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Agrobacterium tumefaciens str. C58 (atum0)
Chromosome : circular
Gene : AAK85911.2
DDBJ      :             MFS permease
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  1/68 : Bacteria  231/915 : Eukaryota  1/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
d.58.4f.38.1
:503 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   382->484 2bbeA PDBj 1e-14 10.9 %
:RPS:SCOP  390->484 1sqeA  d.58.4.5 * 5e-15 13.8 %
:HMM:SCOP  1->359 1pv7A_ f.38.1.2 * 2.6e-45 25.8 %
:RPS:PFM   1->337 PF05977 * DUF894 1e-53 38.6 %
:HMM:PFM   1->486 PF05977 * DUF894 4.9e-206 54.5 486/524  
:BLT:SWISS 5->243 YFIS_BACSU 2e-09 23.9 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID AAK85911.2 GT:GENE AAK85911.2 GT:PRODUCT MFS permease GT:DATABASE GIB00072CH01 GT:ORG atum0 GB:ACCESSION GIB00072CH01 GB:CHROMOSOME circular GB:LOCATION 94974..96485 GB:FROM 94974 GB:TO 96485 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT MFS permease GB:PROTEIN_ID AAK85911.2 GB:DB_XREF GI:159139488 LENGTH 503 SQ:AASEQ MMTSLSSSENMIALVQASTSLPIMMFSLISGALADSFDRRRIMISAQLLMLTASVLLTVFAWSGWLTPWLLLFFTFMIGCGTALNNPSWQASVGEMVPREDLPAAVTLNSVGFNITRSVGPAIGGIIVAAAGAAAAFFVNALSYFTLIYALFRWQPPKYASTLPREQLLAAISAGMRYVAMSPNIGKVLVRGFLFGLSASAILALMPIVARDLVEGGPLTYGVMLGAFGVGAIGGALVSARLREVMSSEWIVRVAFLGFAFSSGVTAVSTSSIITSLVLAIAGACWVLALSLFNTIVQLSTPRWVVGRALSLYQTLTFGGIAVGSWLWGELAEDYGISYSLLCSCVLMLLGVVVGLKLAMPAFASLNLDPLNRFVEPPLRLDVKPRSGPIAILIDYEIHDEDLGEFLPLMAERRRIRLRDGARNWNLMRDLENPDIWTESYHVPTWVEYVRHNHRRTQADAEAWDRLLELHRGKTRPRVHRMIERQTIPPTDDIFHKPHTDQH GT:EXON 1|1-503:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 5->243|YFIS_BACSU|2e-09|23.9|230/417| TM:NTM 11 TM:REGION 9->31| TM:REGION 42->64| TM:REGION 66->88| TM:REGION 126->148| TM:REGION 166->188| TM:REGION 190->212| TM:REGION 220->241| TM:REGION 248->270| TM:REGION 276->298| TM:REGION 307->329| TM:REGION 342->364| SEG 65->76|wltpwlllfftf| SEG 122->136|aiggiivaaagaaaa| SEG 262->282|ssgvtavstssiitslvlaia| SEG 340->358|sllcscvlmllgvvvglkl| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 382->484|2bbeA|1e-14|10.9|101/103| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 1->337|PF05977|1e-53|38.6|337/402|DUF894| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 1->486|PF05977|4.9e-206|54.5|486/524|DUF894| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 390->484|1sqeA|5e-15|13.8|94/101|d.58.4.5| HM:SCP:REP 1->359|1pv7A_|2.6e-45|25.8|357/417|f.38.1.2|1/1|MFS general substrate transporter| OP:NHOMO 312 OP:NHOMOORG 233 OP:PATTERN --------------------------------------------------1----------------- 23314--------11------2---2------11111211111222--222-3221-2--11111-11211------------------------------1---21--1---------------11111-1111111223---1---12-----------------2-1--------------111111-1-------------1-1---------1---------------------------------------11---------11-----------------------------------------------------1--1------------------------1---121111---1111111--111-----11111-511--121121-112--12112------1--241--222122313241111---411111-----------121--1-------------------------------1131--11---1111121111111-1111111-1121211---1-211212-22---1--1-----------11--1--------1---1-2--2-1--1-1--211----11-----------------------------------------------------------------1--1-----------------------------------------------------------------------------------------------12-------------------------1-2222---111-1-----------------------------1111111-----------------------------------------------------1-----1-----1 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 107 STR:RPRED 21.3 SQ:SECSTR #############################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################ccEEccccEEEEEEEEEcTTcHHHHHHHHHTTHHHHTcTTEEEEEEEEccccTTEEEEEEEEccHHHHHHHHHHTcHHHHHHHHHTHHHHEEEEEEEEEccEEcccc############### DISOP:02AL 156-170,416-416,495-504| PSIPRED ccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHcccccccccccccccccccccccEEEEEEEEccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHEcccccHHHHHHccccHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEEEcccccccccccccccccccc //