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Agrobacterium tumefaciens str. C58 (atum0)
Chromosome : circular
Gene : fbpA3
DDBJ      :fbpA3        ABC transporter, membrane spanning protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  17/68 : Bacteria  484/915 : Eukaryota  2/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
f.58.1
:558 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   88->273 3d31C PDBj 2e-10 25.1 %
:RPS:PDB   183->217 3dhwA PDBj 1e-06 25.7 %
:RPS:SCOP  116->278 2r6gG1  f.58.1.1 * 4e-15 18.4 %
:RPS:SCOP  293->556 2r6gG1  f.58.1.1 * 3e-06 10.1 %
:RPS:PFM   98->233 PF00528 * BPD_transp_1 4e-08 37.6 %
:HMM:PFM   81->280 PF00528 * BPD_transp_1 1.1e-17 25.6 176/185  
:HMM:PFM   360->553 PF00528 * BPD_transp_1 5.4e-11 21.9 169/185  
:BLT:SWISS 84->552 FBPB2_HAEIN 8e-22 25.7 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID AAK86223.1 GT:GENE fbpA3 GT:PRODUCT ABC transporter, membrane spanning protein GT:DATABASE GIB00072CH01 GT:ORG atum0 GB:ACCESSION GIB00072CH01 GB:CHROMOSOME circular GB:LOCATION 404550..406226 GB:FROM 404550 GB:TO 406226 GB:DIRECTION + GB:GENE fbpA3 GB:PRODUCT ABC transporter, membrane spanning protein GB:PROTEIN_ID AAK86223.1 GB:DB_XREF GI:15155325 GB:GENE:GENE fbpA3 LENGTH 558 SQ:AASEQ MNPDTIQPLPPRTRARFSSTFWWLGLSLLAVCGAMVPVLALVSQAVQGSEGLWDHLGATVLWTALPDTAILLAGVGLLAGVVGTSAAWLVTAYDFPGRRVLEWALLLPLAMPTYIVAYAYLDILHPIGPVQGAIRWLLGYSSPREFRLPDIRSTVGCIVLLGFVLFPYVYIPVRAMFLTQAGNLLEVARTLGVSRRAAFFKVAVPLARPAIAVGVSLALMEALNDIGASEFLGVRTLTVSVYTTWVTKSDLPGAAQIALSMLFIVVALVALERWARRKQRYSVSAQKSRELEPLRLTGPRGWAAFTLGSLPVLIGFVGPASYLVIEAWKRFRFSGLSVRFADEAVNTIVFAGLATLITLILGLAVAYAMRLAPGRLSLWSYRLSTVGYAAPGTVIAIGVLIALGGFDRFVDQTMRDWFGISTGLIFIGSGAALIYAYSARFLTIAAGGVDAGLSRIPHSFDHASRTLGRSATQTFRQIHLPLSKASLAAAALLIFVDCVKELPATLLLRPLNFETFATHLYGEAARGTYEEASIAALAIVVIGMLPVVLLARIGRRKG GT:EXON 1|1-558:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 84->552|FBPB2_HAEIN|8e-22|25.7|428/506| TM:NTM 12 TM:REGION 23->45| TM:REGION 65->87| TM:REGION 101->123| TM:REGION 153->175| TM:REGION 199->221| TM:REGION 252->274| TM:REGION 303->325| TM:REGION 346->368| TM:REGION 389->411| TM:REGION 422->444| TM:REGION 479->501| TM:REGION 532->554| SEG 71->83|llagvgllagvvg| SEG 351->364|aglatlitlilgla| SEG 480->493|lplskaslaaaall| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 88->273|3d31C|2e-10|25.1|175/248| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 183->217|3dhwA|1e-06|25.7|35/203| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 98->233|PF00528|4e-08|37.6|125/195|BPD_transp_1| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 81->280|PF00528|1.1e-17|25.6|176/185|BPD_transp_1| HM:PFM:REP 360->553|PF00528|5.4e-11|21.9|169/185|BPD_transp_1| GO:PFM:NREP 3 GO:PFM GO:0005215|"GO:transporter activity"|PF00528|IPR000515| GO:PFM GO:0006810|"GO:transport"|PF00528|IPR000515| GO:PFM GO:0016020|"GO:membrane"|PF00528|IPR000515| RP:SCP:NREP 2 RP:SCP:REP 116->278|2r6gG1|4e-15|18.4|163/284|f.58.1.1| RP:SCP:REP 293->556|2r6gG1|3e-06|10.1|249/284|f.58.1.1| OP:NHOMO 873 OP:NHOMOORG 503 OP:PATTERN --1-1-----------1-------11111111--------------1--------1-2222------- -1--1---------2--11-1---12111111----1243--11----1-----1-------------1----------2111-------------------------1-----------------------1---11111--1211112222223311111111222321111111111111---11------1-1-1331111131122----113---2--1------23-------------------1-----------------------------------------------------------------------1--21111-11-1---11-11-1-2--21211111111-1-------11---1--1-----21-111111332233333333332-22322222232-16611214521232-111173533311-------------1121111111111---------------11111-----21122222222223332221233323322212---221222223122223321111111222222211122-111112---3112-11---112---1-21--2--1-111111----------------22212-1112113333-11333414114111---111------12431312112222222-2222222222222222112323661113333333332333333222211221-211111111111---1---------21214---21-111--211311111121113222223533234342222----------12212222212143-------111111111-1-----------------------------------------------------1- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------1-------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 185 STR:RPRED 33.2 SQ:SECSTR ###################################################################################HHHHHHHTTcccTTHHHHHHHHHGGGTccHHHHHHHHHHHHcTTc####cTTcTTTTTGGGTTTcccTTcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHTTTTHHHHHTccTHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTccHHHHHHHcTTccHHHHHHHHHcT#TTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHc############################################################################################################################################################################################################################################################################################# DISOP:02AL 277-297, 557-558| PSIPRED cccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcEEEEEcccccccHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccc //