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Agrobacterium tumefaciens str. C58 (atum0)
Chromosome : circular
Gene : flhA
DDBJ      :flhA         flagellar biosynthesis protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  500/915 : Eukaryota  3/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.4.5
:695 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   588->653 1qvbA PDBj 1e-04 31.8 %
:RPS:PDB   432->610 1bvoA PDBj 2e-26 14.3 %
:RPS:SCOP  501->586 1w7pD2  a.4.5.54 * 1e-11 9.4 %
:RPS:PFM   28->688 PF00771 * FHIPEP e-139 41.8 %
:HMM:PFM   28->687 PF00771 * FHIPEP 2.5e-237 44.2 654/658  
:BLT:SWISS 18->695 FLHA_BRUME 0.0 69.0 %
:TM
:COIL
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID AAK86392.2 GT:GENE flhA GT:PRODUCT flagellar biosynthesis protein GT:DATABASE GIB00072CH01 GT:ORG atum0 GB:ACCESSION GIB00072CH01 GB:CHROMOSOME circular GB:LOCATION 564582..566669 GB:FROM 564582 GB:TO 566669 GB:DIRECTION + GB:GENE flhA GB:PRODUCT flagellar biosynthesis protein GB:PROTEIN_ID AAK86392.2 GB:DB_XREF GI:159139685 GB:GENE:GENE flhA LENGTH 695 SQ:AASEQ MAQPPVISLPKVSPSMRDIGFALGIISILCVLFLPIPVMLVDIGLAFSIALSVLILMVALWIQRPLDFSSFPTVLLIATMIRLSLNIATTRVILSHGNEGPTAAGGVIAGFSSLVMSGDFVIGLIVFLILITVNFIVITKGATRIAEVGARFTLDAIPGKQMSIDADLSAGIIDEKEAQRRRRELEEESSFFGSMDGASKFVRGDAIAGLIITAINVFGGIIIGYFRHGMPIGEAADVFVKLSVGDGIVSQIPALIVSLAAGLLVSRGGTAGSTDQAVINQLSGYPRALMVSAMLMGLLAVIPGLPFVPFIFLGGIMAFGSWYIPRQAEAESALRRQEEENKVLQTTEAEKDSVKQVLKTAEIELALGKQVSTRLLGAHQELAFRVGKMRKKFATQYGFVVPEIKVSDDIMIPEKAYQIRVHGTTIASSNLRVGDVLVVTGAGRKPSIPGDEIREPAFGMPAVSILETFTEDLKREGFHPIDNVSVVLTHLSEVIRNNLPQLLSYKDVKILIDRLDPEYKKLADEICSSHMSYSGLQAVLKLLLAERVSIRNLHLILEAVAELAPHVRKTEQIVEHVRVRMSQQLCGDLADNGVLRVLRLGNKWDMVFHQALKRDQKGEIVEFDIDPRHLEEFSEQASKVIREFMDRGLPFVLVTSPETRSYVRMIIERLFATLPVLSHVELAKGLEIKILGAIS GT:EXON 1|1-695:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 18->695|FLHA_BRUME|0.0|69.0|678/723| COIL:NAA 30 COIL:NSEG 1 COIL:REGION 327->356| TM:NTM 7 TM:REGION 13->35| TM:REGION 42->64| TM:REGION 71->93| TM:REGION 112->134| TM:REGION 204->226| TM:REGION 246->268| TM:REGION 291->313| SEG 120->131|fviglivflili| SEG 175->188|ekeaqrrrreleee| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 588->653|1qvbA|1e-04|31.8|66/481| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 432->610|1bvoA|2e-26|14.3|161/175| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 28->688|PF00771|e-139|41.8|653/656|FHIPEP| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 28->687|PF00771|2.5e-237|44.2|654/658|FHIPEP| GO:PFM:NREP 2 GO:PFM GO:0009306|"GO:protein secretion"|PF00771|IPR001712| GO:PFM GO:0016020|"GO:membrane"|PF00771|IPR001712| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 501->586|1w7pD2|1e-11|9.4|85/117|a.4.5.54| OP:NHOMO 748 OP:NHOMOORG 503 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- 1111------------------------------------1---1---1----1--------1-1------------------11111--------------------1-222222222222221--------------------1---------------------------------------------11111111-111111111111111111111111111111111------------------------------------------------------------------------------------------12111111111111111111---111--111111111111111111-1--11111111----1131111112112--12--11111-2222212222112111223111111-1111112222111--------1111-121--------------------------------111121123222532333122214445141222111--112112111--121111211141-------111111111-1111111222211111111122122-1-1111-1111111111111111111---13-111111111312131211121122221---11-111111121122131442122222-4212222222423221112---2132233233333333333331111211241333345524343--2------1111--411-------------------------1122121111311111232---------1111211111341111122222223------111111111111111111--------------------------1-11111111-1- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------1--------------1---------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 261 STR:RPRED 37.6 SQ:SECSTR ##################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################ccEEEEETTEEEEEEGGGTEEEEEEEcccccccTTcEE#EEETTTTccccccGGGcccccccccTTcccccccccEEEEEEEEEEEcccccccccEEEEEEEccccTTccccccEEEcTTTEETTEEEE#####EccTTTcEEEccccEEEcccHHHHHHHHHHHHHHTccTTccTTGGGTcGGGccTTEEEEEEEEEEEcHHHccTTcEEEEcccEEcccEEccEEEcTTccEEEEcccHHHHHHHHHHccHHHHHHHTTTcEEEE########################################## DISOP:02AL 1-5,7-9,175-188,324-357,614-618| PSIPRED ccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEcccccHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHcccccHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEcccccccEEEEEEEEEEEEEEEEEccEEEEEccccccccccccccccccccccEEEccHHHHHHHHHcccEEccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEEcHHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEcccHHHHHHHHHHHHccccEEEEHHHcccccEEEEEEEEc //