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Agrobacterium tumefaciens str. C58 (atum0)
Chromosome : circular
Gene : kefA
DDBJ      :kefA         potassium efflux system KEFA
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  45/68 : Bacteria  617/915 : Eukaryota  3/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
b.38.1d.58.43f.34.1
:835 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   608->769 2vv5A PDBj 3e-19 32.9 %
:RPS:SCOP  519->574 2oauA3  f.34.1.1 * 2e-04 21.8 %
:RPS:SCOP  606->670 2oauA1  b.38.1.3 * 4e-20 32.3 %
:RPS:SCOP  672->771 2oauA2  d.58.43.1 * 7e-26 29.3 %
:HMM:SCOP  517->603 2oauA3 f.34.1.1 * 1e-12 26.7 %
:HMM:SCOP  604->670 2oauA1 b.38.1.3 * 3.2e-19 43.3 %
:HMM:SCOP  672->773 2oauA2 d.58.43.1 * 1e-25 41.6 %
:RPS:PFM   598->761 PF00924 * MS_channel 6e-35 42.3 %
:HMM:PFM   565->762 PF00924 * MS_channel 1.7e-54 37.4 198/207  
:HMM:PFM   520->556 PF05552 * TM_helix 7.9e-06 16.7 36/53  
:HMM:PFM   128->154 PF12607 * DUF3772 0.0002 25.9 27/64  
:BLT:SWISS 498->773 KEFA_ECOLI 8e-34 33.6 %
:TM
:COIL
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID AAK87411.2 GT:GENE kefA GT:PRODUCT potassium efflux system KEFA GT:DATABASE GIB00072CH01 GT:ORG atum0 GB:ACCESSION GIB00072CH01 GB:CHROMOSOME circular GB:LOCATION complement(1620412..1622919) GB:FROM 1620412 GB:TO 1622919 GB:DIRECTION - GB:GENE kefA GB:PRODUCT potassium efflux system KEFA GB:PROTEIN_ID AAK87411.2 GB:DB_XREF GI:159140131 GB:GENE:GENE kefA LENGTH 835 SQ:AASEQ 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HM:SCP:REP 517->603|2oauA3|1e-12|26.7|86/0|f.34.1.1|2/2|Mechanosensitive channel protein MscS (YggB), transmembrane region| HM:SCP:REP 604->670|2oauA1|3.2e-19|43.3|67/0|b.38.1.3|1/1|Sm-like ribonucleoproteins| HM:SCP:REP 672->773|2oauA2|1e-25|41.6|101/0|d.58.43.1|1/1|Mechanosensitive channel protein MscS (YggB), C-terminal domain| OP:NHOMO 1578 OP:NHOMOORG 665 OP:PATTERN 22-1321-----------1----1522224761-1221333331223124546-1212222----1-2 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###############################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################HHHHHHHHHTTccccTTcEEEccccEEEEEEEcccEEEEEcTTccEEEEEHHHHHTcccEEcc#cccEEEEEEEEEEcTTccHHHHHHHHHHHHHHcTTccTTccEEEEEEEEccccEEEEEEEETTTHHH###HHHHHHHHHHHHHHHHTccccccccccc################################################################## DISOP:02AL 1-21,43-49,92-104,158-158,370-382,445-447,772-836| PSIPRED cccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHccHHHHEEHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHcEEccccEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEccEEEEEEEEEEEEEEEEcccccEEEEEcHHHcccEEEEEEccccEEEEEEEEEEcccccHHHHHHHHHHHHHHcHHHHccccEEEEEEEccccEEEEEEEEEEccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccEEEEEEEccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc //