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Homo sapiens (cDNA) (huge0)
Gene : KIAA1643
DDBJ      :             KIAA1643
Swiss-Prot:LST2_HUMAN   RecName: Full=Lateral signaling target protein 2 homolog;         Short=hLst2;AltName: Full=Zinc finger FYVE domain-containing protein 28;

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  183/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.177.1a.24.3g.50.1
:993 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   920->979 2yqmA PDBj 3e-15 51.7 %
:RPS:PDB   875->979 1aqeA PDBj 5e-11 21.1 %
:RPS:SCOP  126->270 1sigA  a.177.1.1 * 5e-07 25.4 %
:RPS:SCOP  853->915 1lm3B  a.24.3.1 * 1e-12 15.9 %
:RPS:SCOP  919->979 1jocA1  g.50.1.1 * 3e-20 47.5 %
:HMM:SCOP  918->984 1wfkA_ g.50.1.1 * 2.1e-21 48.5 %
:RPS:PFM   920->979 PF01363 * FYVE 1e-17 58.3 %
:HMM:PFM   918->979 PF01363 * FYVE 7.2e-22 43.5 62/69  
:BLT:SWISS 107->993 LST2_HUMAN 0.0 99.9 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links HUGE Abbreviations Back to title page
GT:ID KIAA1643 GT:ORG huge0 GT:GENE KIAA1643 GT:PRODUCT KIAA1643 GT:DATABASE huge2038 LENGTH 993 SQ:AASEQ PAERWVSVSSEEPRAPVPASVRAPERPLPGLRSARRAACRAYSGPRTCPAHLPAARSALRASLASLPATARGLRPCLRVRPAPQPGPGAALRRARAARSPARAGAAMMNRFRKWLYKPKRSDPQLLARFYYADEELNQVAAELDSLDGRKDPQRCTLLVSQFRSCQDNVLNIINQIMDECIPQDRAPRDFCVKFPEEIRHDNLAGQLWFGAECLAAGSIIMNRELESMAMRPLAKELTRSLEDVRGALRDQALRDLNTYTEKMREALRHFDVLFAEFELSYVSAMVPVKSPREYYVQQEVIVLFCETVERALDFGYLTQDMIDDYEPALMFSIPRLAIVCGLVVYADGPLNLDRKVEDMSELFRPFHTLLRKIRDLLQTLTEEELHTLERNLCISQDVEFPIRADVQGPAALAPALSAPLPPEGPLSAKAKDPDAELACSMQYDDQELEQLSRMVHRAGDEMSSLLSPPIACQSPAHRPGAEGSPGGEASPGRPRLRSGSDEEERVFFMDDVEGTAEALARPESPAGPFGWAGSTWADPQEKGQGGPGGAAGISLPASEKEEDLSNNNLEAEGTDGASLAGTSSCSCLDSRLHLDGWEVGADDAETAEMIAHRTGGMKLSATVIFNPKSPTSLDSAVATQEAASEPVAEGMDGGPHKLSTGATNCLLHSCVCCGSCGDSREDVVERLREKCSPGGVIGASYAAGLAKASDRAPERQEEAPPPSEDASNGREPKAPTSDKCLPHTSGSQVDTASGLQGEAGVAGQQEPEARELHAGSPPAHEAPQALSGSSSSTAGSCSSDKMGPEAAPAATHAAPQATREKIRSRFHGSHDLIHRLFVCISGVADQLQTNYASDLRSILKTLFEVMATKPETDDKEKLRKVTQTLRSAALEDCALCQETLSSSELAAKTRDGDFEDPPEWVPDEACGFCTACKAPFTVIRRKHHCRSCGKIFCSRCSSHSAPLPRYGQVKPVRVCTHCYMFHVTPFYSDKAGL SW:ID LST2_HUMAN SW:DE RecName: Full=Lateral signaling target protein 2 homolog; Short=hLst2;AltName: Full=Zinc finger FYVE domain-containing protein 28; SW:GN Name=ZFYVE28; Synonyms=KIAA1643, LST2; SW:KW Alternative splicing; Complete proteome; Cytoplasm; Endosome;Isopeptide bond; Membrane; Metal-binding; Phosphoprotein;Polymorphism; Ubl conjugation; Zinc; Zinc-finger. SW:EXACT F SW:FUNC + BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 107->993|LST2_HUMAN|0.0|99.9|887/887| GO:SWS:NREP 4 GO:SWS GO:0005737|"GO:cytoplasm"|Cytoplasm| GO:SWS GO:0005768|"GO:endosome"|Endosome| GO:SWS GO:0016020|"GO:membrane"|Membrane| GO:SWS GO:0046872|"GO:metal ion binding"|Metal-binding| SEG 12->27|eprapvpasvraperp| SEG 32->41|rsarraacra| SEG 49->71|pahlpaarsalraslaslpatar| SEG 78->106|rvrpapqpgpgaalrraraarsparagaa| SEG 376->389|llqtlteeelhtle| SEG 408->428|gpaalapalsaplppegplsa| SEG 543->552|gqggpggaag| SEG 711->724|raperqeeapppse| SEG 787->799|sgsssstagscss| SEG 806->818|aapaathaapqat| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 920->979|2yqmA|3e-15|51.7|58/89| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 875->979|1aqeA|5e-11|21.1|90/110| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 920->979|PF01363|1e-17|58.3|60/68|FYVE| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 918->979|PF01363|7.2e-22|43.5|62/69|FYVE| RP:SCP:NREP 3 RP:SCP:REP 126->270|1sigA|5e-07|25.4|122/305|a.177.1.1| RP:SCP:REP 853->915|1lm3B|1e-12|15.9|63/106|a.24.3.1| RP:SCP:REP 919->979|1jocA1|3e-20|47.5|59/64|g.50.1.1| HM:SCP:REP 918->984|1wfkA_|2.1e-21|48.5|66/0|g.50.1.1|1/1|FYVE/PHD zinc finger| OP:NHOMO 1455 OP:NHOMOORG 183 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 11--DC7-313-324121212223-121-1212111112222322111211-2111222233111221-1211111211221111132-22123222122213351-K52IGGJJLGHBDBEIDYQAUBo*S9PJc8ECELAGMHABA9DM96TBIKGJ689FDEC4H89D59CB-2124---1145771432-7CBC- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 122 STR:RPRED 12.3 SQ:SECSTR ####################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################HHHHHHccccccEEEEcGGGTTccHHHHcTTccccccccccccHHHHcccccTTcTTccccccccccTTcHHHHHHccccccccHHHHHHcccHHHTTccccccccHHHHccHHHTTTcHHH### DISOP:02AL 1-3,6-6,8-8,15-15,62-64,401-435,444-495,518-527,535-588,629-658,680-855,885-886,890-892,896-919,987-994| PSIPRED ccccEEEcccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHcccHHccccccEEEEEcccccccHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHcHHHHHHHccccHHHHHHHHHHcccEEHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHcccHHHHEEcccHHHcccEEEcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHccccccccccccccHHHHHHccccccccHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccHHHccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHccccccccccccccccccccccccccccccccEEEEEEccccEEcccccccccccccHHHccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHcccccccccHHHccccccccccHHHHHHHHHccHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccHHHcccccccccccEEccHHHcccccccccccccEEccccHHHccccEEccccccEEEcccccccccEEEcHHHHHHHccccccccccc //