[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Homo sapiens (cDNA) (huge0)
Gene : KIAA1262
DDBJ      :             KIAA1262
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  77/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.38.1a.48.2a.7.1
:1362 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   880->1159 1hciA PDBj 1e-05 24.8 %
:RPS:PDB   125->444 3edvA PDBj 2e-10 13.1 %
:RPS:PDB   488->770 3edvB PDBj 3e-04 11.4 %
:RPS:PDB   772->1094 3edvA PDBj 8e-17 11.5 %
:RPS:SCOP  91->240 1z8lA1  a.48.2.1 * 2e-08 6.0 %
:RPS:SCOP  307->459 1z8lA1  a.48.2.1 * 7e-09 11.8 %
:RPS:SCOP  630->778 1z8lA1  a.48.2.1 * 7e-04 7.8 %
:RPS:SCOP  843->998 1z8lA1  a.48.2.1 * 2e-08 8.3 %
:RPS:SCOP  1007->1037 1an2A  a.38.1.1 * 2e-04 35.5 %
:HMM:SCOP  9->120 1quuA1 a.7.1.1 * 0.00034 22.5 %
:HMM:SCOP  72->230 1owaA_ a.7.1.1 * 3.8e-16 26.0 %
:HMM:SCOP  228->349 1quuA2 a.7.1.1 * 1.3e-14 23.7 %
:HMM:SCOP  290->450 1owaA_ a.7.1.1 * 8.5e-19 24.4 %
:HMM:SCOP  457->562 1quuA1 a.7.1.1 * 7.1e-05 24.0 %
:HMM:SCOP  656->772 1quuA1 a.7.1.1 * 6.4e-07 18.1 %
:HMM:SCOP  776->885 1quuA1 a.7.1.1 * 8.5e-10 22.9 %
:HMM:SCOP  847->990 1owaA_ a.7.1.1 * 2.8e-15 22.3 %
:HMM:SCOP  986->1097 1quuA2 a.7.1.1 * 9.1e-07 17.6 %
:HMM:SCOP  1256->1362 1owaA_ a.7.1.1 * 1.2e-06 16.2 %
:RPS:PFM   682->1161 PF12128 * DUF3584 2e-05 21.8 %
:HMM:PFM   44->119 PF00435 * Spectrin 2.2e-07 24.3 74/105  
:HMM:PFM   132->230 PF00435 * Spectrin 1.2e-06 25.8 97/105  
:HMM:PFM   246->340 PF00435 * Spectrin 1.5e-06 22.6 93/105  
:HMM:PFM   670->772 PF00435 * Spectrin 0.00028 20.8 101/105  
:HMM:PFM   776->866 PF00435 * Spectrin 9.6e-05 21.1 90/105  
:HMM:PFM   884->990 PF00435 * Spectrin 5.7e-07 24.0 104/105  
:BLT:SWISS 1->1355 SYNE1_HUMAN 0.0 99.7 %
:REPEAT 2|336->656|658->994
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links HUGE Abbreviations Back to title page
GT:ID KIAA1262 GT:ORG huge0 GT:GENE KIAA1262 GT:PRODUCT KIAA1262 GT:DATABASE huge2038 LENGTH 1362 SQ:AASEQ LDLCRQSNNLCLQREEDLQRTRDYHDCMNVVEVFLEKFTTEWDNLARSDAESTAVHLEALKKLALALQERKYAIEDLKDQKQKMIEHLNLDDKELVKEQTSHLEQRWFQLEDLIKRKIQVSVTNLEELNVVQSRFQELMEWAEEQQPNIAEALKQSPPPDMAQNLLMDHLAICSELEAKQMLLKSLIKDADRVMADLGLNERQVIQKALSDAQSHVNCLSDLVGQRRKYLNKALSEKTQFLMAVFQATSQIQQHERKIMFREHICLLPDDVSKQVKTCKSAQASLKTYQNEVTGLWAQGRELMKEVTEQEKSEVLGKLQELQSVYDSVLQKCSHRLQELEKNLVSRKHFKEDFDKACHWLKQADIVTFPEINLMNESTELHTQLAKYQNILEQSPEYENLLLTLQRTGQTILPSLNEVDHSYLSEKLNALPRQFNVIVALAKDKFYKVQEAILARKEYASLIELTTQSLSELEAQFLRMSKVPTDLAVEEALSLQDGCRAILDEVAGLGEAVDELNQKKEGFRSTGQPWQPDKMLHLVTLYHRLKRQTEQRVSLLEDTTSAYQEHEKMCQQLERQLKSVKEEQSKVNEETLPAEEKLKMYHSLAGSLQDSGIVLKRVTIHLEDLAPHLDPLAYEKARHQIQSWQGELKLLTSAIGETVTECESRMVQSIDFQTEMSRSLDWLRRVKAELSGPVYLDLNLQDIQEEIRKIQIHQEEVQSSLRIMNALSHKEKEKFTKAKELISADLEHSLAELSELDGDIQEALRTRQATLTEIYSQCQRYYQVFQAANDWLEDAQEMLQLAGNGLDVESAEENLKSHMEFFSTEDQFHSNLEELHSLVATLDPLIKPTGKEDLEQKVASLELRSQRMSRDSGAQVDLLQRCTAQWHDYQKAREEVIELMNDTEKKLSEFSLLKTSSSHEAEEKLSEHKALVSVVNSFHEKIVALEEKASQLEKTGNDASKATLSRSMTTVWQRWTRLRAVAQDQEKILEDAVDEWTGFNNKVKKATEMIDQLQDKLPGSSAEKASKAELLTLLEYHDTFVLELEQQQSALGMLRQQTLSMLQDGAAPTPGEEPPLMQEITAMQDRCLNMQEKVKTNGKLVKQELKDREMVETQINSVKCWVQETKEYLGNPTIEIDAQLEELQILLTEATNHRQNIEKMAEEQKEKYLGLYTILPSELSLQLAEVALDLKIRDQIQDKIKEVEQSKATSQELSRQIQKLAKDLTTILTKLKAKTDNVVQAKTDQKVLGEELDGCNSKLMELDAAVQKFLEQNGQLGKPLAKKIGKLTELHQQTIRQAENRLSKLNQAASHLEEYNEMLELILKWIEKAKVLAHGTIAWNSASQLREQYILHQVTLGKIIFKK BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 1->1355|SYNE1_HUMAN|0.0|99.7|1355/8797| NREPEAT 1 REPEAT 2|336->656|658->994| SEG 57->67|lealkklalal| SEG 1218->1235|klakdlttiltklkaktd| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 880->1159|1hciA|1e-05|24.8|262/475| RP:PDB:NREP 3 RP:PDB:REP 125->444|3edvA|2e-10|13.1|306/322| RP:PDB:REP 488->770|3edvB|3e-04|11.4|277/321| RP:PDB:REP 772->1094|3edvA|8e-17|11.5|313/322| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 682->1161|PF12128|2e-05|21.8|444/1179|DUF3584| HM:PFM:NREP 6 HM:PFM:REP 44->119|PF00435|2.2e-07|24.3|74/105|Spectrin| HM:PFM:REP 132->230|PF00435|1.2e-06|25.8|97/105|Spectrin| HM:PFM:REP 246->340|PF00435|1.5e-06|22.6|93/105|Spectrin| HM:PFM:REP 670->772|PF00435|0.00028|20.8|101/105|Spectrin| HM:PFM:REP 776->866|PF00435|9.6e-05|21.1|90/105|Spectrin| HM:PFM:REP 884->990|PF00435|5.7e-07|24.0|104/105|Spectrin| RP:SCP:NREP 5 RP:SCP:REP 91->240|1z8lA1|2e-08|6.0|150/157|a.48.2.1| RP:SCP:REP 307->459|1z8lA1|7e-09|11.8|153/157|a.48.2.1| RP:SCP:REP 630->778|1z8lA1|7e-04|7.8|149/157|a.48.2.1| RP:SCP:REP 843->998|1z8lA1|2e-08|8.3|156/157|a.48.2.1| RP:SCP:REP 1007->1037|1an2A|2e-04|35.5|31/86|a.38.1.1| HM:SCP:REP 9->120|1quuA1|0.00034|22.5|111/124|a.7.1.1|1/11|Spectrin repeat| HM:SCP:REP 72->230|1owaA_|3.8e-16|26.0|154/0|a.7.1.1|1/9|Spectrin repeat| HM:SCP:REP 228->349|1quuA2|1.3e-14|23.7|118/124|a.7.1.1|3/11|Spectrin repeat| HM:SCP:REP 290->450|1owaA_|8.5e-19|24.4|156/0|a.7.1.1|2/9|Spectrin repeat| HM:SCP:REP 457->562|1quuA1|7.1e-05|24.0|104/124|a.7.1.1|5/11|Spectrin repeat| HM:SCP:REP 656->772|1quuA1|6.4e-07|18.1|116/124|a.7.1.1|6/11|Spectrin repeat| HM:SCP:REP 776->885|1quuA1|8.5e-10|22.9|109/124|a.7.1.1|7/11|Spectrin repeat| HM:SCP:REP 847->990|1owaA_|2.8e-15|22.3|139/0|a.7.1.1|6/9|Spectrin repeat| HM:SCP:REP 986->1097|1quuA2|9.1e-07|17.6|108/124|a.7.1.1|9/11|Spectrin repeat| HM:SCP:REP 1256->1362|1owaA_|1.2e-06|16.2|105/0|a.7.1.1|9/9|Spectrin repeat| OP:NHOMO 653 OP:NHOMOORG 77 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------1--12--------------------------------------------1----------11----1------1-----11------------------1----7A9BBAD4445685QM6K4k*O5NDM45558466656644M45O4C87521--7632D4352322-------1---1----------1- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 1049 STR:RPRED 77.0 SQ:SECSTR ###################################################################HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcccccTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHTTHHHHTTccccccccccTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTcHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHTTccccHHHHcTTccccccTTccccHHHHHHHHHHHHHHHTTGGGcTTcccccTTTccccccccccccccccTTGGGcccHHHHHHHHHHHTHHHHcccccccTTcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHTHHHH#HHHHTccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHT#TcTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH###########################################HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH####ccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTccccc#cHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHTTTccEEEEEETTTEEEEEETTccGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTccccccTccccHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTcccccHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHTTTccccTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccTTTTcTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTGGG#################################################################################################################################################################################################### DISOP:02AL 7-7,40-56,87-99,117-117,119-120,146-163,189-207,256-268,302-312,369-383,385-401,408-424,475-488,501-502,504-505,523-523,525-530,587-609,624-636,687-702,731-746,794-811,842-852,907-918,1014-1028,1059-1079,1127-1142,1157-1179,1227-1242,1266-1277,1338-1341,1362-1363| PSIPRED ccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccc //