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Agrobacterium tumefaciens str. C58 (atum0)
Chromosome : circular
Gene : AAK86424.2
DDBJ      :             ABC transporter, membrane spanning protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  20/68 : Bacteria  448/915 : Eukaryota  2/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
f.58.1
:526 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   33->214 2onkC PDBj 5e-10 25.9 %
:RPS:PDB   151->182 3dhwA PDBj 5e-09 34.4 %
:RPS:PDB   429->459 3dhwA PDBj 2e-07 38.7 %
:RPS:SCOP  15->206 2r6gG1  f.58.1.1 * 2e-14 16.5 %
:RPS:SCOP  304->518 2r6gG1  f.58.1.1 * 9e-12 15.6 %
:RPS:PFM   132->198 PF00528 * BPD_transp_1 8e-04 41.8 %
:HMM:PFM   46->235 PF00528 * BPD_transp_1 2.8e-15 28.0 164/185  
:HMM:PFM   332->514 PF00528 * BPD_transp_1 3.8e-08 21.9 160/185  
:HMM:PFM   219->290 PF09323 * DUF1980 0.00023 20.3 59/182  
:BLT:SWISS 33->518 FBPB2_HAEIN 1e-27 25.8 %
:TM
:REPEAT 2|152->208|429->488
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID AAK86424.2 GT:GENE AAK86424.2 GT:PRODUCT ABC transporter, membrane spanning protein GT:DATABASE GIB00072CH01 GT:ORG atum0 GB:ACCESSION GIB00072CH01 GB:CHROMOSOME circular GB:LOCATION complement(600771..602351) GB:FROM 600771 GB:TO 602351 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT ABC transporter, membrane spanning protein GB:PROTEIN_ID AAK86424.2 GB:DB_XREF GI:159139702 LENGTH 526 SQ:AASEQ MPILAIFWLALTGSTEGWQHLLANVLPRAGFRTFILLGLTAATTAFFGIVCAWLVTTFEFPLRRILSAALVLPLAIPSYLAAYAFGEFLDFTGPVQSAVRAAFGYHSIRDYWFPDIRSLGGAVIVLSSVLYPYVYLSARAALSMQGRFAAEAARTLGAKPLNVFFSVQLPMARPAIAIGLSLVLMETLNDIGAVEYLGVQTLTFTIYETWLNRGNLANATQIAAVILIIVSALIVIERNAREKQRFGAPKATSMAQRHRLKALAGWRRWCASLFCFLPVASGFFIPVIVLGGYAAKRLDALFQPKLLKALGHSLEVSLSAAFLTLIAAFVFSYAIRTERSRLSKVAARLGSMGYGVPGTVLAIGVLIPLASLDNGVDGFIRSHFGFSSGLLLSGTAFAIIYAHAVRFMTMAEGTLDAGFHKLSPHIDMASRSLGRNRAQTLFKVLLPNMRPAALTAFLLVLIESMKELPATILLRPFGFNTLATLVYEDASRSRVQDAAVPAIIIIMAGLIPVLLVSKSMDHPEHH GT:EXON 1|1-526:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 33->518|FBPB2_HAEIN|1e-27|25.8|445/506| TM:NTM 11 TM:REGION 3->25| TM:REGION 34->56| TM:REGION 65->87| TM:REGION 119->140| TM:REGION 162->184| TM:REGION 217->238| TM:REGION 272->294| TM:REGION 315->337| TM:REGION 353->375| TM:REGION 384->406| TM:REGION 497->519| NREPEAT 1 REPEAT 2|152->208|429->488| SEG 222->236|iaaviliivsalivi| SEG 384->394|fgfssglllsg| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 33->214|2onkC|5e-10|25.9|170/252| RP:PDB:NREP 2 RP:PDB:REP 151->182|3dhwA|5e-09|34.4|32/203| RP:PDB:REP 429->459|3dhwA|2e-07|38.7|31/203| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 132->198|PF00528|8e-04|41.8|67/195|BPD_transp_1| HM:PFM:NREP 3 HM:PFM:REP 46->235|PF00528|2.8e-15|28.0|164/185|BPD_transp_1| HM:PFM:REP 332->514|PF00528|3.8e-08|21.9|160/185|BPD_transp_1| HM:PFM:REP 219->290|PF09323|0.00023|20.3|59/182|DUF1980| GO:PFM:NREP 3 GO:PFM GO:0005215|"GO:transporter activity"|PF00528|IPR000515| GO:PFM GO:0006810|"GO:transport"|PF00528|IPR000515| GO:PFM GO:0016020|"GO:membrane"|PF00528|IPR000515| RP:SCP:NREP 2 RP:SCP:REP 15->206|2r6gG1|2e-14|16.5|176/284|f.58.1.1| RP:SCP:REP 304->518|2r6gG1|9e-12|15.6|202/284|f.58.1.1| OP:NHOMO 811 OP:NHOMOORG 470 OP:PATTERN 111-1-----------1-------22211121------12111--------------2--1------- ----1---------2--11-12--121111111111-142--1---1-------1-1-----------1----------11-1-------------------------1----------------------12---11121--12111131111133111111112112211111111111111--11------1-1-1331-11131113----113---1--1------34-----------------------------------------------------------1-------------------------------1---------------11-11-3-1--21211111112-1--------2------1-------1-1--31233234433444442-11211111121-266-2414342224-111253533221----------1----21111111111---------------11111-----24332111212-233322-1333321211112---1123312231112111311111111111111-1112-1--1-2-1-2111-1------1-----2--12--1-111111----------------21113-1112112222-11222212112112---111------21431121--1111111-1111111111111111--22227722332333333323333332111--111-433333333333-2-1----------1115---32-111--3222------22223433223343533332222----------12222222211132----1--111----11-111----------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------1-------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 213 STR:RPRED 40.5 SQ:SECSTR ################################HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHcTTcTTTTTccccccTcccTTcTTTcTTcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHTHHHHHTccTHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHTTcccccHHHHHHHHHHHc######################################################################################################################################################################################################################HHHHHTccTHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHH################################################################### DISOP:02AL 241-263,519-519,522-527| PSIPRED ccEEEEEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcEEEEEcccHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcEEEEEccccccHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccc //