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Agrobacterium tumefaciens str. C58 (atum0)
Chromosome : circular
Gene : AAK86312.2
DDBJ      :             conserved hypothetical protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  304/915 : Eukaryota  62/199 : Viruses  1/175   --->[See Alignment]
a.118.18a.20.1a.86.1c.1.15
:1248 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   983->1115 1ouvA PDBj 4e-11 27.1 %
:BLT:PDB   1186->1246 3bkhA PDBj 2e-04 31.1 %
:RPS:PDB   133->400 3dmqA PDBj 6e-07 9.7 %
:RPS:PDB   973->1157 3e4bD PDBj 4e-27 18.2 %
:RPS:PDB   1187->1245 2bh7A PDBj 4e-05 11.9 %
:RPS:SCOP  132->209 1a0cA  c.1.15.3 * 3e-05 20.8 %
:RPS:SCOP  858->894 1bt1A  a.86.1.2 * 2e-04 18.9 %
:RPS:SCOP  997->1119 1klxA  a.118.18.1 * 5e-17 21.4 %
:RPS:SCOP  1186->1246 1lbuA1  a.20.1.1 * 9e-08 21.3 %
:HMM:SCOP  977->1135 1ouvA_ a.118.18.1 * 2e-30 35.2 %
:HMM:SCOP  1174->1243 1lbuA1 a.20.1.1 * 1.2e-10 24.3 %
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:HMM:PFM   1093->1127 PF08238 * Sel1 9.1e-09 37.1 35/39  
:HMM:PFM   1190->1243 PF01471 * PG_binding_1 3.7e-12 27.8 54/57  
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:BLT:SWISS 449->560 DNLJ_XANC5 8e-06 36.9 %
:BLT:SWISS 983->1243 PODJ_CAUCR 4e-22 30.3 %
:TM
:REPEAT 2|978->1047|1050->1119
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID AAK86312.2 GT:GENE AAK86312.2 GT:PRODUCT conserved hypothetical protein GT:DATABASE GIB00072CH01 GT:ORG atum0 GB:ACCESSION GIB00072CH01 GB:CHROMOSOME circular GB:LOCATION complement(485874..489620) GB:FROM 485874 GB:TO 489620 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT conserved hypothetical protein GB:PROTEIN_ID AAK86312.2 GB:DB_XREF GI:159139660 LENGTH 1248 SQ:AASEQ 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------1-----336-----1111-1------------------------21-112--1111----111--1---11-11-----------------------836153c---------1-------------2----------1-----1-------2---131--1-23--21---QA211--3112-12--4423* --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---- STR:NPRED 508 STR:RPRED 40.7 SQ:SECSTR 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DISOP:02AL 1-18,37-75,85-106,130-136,138-139,305-310,528-540,568-580,629-792,802-829,860-928,1247-1249| PSIPRED ccccHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHcccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHcccccccccccHHHHHcccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHccccccccHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHcccccccccccccccccHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHccHHHHcccHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHcc 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