[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]

DDBJ      :             KIAA0829
Swiss-Prot:CAND1_HUMAN  RecName: Full=Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1;AltName: Full=Cullin-associated and neddylation-dissociated protein 1;AltName: Full=p120 CAND1;AltName: Full=TBP-interacting protein TIP120A;AltName: Full=TBP-interacting protein of 120 kDa A;

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  170/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]

a.118.1

:1277 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   51->1257 1u6gC PDBj 0.0 99.2 %
:RPS:PDB   92->898 3ea5B PDBj 4e-38 9.2 %
:RPS:PDB   899->1107 2b6cA PDBj 2e-11 7.3 %
:RPS:SCOP  51->1257 1u6gC  a.118.1.2 * e-100 94.9 %
:HMM:SCOP  51->1257 1u6gC_ a.118.1.2 * 5.6e-259 27.8 %
:RPS:PFM   1087->1251 PF08623 * TIP120 1e-57 65.5 %
:HMM:PFM   1086->1251 PF08623 * TIP120 1.7e-68 55.4 166/169  
:HMM:PFM   97->125 PF02985 * HEAT 2.3e-05 37.9 29/31  
:HMM:PFM   390->408 PF02985 * HEAT 0.00023 44.4 18/31  
:HMM:PFM   907->931 PF02985 * HEAT 0.00018 36.0 25/31  
:HMM:PFM   261->352 PF08064 * UME 2.2e-05 17.8 90/107  
:HMM:PFM   477->559 PF08064 * UME 5.3e-05 17.7 79/107  
:HMM:PFM   957->1101 PF12348 * CLASP_N 0.00033 23.6 144/227  
:HMM:PFM   629->673 PF09324 * DUF1981 0.00032 26.7 45/86  
:BLT:SWISS 48->1277 CAND1_HUMAN 0.0 100.0 %
:SEG

SeqInfo   AminoSeq     See neighboring genes

Links HUGE                                                Abbreviations  Back to title page

GT:ID          KIAA0829
GT:ORG         huge0
GT:GENE        KIAA0829
GT:PRODUCT     KIAA0829
GT:DATABASE    huge2038
LENGTH         1277
SQ:AASEQ       SASASRCDPGSGSRREREEELQWRRRRRQRQRAAAPAAPAGGIEAVNMASASYHISNLLEKMTSSDKDFRFMATNDLMTELQKDSIKLDDDSERKVVKMILKLLEDKNGEVQNLAVKCLGPLVSKVKEYQVETIVDTLCTNMLSDKEQLRDISSIGLKTVIGELPPASSGSALAANVCKKITGRLTSAIAKQEDVSVQLEALDIMADMLSRQGGLLVNFHPSILTCLLPQLTSPRLAVRKRTIIALGHLVMSCGNIVFVDLIEHLLSELSKNDSMSTTRTYIQCIAAISRQAGHRIGEYLEKIIPLVVKFCNVDDDELREYCIQAFESFVRRCPKEVYPHVSTIINICLKYLTYDPNYNYDDEDEDENAMDADGGDDDDQGSDDEYSDDDDMSWKVRRAAAKCLDAVVSTRHEMLPEFYKTVSPALISRFKEREENVKADVFHAYLSLLKQTRPVQSWLCDPDAMEQGETPLTMLQSQVPNIVKALHKQMKEKSVKTRQCCFNMLTELVNVLPGALTQHIPVLVPGIIFSLNDKSSSSNLKIDALSCLYVILCNHSPQVFHPHVQALVPPVVACVGDPFYKITSEALLVTQQLVKVIRPLDQPSSFDATPYIKDLFTCTIKRLKAADIDQEVKERAISCMGQIICNLGDNLGSDLPNTLQIFLERLKNEITRLTTVKALTLIAGSPLKIDLRPVLGEGVPILASFLRKNQRALKLGTLSALDILIKNYSDSLTAAMIDAVLDELPPLISESDMHVSQMAISFLTTLAKVYPSSLSKISGSILNELIGLVRSPLLQGGALSAMLDFFQALVVTGTNNLGYMDLLRMLTGPVYSQSTALTHKQSYYSIAKCVAALTRACPKEGPAVVGQFIQDVKNSRSTDSIRLLALLSLGEVGHHIDLSGQLELKSVILEAFSSPSEEVKSAASYALGSISVGNLPEYLPFVLQEITSQPKRQYLLLHSLKEIISSASVVGLKPYVENIWALLLKHCECAEEGTRNVVAECLGKLTLIDPETLLPRLKGYLISGSSYARSSVVTAVKFTISDHPQPIDPLLKNCIGDFLKTLEDPDLNVRRVALVTFNSAAHNKPSLIRDLLDTVLPHLYNETKVRKELIREVEMGPFKHTVDDGLDIRKAAFECMYTLLDSCLDRLDIFEFLNHVEDGLKDHYDIKMLTFLMLVRLSTLCPSAVLQRLDRLVEPLRATCTTKVKANSVKQEFEKQDELKRSAMRAVAALLTIPEAEKSPLMSEFQSQISSNPELAAIFESIQKDSSSTNLESMDTS
SW:ID          CAND1_HUMAN
SW:DE          RecName: Full=Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1;AltName: Full=Cullin-associated and neddylation-dissociated protein 1;AltName: Full=p120 CAND1;AltName: Full=TBP-interacting protein TIP120A;AltName: Full=TBP-interacting protein of 120 kDa A;
SW:GN          Name=CAND1; Synonyms=KIAA0829, TIP120, TIP120A;
SW:KW          3D-structure; Acetylation; Alternative splicing; Complete proteome;Direct protein sequencing; Nucleus; Phosphoprotein; Polymorphism;Repeat; Transcription; Transcription regulation;Ubl conjugation pathway.
SW:EXACT       F
SW:FUNC        +
BL:SWS:NREP    1
BL:SWS:REP     48->1277|CAND1_HUMAN|0.0|100.0|1230/1230|
GO:SWS:NREP    3
GO:SWS         GO:0005634|"GO:nucleus"|Nucleus|
GO:SWS         GO:0006350|"GO:transcription"|Transcription|
GO:SWS         GO:0045449|"GO:regulation of transcription"|Transcription regulation|
SEG            14->40|rrereeelqwrrrrrqrqraaapaapa|
SEG            164->175|lppassgsalaa|
SEG            357->393|nynyddededenamdadggddddqgsddeysddddms|
SEG            528->543|ifslndkssssnlkid|
BL:PDB:NREP    1
BL:PDB:REP     51->1257|1u6gC|0.0|99.2|1146/1146|
RP:PDB:NREP    2
RP:PDB:REP     92->898|3ea5B|4e-38|9.2|796/859|
RP:PDB:REP     899->1107|2b6cA|2e-11|7.3|191/209|
RP:PFM:NREP    1
RP:PFM:REP     1087->1251|PF08623|1e-57|65.5|165/167|TIP120|
HM:PFM:NREP    8
HM:PFM:REP     1086->1251|PF08623|1.7e-68|55.4|166/169|TIP120|
HM:PFM:REP     97->125|PF02985|2.3e-05|37.9|29/31|HEAT|
HM:PFM:REP     390->408|PF02985|0.00023|44.4|18/31|HEAT|
HM:PFM:REP     907->931|PF02985|0.00018|36.0|25/31|HEAT|
HM:PFM:REP     261->352|PF08064|2.2e-05|17.8|90/107|UME|
HM:PFM:REP     477->559|PF08064|5.3e-05|17.7|79/107|UME|
HM:PFM:REP     957->1101|PF12348|0.00033|23.6|144/227|CLASP_N|
HM:PFM:REP     629->673|PF09324|0.00032|26.7|45/86|DUF1981|
RP:SCP:NREP    1
RP:SCP:REP     51->1257|1u6gC|e-100|94.9|1146/1146|a.118.1.2|
HM:SCP:REP     51->1257|1u6gC_|5.6e-259|27.8|1207/0|a.118.1.2|1/1|ARM repeat|
OP:NHOMO       284
OP:NHOMOORG    170
OP:PATTERN     -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----111-----11111112111222211111111111211111111111111111111111111--------11-------11-111-12111111111111111-11121241252222332241225O22324111122223122112215234221341135211125131-1122111112212111111111- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
STR:NPRED      1207
STR:RPRED      94.5
SQ:SECSTR      ##################################################ccHGHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHcHcHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHTcTTccHHHHHHHHHHHHTTTccccHHHHHHHGGGTHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHTcccHHHHHGGGTccTTHHHHHHHHTcTTccHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHTcTTcccHHHHHHHHHHTHHHHTcHHHHHHHHHHHHHHHTcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGcHHHHHHTHHHHHHHHHTcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcTTcccccccHHHHHHHHHTTcccccTTcccccHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGHHHHHHHHHHHTTcccHHHHHHHHHHHTTcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGTTTTHHHHHHHHHHHHTccHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTccccGGGGGHHHHHHHHHHHHTccccGGGHHHHHHHHHHHHHccGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcGGGTGGGHHHHHHHHHHHHHccccTTTHHHHHHHHHHHHHGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHcTTcHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGHHHHHHHHHHHHHHHTcTccTTHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGHHHHHHHHHHHHHHHTcccHHHHHHHHHHHHHHHTTTcHHHHGGGHHHHHHHHHHHHHcHHHHTcHHHHHHHHHHHHHHHHHcTTcGcHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHTcGHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHTccccHHHHHHHHHHHHTccTTTHGGGHHHHHGGGGcccHHHHHHHHHHHHHHHTccHHHHcHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHTTTcHHHHHHHHHccccHHHHHHHTTTHHTTHHHHHHHHHHGGGcHHHHHHTHHHHHHHHHTcccHHHHHHHHTTcccccccHHHHHHHcTTcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHccccTTccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcccccccccccccccHHHHHHHHHTc####################
DISOP:02AL     1-39,187-188,190-193,457-474,829-837,867-881,1024-1024,1263-1278|
PSIPRED        cccccccccccccHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHccHHccccHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHccccEEEcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHccccccccHHccc
//