Homo sapiens (cDNA) (huge0)
Gene : KIAA1643
DDBJ : KIAA1643
Swiss-Prot:LST2_HUMAN RecName: Full=Lateral signaling target protein 2 homolog; Short=hLst2;AltName: Full=Zinc finger FYVE domain-containing protein 28;
Homologs Archaea 0/68 : Bacteria 0/915 : Eukaryota 183/199 : Viruses 0/175 --->[See Alignment]
a.177.1
a.24.3
g.50.1
:993 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB 920->979 2yqmA PDBj 3e-15 51.7 %
:RPS:PDB 875->979 1aqeA PDBj 5e-11 21.1 %
:RPS:SCOP 126->270 1sigA a.177.1.1 * 5e-07 25.4 %
:RPS:SCOP 853->915 1lm3B a.24.3.1 * 1e-12 15.9 %
:RPS:SCOP 919->979 1jocA1 g.50.1.1 * 3e-20 47.5 %
:HMM:SCOP 918->984 1wfkA_ g.50.1.1 * 2.1e-21 48.5 %
:RPS:PFM 920->979 PF01363 * FYVE 1e-17 58.3 %
:HMM:PFM 918->979 PF01363 * FYVE 7.2e-22 43.5 62/69
:BLT:SWISS 107->993 LST2_HUMAN 0.0 99.9 %
:SEG
SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links HUGE Abbreviations Back to title page
GT:ID KIAA1643
GT:ORG huge0
GT:GENE KIAA1643
GT:PRODUCT KIAA1643
GT:DATABASE huge2038
LENGTH 993
SQ:AASEQ PAERWVSVSSEEPRAPVPASVRAPERPLPGLRSARRAACRAYSGPRTCPAHLPAARSALRASLASLPATARGLRPCLRVRPAPQPGPGAALRRARAARSPARAGAAMMNRFRKWLYKPKRSDPQLLARFYYADEELNQVAAELDSLDGRKDPQRCTLLVSQFRSCQDNVLNIINQIMDECIPQDRAPRDFCVKFPEEIRHDNLAGQLWFGAECLAAGSIIMNRELESMAMRPLAKELTRSLEDVRGALRDQALRDLNTYTEKMREALRHFDVLFAEFELSYVSAMVPVKSPREYYVQQEVIVLFCETVERALDFGYLTQDMIDDYEPALMFSIPRLAIVCGLVVYADGPLNLDRKVEDMSELFRPFHTLLRKIRDLLQTLTEEELHTLERNLCISQDVEFPIRADVQGPAALAPALSAPLPPEGPLSAKAKDPDAELACSMQYDDQELEQLSRMVHRAGDEMSSLLSPPIACQSPAHRPGAEGSPGGEASPGRPRLRSGSDEEERVFFMDDVEGTAEALARPESPAGPFGWAGSTWADPQEKGQGGPGGAAGISLPASEKEEDLSNNNLEAEGTDGASLAGTSSCSCLDSRLHLDGWEVGADDAETAEMIAHRTGGMKLSATVIFNPKSPTSLDSAVATQEAASEPVAEGMDGGPHKLSTGATNCLLHSCVCCGSCGDSREDVVERLREKCSPGGVIGASYAAGLAKASDRAPERQEEAPPPSEDASNGREPKAPTSDKCLPHTSGSQVDTASGLQGEAGVAGQQEPEARELHAGSPPAHEAPQALSGSSSSTAGSCSSDKMGPEAAPAATHAAPQATREKIRSRFHGSHDLIHRLFVCISGVADQLQTNYASDLRSILKTLFEVMATKPETDDKEKLRKVTQTLRSAALEDCALCQETLSSSELAAKTRDGDFEDPPEWVPDEACGFCTACKAPFTVIRRKHHCRSCGKIFCSRCSSHSAPLPRYGQVKPVRVCTHCYMFHVTPFYSDKAGL
SW:ID LST2_HUMAN
SW:DE RecName: Full=Lateral signaling target protein 2 homolog; Short=hLst2;AltName: Full=Zinc finger FYVE domain-containing protein 28;
SW:GN Name=ZFYVE28; Synonyms=KIAA1643, LST2;
SW:KW Alternative splicing; Complete proteome; Cytoplasm; Endosome;Isopeptide bond; Membrane; Metal-binding; Phosphoprotein;Polymorphism; Ubl conjugation; Zinc; Zinc-finger.
SW:EXACT F
SW:FUNC +
BL:SWS:NREP 1
BL:SWS:REP 107->993|LST2_HUMAN|0.0|99.9|887/887|
GO:SWS:NREP 4
GO:SWS GO:0005737|"GO:cytoplasm"|Cytoplasm|
GO:SWS GO:0005768|"GO:endosome"|Endosome|
GO:SWS GO:0016020|"GO:membrane"|Membrane|
GO:SWS GO:0046872|"GO:metal ion binding"|Metal-binding|
SEG 12->27|eprapvpasvraperp|
SEG 32->41|rsarraacra|
SEG 49->71|pahlpaarsalraslaslpatar|
SEG 78->106|rvrpapqpgpgaalrraraarsparagaa|
SEG 376->389|llqtlteeelhtle|
SEG 408->428|gpaalapalsaplppegplsa|
SEG 543->552|gqggpggaag|
SEG 711->724|raperqeeapppse|
SEG 787->799|sgsssstagscss|
SEG 806->818|aapaathaapqat|
BL:PDB:NREP 1
BL:PDB:REP 920->979|2yqmA|3e-15|51.7|58/89|
RP:PDB:NREP 1
RP:PDB:REP 875->979|1aqeA|5e-11|21.1|90/110|
RP:PFM:NREP 1
RP:PFM:REP 920->979|PF01363|1e-17|58.3|60/68|FYVE|
HM:PFM:NREP 1
HM:PFM:REP 918->979|PF01363|7.2e-22|43.5|62/69|FYVE|
RP:SCP:NREP 3
RP:SCP:REP 126->270|1sigA|5e-07|25.4|122/305|a.177.1.1|
RP:SCP:REP 853->915|1lm3B|1e-12|15.9|63/106|a.24.3.1|
RP:SCP:REP 919->979|1jocA1|3e-20|47.5|59/64|g.50.1.1|
HM:SCP:REP 918->984|1wfkA_|2.1e-21|48.5|66/0|g.50.1.1|1/1|FYVE/PHD zinc finger|
OP:NHOMO 1455
OP:NHOMOORG 183
OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 11--DC7-313-324121212223-121-1212111112222322111211-2111222233111221-1211111211221111132-22123222122213351-K52IGGJJLGHBDBEIDYQAUBo*S9PJc8ECELAGMHABA9DM96TBIKGJ689FDEC4H89D59CB-2124---1145771432-7CBC- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
STR:NPRED 122
STR:RPRED 12.3
SQ:SECSTR ####################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################HHHHHHccccccEEEEcGGGTTccHHHHcTTccccccccccccHHHHcccccTTcTTccccccccccTTcHHHHHHccccccccHHHHHHcccHHHTTccccccccHHHHccHHHTTTcHHH###
DISOP:02AL 1-3,6-6,8-8,15-15,62-64,401-435,444-495,518-527,535-588,629-658,680-855,885-886,890-892,896-919,987-994|
PSIPRED ccccEEEcccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHcccHHccccccEEEEEcccccccHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHcHHHHHHHccccHHHHHHHHHHcccEEHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHcccHHHHEEcccHHHcccEEEcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHccccccccccccccHHHHHHccccccccHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccHHHccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHccccccccccccccccccccccccccccccccEEEEEEccccEEcccccccccccccHHHccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHcccccccccHHHccccccccccHHHHHHHHHccHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccHHHcccccccccccEEccHHHcccccccccccccEEccccHHHccccEEccccccEEEcccccccccEEEcHHHHHHHccccccccccc
//
[GTOP]
