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Agrobacterium tumefaciens str. C58 (atum0)
Chromosome : circular
Gene : AAK86645.2
DDBJ      :             MFS permease
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  39/68 : Bacteria  714/915 : Eukaryota  105/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
f.38.1
:507 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   60->202 2gfpA PDBj 2e-10 25.2 %
:RPS:PDB   79->191 2d33D PDBj 1e-06 7.1 %
:RPS:SCOP  2->195 1pw4A  f.38.1.1 * 6e-16 14.9 %
:HMM:SCOP  1->498 1pw4A_ f.38.1.1 * 1.3e-72 32.3 %
:RPS:PFM   32->394 PF07690 * MFS_1 2e-24 34.0 %
:HMM:PFM   23->415 PF07690 * MFS_1 3e-50 30.7 342/353  
:BLT:SWISS 32->422 BMR3_BACSU 2e-44 25.9 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID AAK86645.2 GT:GENE AAK86645.2 GT:PRODUCT MFS permease GT:DATABASE GIB00072CH01 GT:ORG atum0 GB:ACCESSION GIB00072CH01 GB:CHROMOSOME circular GB:LOCATION 836902..838425 GB:FROM 836902 GB:TO 838425 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT MFS permease GB:PROTEIN_ID AAK86645.2 GB:DB_XREF GI:159139798 LENGTH 507 SQ:AASEQ MSTAPVAPLVSDHRRRLIVFLFLMLAMFMATLDNQIVSTALPTIVGEFGALERFGWIGSAYLLATSAVMPVYGKLGDLFGRKYVMIAAVVIFTLGSLACGLAWSMDSLIAARVLQGLGGGGIMVSIFSVNADLFEPRERARYQSYSSLTIMASGSVGPILGGTMSDLFGWRSIFLINLPLGIIVIAGLALMLPYRRPARQPKIDYLGAVLLAATIASVVFWADSSELFGSLIAAPSLGIIAFAVIAAFLWVQVERRAPEPVVPLRLFKDSTFPLLMIVSLTSGGIGIGMVNYYALFLQTTTGLSPSHAGLFFIAVTGGIVMGSLSAGRLISITGVYKPFSVAGLTINVLVMLLFTQMHAGTPLWLIAVLMLAQGFAVGLGQQAPIIGVQNSAPKADIGAASGAVTLTRMGGAAIAISVYGAIVSSSLKGVAIDIPGVGRIEELTPKMLAELPATSQAAVASLYSDAFTPLFFAAAATAAIGLAAALMLKPVRLPAAVEAKPAEAAGE GT:EXON 1|1-507:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 32->422|BMR3_BACSU|2e-44|25.9|390/512| TM:NTM 11 TM:REGION 6->28| TM:REGION 83->105| TM:REGION 112->134| TM:REGION 171->192| TM:REGION 201->223| TM:REGION 229->251| TM:REGION 272->294| TM:REGION 310->332| TM:REGION 348->370| TM:REGION 415->437| TM:REGION 469->491| SEG 20->30|flflmlamfma| SEG 466->486|aftplffaaaataaiglaaal| SEG 494->505|paaveakpaeaa| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 60->202|2gfpA|2e-10|25.2|143/375| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 79->191|2d33D|1e-06|7.1|113/499| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 32->394|PF07690|2e-24|34.0|315/347|MFS_1| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 23->415|PF07690|3e-50|30.7|342/353|MFS_1| GO:PFM:NREP 1 GO:PFM GO:0055085|"GO:transmembrane transport"|PF07690|IPR011701| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 2->195|1pw4A|6e-16|14.9|194/434|f.38.1.1| HM:SCP:REP 1->498|1pw4A_|1.3e-72|32.3|409/447|f.38.1.1|1/1|MFS general substrate transporter| OP:NHOMO 6489 OP:NHOMOORG 858 OP:PATTERN ------9655555585-5111--2--------2121--1111-AB53411441----11-1566---- 5374t449AAD656B68AA-A922KB99999AA98AJWWP6J9NDBA44972CBD617--HJ93B8HTVP24222433-2633131113311-2-----1-61--E-3-3--------------11111111111-7665621153--2------11------1--2--31------------4541---382BAABABBBE8CEBBBC62986ABBB3344552666666CO365565555555555A55695772DF36525ED77C964785887522211--123-----------11111111111111-----1---1--9C111212121135BB1333-----3--2-784331-23321111--11-B4472113234EAD524885553467456566C-55555A5B6G1-N886DG8GKH6A85-2112-22222226666666644434215--1--111----1111111111111-----278445988CTXaYaTIGGGFMMUSIIGI9LcMUAHEH--C9D22A44B485E3352-213631222222---224115142321312241412221421552591121-21-11-1-2-1--------111-55777332-121223333333444122221331-1---1------BD973A49998998988-998887B88899A999996DKFADAB68658777787868688G886878721B77777777777---176465444411566111132-2211-22399899441223198888HFG47894378833333533324554555556434355545443221-----1-11----------------------------------------12---11111231 ----111----1-16OQfHfchcu**jMMIMJMlcVIQJPHOPHEFdPJodd*jMNVUNJJM66626A4632A4D25447577776A6-OMBQ6GAD9BED2AE9C--5----1---------------------------------------2----2----1---------------9-------2-Z----2---- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 143 STR:RPRED 28.2 SQ:SECSTR ###########################################################HHHHHHHHHHTTHHHHHTTccTTccccccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHTTccEETTEEccccccccccGGGccccEEEEcccTTccHHHHHHHHcccEEEEEEEEccTTcTTcccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccTTTccc################################################################################################################################################################################################################################################################################################################# DISOP:02AL 1-10,444-448,490-508| PSIPRED ccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccc //