edvA|2e-12|13.9|316/322| RP:PDB:REP 961->1289|3edvA|2e-30|15.7|318/322| RP:PDB:REP 1518->1737|3edvB|1e-06|10.0|213/321| RP:PFM:NREP 5 RP:PFM:REP 538->639|PF00435|2e-04|27.2|101/104|Spectrin| RP:PFM:REP 870->960|PF00435|1e-05|35.6|90/104|Spectrin| RP:PFM:REP 1190->1289|PF00435|5e-05|29.7|99/104|Spectrin| RP:PFM:REP 1757->1814|PF05956|2e-04|45.6|57/349|APC_basic| RP:PFM:REP 1818->1875|PF10541|4e-14|52.6|57/59|KASH| HM:PFM:NREP 12 HM:PFM:REP 20->97|PF00435|8.5e-05|23.0|74/105|Spectrin| HM:PFM:REP 103->197|PF00435|1.8e-10|21.3|94/105|Spectrin| HM:PFM:REP 219->309|PF00435|8.5e-09|25.8|89/105|Spectrin| HM:PFM:REP 432->531|PF00435|9.7e-12|28.9|97/105|Spectrin| HM:PFM:REP 536->634|PF00435|2.9e-08|16.3|98/105|Spectrin| HM:PFM:REP 754->855|PF00435|3.3e-06|21.8|101/105|Spectrin| HM:PFM:REP 862->961|PF00435|1.1e-11|34.3|99/105|Spectrin| HM:PFM:REP 966->1075|PF00435|1.3e-08|23.3|103/105|Spectrin| HM:PFM:REP 1079->1176|PF00435|3.7e-08|19.8|96/105|Spectrin| HM:PFM:REP 1189->1289|PF00435|2.3e-10|21.0|100/105|Spectrin| HM:PFM:REP 1519->1626|PF00435|2.2e-13|23.8|105/105|Spectrin| HM:PFM:REP 1817->1876|PF10541|6.4e-33|83.1|59/59|KASH| GO:PFM:NREP 5 GO:PFM GO:0005515|"GO:protein binding"|PF05956|IPR009234| GO:PFM GO:0008017|"GO:microtubule binding"|PF05956|IPR009234| GO:PFM GO:0016055|"GO:Wnt receptor signaling pathway"|PF05956|IPR009234| GO:PFM GO:0003779|"GO:actin binding"|PF10541|IPR012315| GO:PFM GO:0016021|"GO:integral to membrane"|PF10541|IPR012315| RP:SCP:NREP 8 RP:SCP:REP 66->212|1z8lA1|1e-07|7.4|147/157|a.48.2.1| RP:SCP:REP 431->531|2spcA|6e-06|13.2|99/107|a.7.1.1| RP:SCP:REP 507->645|1z8lA1|4e-11|10.6|139/157|a.48.2.1| RP:SCP:REP 823->951|1owaA|2e-08|14.5|127/156|a.7.1.1| RP:SCP:REP 928->1083|1z8lA1|8e-19|6.6|152/157|a.48.2.1| RP:SCP:REP 1130->1272|1owaA|4e-13|14.7|136/156|a.7.1.1| RP:SCP:REP 1522->1628|1u4qA1|9e-09|26.0|104/107|a.7.1.1| RP:SCP:REP 1600->1735|1g4uS1|5e-10|18.3|126/130|a.24.11.1| HM:SCP:REP 44->154|1owaA_|3.3e-10|24.8|105/0|a.7.1.1|1/12|Spectrin repeat| HM:SCP:REP 102->207|1s35A2|4.5e-11|23.8|105/0|a.7.1.1|2/15|Spectrin repeat| HM:SCP:REP 155->312|1owaA_|3.2e-17|26.8|153/0|a.7.1.1|2/12|Spectrin repeat| HM:SCP:REP 424->540|1quuA2|4.9e-16|29.5|112/124|a.7.1.1|5/15|Spectrin repeat| HM:SCP:REP 507->638|1owaA_|4.2e-16|26.9|130/0|a.7.1.1|4/12|Spectrin repeat| HM:SCP:REP 645->747|1quuA1|7.2e-07|24.8|101/124|a.7.1.1|7/15|Spectrin repeat| HM:SCP:REP 698->856|1owaA_|1.6e-14|28.4|155/0|a.7.1.1|6/12|Spectrin repeat| HM:SCP:REP 864->963|1s35A1|1e-11|33.0|100/0|a.7.1.1|9/15|Spectrin repeat| HM:SCP:REP 966->1080|1quuA1|1.7e-15|27.5|109/124|a.7.1.1|10/15|Spectrin repeat| HM:SCP:REP 1074->1186|1hciA4|1.9e-14|23.6|110/114|a.7.1.1|11/15|Spectrin repeat| HM:SCP:REP 1133->1289|1owaA_|5.6e-23|24.0|154/0|a.7.1.1|10/12|Spectrin repeat| HM:SCP:REP 1464->1626|1owaA_|1.9e-21|23.1|156/0|a.7.1.1|11/12|Spectrin repeat| HM:SCP:REP 1630->1742|1quuA1|6.5e-07|27.3|110/124|a.7.1.1|15/15|Spectrin repeat| OP:NHOMO 977 OP:NHOMOORG 66 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------2-------------------------------------------------------------------------------------------------------HEHEIELA7767C9YX9Z4t*U6WHZ7798D7AG979777U66g5FBDA34848995M65Q2472------------------------ ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 1378 STR:RPRED 73.5 SQ:SECSTR ########################HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH##HHHHHHHHHHHHHTTcTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH#HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH#HHHHHHHHHHHHHHHHHTcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHTTcTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH##################################################################################################TcccHHHHHHHHHHHHHTTcccHHHHTTccTTHHHHTTccccccccccccTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHTTccHHHHTTTGGGGTTccGGGcHHHHHHHHHHHHHHHTTcccGGGGGGGTTcHHHHHHHHHHHTccHHHHHcHHHHHHHHHHTTTccccGGGGcccTTccccccGGGHHHHHHcHHHHcTTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT##ccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHT########################################HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcccccTTHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGTcGcccccHHHTTHHHHTTccccccccccTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHTTccHHHHTTTGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTcccccccHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcTTHHccTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTccccccccHcHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHTTcTcTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH###############################################################################################################################################################################################HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH########################################################################################################################################### DISOP:02AL 10-23,56-70,122-135,165-180,344-358,394-397,399-399,494-510,559-565,597-613,664-679,705-723,774-787,818-828,880-892,925-932,990-1000,1035-1048,1101-1111,1145-1158,1206-1223,1259-1261,1318-1335,1348-1351,1353-1354,1431-1450,1455-1485,1541-1560,1584-1598,1651-1665,1705-1706,1756-1819,1874-1877| PSIPRED ccHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHcHHHccccccccc //