[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Homo sapiens (cDNA) (huge0)
Gene : KIAA0829
DDBJ      :             KIAA0829
Swiss-Prot:CAND1_HUMAN  RecName: Full=Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1;AltName: Full=Cullin-associated and neddylation-dissociated protein 1;AltName: Full=p120 CAND1;AltName: Full=TBP-interacting protein TIP120A;AltName: Full=TBP-interacting protein of 120 kDa A;

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  170/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.118.1
:1277 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   51->1257 1u6gC PDBj 0.0 99.2 %
:RPS:PDB   92->898 3ea5B PDBj 4e-38 9.2 %
:RPS:PDB   899->1107 2b6cA PDBj 2e-11 7.3 %
:RPS:SCOP  51->1257 1u6gC  a.118.1.2 * e-100 94.9 %
:HMM:SCOP  51->1257 1u6gC_ a.118.1.2 * 5.6e-259 27.8 %
:RPS:PFM   1087->1251 PF08623 * TIP120 1e-57 65.5 %
:HMM:PFM   1086->1251 PF08623 * TIP120 1.7e-68 55.4 166/169  
:HMM:PFM   97->125 PF02985 * HEAT 2.3e-05 37.9 29/31  
:HMM:PFM   390->408 PF02985 * HEAT 0.00023 44.4 18/31  
:HMM:PFM   907->931 PF02985 * HEAT 0.00018 36.0 25/31  
:HMM:PFM   261->352 PF08064 * UME 2.2e-05 17.8 90/107  
:HMM:PFM   477->559 PF08064 * UME 5.3e-05 17.7 79/107  
:HMM:PFM   957->1101 PF12348 * CLASP_N 0.00033 23.6 144/227  
:HMM:PFM   629->673 PF09324 * DUF1981 0.00032 26.7 45/86  
:BLT:SWISS 48->1277 CAND1_HUMAN 0.0 100.0 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links HUGE Abbreviations Back to title page
GT:ID KIAA0829 GT:ORG huge0 GT:GENE KIAA0829 GT:PRODUCT KIAA0829 GT:DATABASE huge2038 LENGTH 1277 SQ:AASEQ SASASRCDPGSGSRREREEELQWRRRRRQRQRAAAPAAPAGGIEAVNMASASYHISNLLEKMTSSDKDFRFMATNDLMTELQKDSIKLDDDSERKVVKMILKLLEDKNGEVQNLAVKCLGPLVSKVKEYQVETIVDTLCTNMLSDKEQLRDISSIGLKTVIGELPPASSGSALAANVCKKITGRLTSAIAKQEDVSVQLEALDIMADMLSRQGGLLVNFHPSILTCLLPQLTSPRLAVRKRTIIALGHLVMSCGNIVFVDLIEHLLSELSKNDSMSTTRTYIQCIAAISRQAGHRIGEYLEKIIPLVVKFCNVDDDELREYCIQAFESFVRRCPKEVYPHVSTIINICLKYLTYDPNYNYDDEDEDENAMDADGGDDDDQGSDDEYSDDDDMSWKVRRAAAKCLDAVVSTRHEMLPEFYKTVSPALISRFKEREENVKADVFHAYLSLLKQTRPVQSWLCDPDAMEQGETPLTMLQSQVPNIVKALHKQMKEKSVKTRQCCFNMLTELVNVLPGALTQHIPVLVPGIIFSLNDKSSSSNLKIDALSCLYVILCNHSPQVFHPHVQALVPPVVACVGDPFYKITSEALLVTQQLVKVIRPLDQPSSFDATPYIKDLFTCTIKRLKAADIDQEVKERAISCMGQIICNLGDNLGSDLPNTLQIFLERLKNEITRLTTVKALTLIAGSPLKIDLRPVLGEGVPILASFLRKNQRALKLGTLSALDILIKNYSDSLTAAMIDAVLDELPPLISESDMHVSQMAISFLTTLAKVYPSSLSKISGSILNELIGLVRSPLLQGGALSAMLDFFQALVVTGTNNLGYMDLLRMLTGPVYSQSTALTHKQSYYSIAKCVAALTRACPKEGPAVVGQFIQDVKNSRSTDSIRLLALLSLGEVGHHIDLSGQLELKSVILEAFSSPSEEVKSAASYALGSISVGNLPEYLPFVLQEITSQPKRQYLLLHSLKEIISSASVVGLKPYVENIWALLLKHCECAEEGTRNVVAECLGKLTLIDPETLLPRLKGYLISGSSYARSSVVTAVKFTISDHPQPIDPLLKNCIGDFLKTLEDPDLNVRRVALVTFNSAAHNKPSLIRDLLDTVLPHLYNETKVRKELIREVEMGPFKHTVDDGLDIRKAAFECMYTLLDSCLDRLDIFEFLNHVEDGLKDHYDIKMLTFLMLVRLSTLCPSAVLQRLDRLVEPLRATCTTKVKANSVKQEFEKQDELKRSAMRAVAALLTIPEAEKSPLMSEFQSQISSNPELAAIFESIQKDSSSTNLESMDTS SW:ID CAND1_HUMAN SW:DE RecName: Full=Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1;AltName: Full=Cullin-associated and neddylation-dissociated protein 1;AltName: Full=p120 CAND1;AltName: Full=TBP-interacting protein TIP120A;AltName: Full=TBP-interacting protein of 120 kDa A; SW:GN Name=CAND1; Synonyms=KIAA0829, TIP120, TIP120A; SW:KW 3D-structure; Acetylation; Alternative splicing; Complete proteome;Direct protein sequencing; Nucleus; Phosphoprotein; Polymorphism;Repeat; Transcription; Transcription regulation;Ubl conjugation pathway. SW:EXACT F SW:FUNC + BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 48->1277|CAND1_HUMAN|0.0|100.0|1230/1230| GO:SWS:NREP 3 GO:SWS GO:0005634|"GO:nucleus"|Nucleus| GO:SWS GO:0006350|"GO:transcription"|Transcription| GO:SWS GO:0045449|"GO:regulation of transcription"|Transcription regulation| SEG 14->40|rrereeelqwrrrrrqrqraaapaapa| SEG 164->175|lppassgsalaa| SEG 357->393|nynyddededenamdadggddddqgsddeysddddms| SEG 528->543|ifslndkssssnlkid| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 51->1257|1u6gC|0.0|99.2|1146/1146| RP:PDB:NREP 2 RP:PDB:REP 92->898|3ea5B|4e-38|9.2|796/859| RP:PDB:REP 899->1107|2b6cA|2e-11|7.3|191/209| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 1087->1251|PF08623|1e-57|65.5|165/167|TIP120| HM:PFM:NREP 8 HM:PFM:REP 1086->1251|PF08623|1.7e-68|55.4|166/169|TIP120| HM:PFM:REP 97->125|PF02985|2.3e-05|37.9|29/31|HEAT| HM:PFM:REP 390->408|PF02985|0.00023|44.4|18/31|HEAT| HM:PFM:REP 907->931|PF02985|0.00018|36.0|25/31|HEAT| HM:PFM:REP 261->352|PF08064|2.2e-05|17.8|90/107|UME| HM:PFM:REP 477->559|PF08064|5.3e-05|17.7|79/107|UME| HM:PFM:REP 957->1101|PF12348|0.00033|23.6|144/227|CLASP_N| HM:PFM:REP 629->673|PF09324|0.00032|26.7|45/86|DUF1981| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 51->1257|1u6gC|e-100|94.9|1146/1146|a.118.1.2| HM:SCP:REP 51->1257|1u6gC_|5.6e-259|27.8|1207/0|a.118.1.2|1/1|ARM repeat| OP:NHOMO 284 OP:NHOMOORG 170 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----111-----11111112111222211111111111211111111111111111111111111--------11-------11-111-12111111111111111-11121241252222332241225O22324111122223122112215234221341135211125131-1122111112212111111111- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 1207 STR:RPRED 94.5 SQ:SECSTR ##################################################ccHGHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHcHcHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHTcTTccHHHHHHHHHHHHTTTccccHHHHHHHGGGTHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHTcccHHHHHGGGTccTTHHHHHHHHTcTTccHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHTcTTcccHHHHHHHHHHTHHHHTcHHHHHHHHHHHHHHHTcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGcHHHHHHTHHHHHHHHHTcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcTTcccccccHHHHHHHHHTTcccccTTcccccHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGHHHHHHHHHHHTTcccHHHHHHHHHHHTTcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGTTTTHHHHHHHHHHHHTccHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTccccGGGGGHHHHHHHHHHHHTccccGGGHHHHHHHHHHHHHccGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcGGGTGGGHHHHHHHHHHHHHccccTTTHHHHHHHHHHHHHGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHcTTcHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGHHHHHHHHHHHHHHHTcTccTTHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGHHHHHHHHHHHHHHHTcccHHHHHHHHHHHHHHHTTTcHHHHGGGHHHHHHHHHHHHHcHHHHTcHHHHHHHHHHHHHHHHHcTTcGcHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHTcGHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHTccccHHHHHHHHHHHHTccTTTHGGGHHHHHGGGGcccHHHHHHHHHHHHHHHTccHHHHcHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHTTTcHHHHHHHHHccccHHHHHHHTTTHHTTHHHHHHHHHHGGGcHHHHHHTHHHHHHHHHTcccHHHHHHHHTTcccccccHHHHHHHcTTcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHccccTTccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcccccccccccccccHHHHHHHHHTc#################### DISOP:02AL 1-39,187-188,190-193,457-474,829-837,867-881,1024-1024,1263-1278| PSIPRED cccccccccccccHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHccHHccccHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHccccEEEcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHccccccccHHccc //