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Agrobacterium tumefaciens str. C58 (atum0)
Chromosome : circular
Gene : gdh
DDBJ      :gdh          NAD-glutamate dehydrogenase
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  266/915 : Eukaryota  84/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
b.90.1c.2.1c.58.1d.194.1e.45.1
:1585 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   726->1229 1bgvA PDBj 2e-39 19.1 %
:RPS:SCOP  484->709 1nh1A  e.45.1.1 * 2e-24 12.1 %
:RPS:SCOP  742->902 1b26A2  c.58.1.1 * 5e-23 18.5 %
:RPS:SCOP  920->986 2f9zC1  d.194.1.3 * 2e-07 29.0 %
:RPS:SCOP  1005->1111 1lktA  b.90.1.1 * 1e-32 10.2 %
:HMM:SCOP  741->944 1gtmA2 c.58.1.1 * 5.5e-27 30.7 %
:HMM:SCOP  932->1268 1hwxA1 c.2.1.7 * 2e-29 25.5 %
:RPS:PFM   87->1581 PF05088 * Bac_GDH 0.0 50.3 %
:HMM:PFM   86->1579 PF05088 * Bac_GDH 0 48.3 1487/1528  
:BLT:SWISS 644->1158 DHE2_NEUCR 2e-21 29.4 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID AAK88481.1 GT:GENE gdh GT:PRODUCT NAD-glutamate dehydrogenase GT:DATABASE GIB00072CH01 GT:ORG atum0 GB:ACCESSION GIB00072CH01 GB:CHROMOSOME circular GB:LOCATION 2766767..2771524 GB:FROM 2766767 GB:TO 2771524 GB:DIRECTION + GB:GENE gdh GB:PRODUCT NAD-glutamate dehydrogenase GB:PROTEIN_ID AAK88481.1 GB:DB_XREF GI:15157988 GB:GENE:GENE gdh LENGTH 1585 SQ:AASEQ 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GT:EXON 1|1-1585:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 644->1158|DHE2_NEUCR|2e-21|29.4|469/1050| SEG 1446->1456|lleeldtlsll| SEG 1512->1527|rsqdqisssrrrivis| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 726->1229|1bgvA|2e-39|19.1|423/449| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 87->1581|PF05088|0.0|50.3|1481/1516|Bac_GDH| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 86->1579|PF05088|0|48.3|1487/1528|Bac_GDH| RP:SCP:NREP 4 RP:SCP:REP 484->709|1nh1A|2e-24|12.1|206/290|e.45.1.1| RP:SCP:REP 742->902|1b26A2|5e-23|18.5|157/175|c.58.1.1| RP:SCP:REP 920->986|2f9zC1|2e-07|29.0|62/152|d.194.1.3| RP:SCP:REP 1005->1111|1lktA|1e-32|10.2|98/104|b.90.1.1| HM:SCP:REP 741->944|1gtmA2|5.5e-27|30.7|166/178|c.58.1.1|1/1|Aminoacid dehydrogenase-like, N-terminal domain| HM:SCP:REP 932->1268|1hwxA1|2e-29|25.5|267/293|c.2.1.7|1/1|NAD(P)-binding Rossmann-fold domains| OP:NHOMO 389 OP:NHOMOORG 350 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- 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DISOP:02AL 1-6, 131-140, 258-270, 1583-1585| PSIPRED ccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEcccccccccccEEEEEEEEccccHHHHHHHHHHHHcccEEEEEEccEEEEEEcccccEEEcccccccccEEEEEEEEccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHccEEEEEEEEEEEEEccccEEEEEcccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHccccEEEEEEcccccEEEccccccEEEEEEEcccccEEEEEEEEEEHHHHHHHccHHHccHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHcccHHHccccHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEEcccccEEEEEEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEEEEccccEEEEEEEEEEcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHccHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEEEcccccccEEEEEEEEccccccHHHcccHHHHccEEEEEcccEEEEEcccccccEEEEEEEEEEEcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEcccccccEEEEEEEcHHHccccccccccEEEEEEccEEEEEEEEccccccccEEEccccccHHHHHHHHHHHHHccccccccccccEEEEEccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHccccccccEEcccccccccccEEEHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccEEEEEEccccccHHHHHHHHccccEEEEEEEccEEEEccccccHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHcccccEEEEccccccccHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHccccEEEEcccccEEcccccccHHHHHHHccccccccccccEEEEEEcccccccHHHHHHHHHcccEEEccccccccccEEHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHccccHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcc 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