[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Agrobacterium tumefaciens str. C58 (atum0)
Chromosome : circular
Gene : leuS
DDBJ      :leuS         leucyl-tRNA synthetase
Swiss-Prot:SYL_AGRT5    RecName: Full=Leucyl-tRNA synthetase;         EC=6.1.1.4;AltName: Full=Leucine--tRNA ligase;         Short=LeuRS;

Homologs  Archaea  68/68 : Bacteria  911/915 : Eukaryota  195/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.102.1a.27.1c.26.1c.47.1
:876 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   3->876 2bteA PDBj 0.0 46.0 %
:RPS:PDB   3->876 2bteA PDBj e-160 42.9 %
:RPS:SCOP  1->343 1f9dA  a.102.1.2 * 2e-45 9.1 %
:RPS:SCOP  330->429 2a4hA1  c.47.1.23 * 4e-16 9.5 %
:RPS:SCOP  428->681 1h3nA3  c.26.1.1 * 4e-42 42.1 %
:RPS:SCOP  681->865 1rqgA1  a.27.1.1 * 7e-23 16.5 %
:HMM:SCOP  3->681 1h3nA3 c.26.1.1 * 1.5e-146 37.0 %
:HMM:SCOP  673->876 1ivsA2 a.27.1.1 * 4.3e-32 30.7 %
:RPS:PFM   14->172,249->669 PF00133 * tRNA-synt_1 3e-37 39.4 %
:RPS:PFM   718->814 PF08264 * Anticodon_1 9e-07 34.0 %
:HMM:PFM   15->172 PF00133 * tRNA-synt_1 4.6e-29 32.9 158/601  
:HMM:PFM   177->225 PF00133 * tRNA-synt_1 3.8e-05 22.4 49/601  
:HMM:PFM   247->417 PF00133 * tRNA-synt_1 2.8e-14 22.8 149/601  
:HMM:PFM   431->587 PF00133 * tRNA-synt_1 9.6e-12 22.4 143/601  
:HMM:PFM   631->671 PF00133 * tRNA-synt_1 3.5e-12 46.3 41/601  
:HMM:PFM   716->840 PF08264 * Anticodon_1 4.6e-21 27.9 122/152  
:BLT:SWISS 1->876 SYL_AGRT5 0.0 100.0 %
:PROS 43->54|PS00178|AA_TRNA_LIGASE_I
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID AAK88463.1 GT:GENE leuS GT:PRODUCT leucyl-tRNA synthetase GT:DATABASE GIB00072CH01 GT:ORG atum0 GB:ACCESSION GIB00072CH01 GB:CHROMOSOME circular GB:LOCATION 2746106..2748736 GB:FROM 2746106 GB:TO 2748736 GB:DIRECTION + GB:GENE leuS GB:PRODUCT leucyl-tRNA synthetase GB:PROTEIN_ID AAK88463.1 GB:DB_XREF GI:15157966 GB:GENE:GENE leuS LENGTH 876 SQ:AASEQ MAIERYNPRDAEPRWQQKWNEDKVFVTDNSDPREKYYVLEMFPYPSGRIHMGHVRNYAMGDVVARYKRARGFNVLHPMGWDAFGMPAENAAMQNKVHPKDWTYQNIATMRGQLKSMGLSLDWTREFATCDVEYYHRQQALFVDFMEKGLVYRKQSKVNWDPVDHTVLANEQVIDGRGWRSGALVEQRELTQWFFRITDFSQDLLDELDELDQWPEKVRLMQKNWIGRSEGLSLRWQTVADTAPQGFSDITVYTTRPDTLFGASFLAIAADHPLAKELSATNPAIAEFCDECRRHGTSLAALETAEKKGIDTGVKVVHPLDPSWELPVYVANFVLMDYGTGAIFGCPSGDQRDLDFARKYGLPVVAVVAPEGPDAASFTVEDTAFTDDGVMINSSFLNGMKTTDAFEAVVQKLSAQSLGNAPQAERKVNFRLRDWGISRQRYWGCPIPVIHCEVCGVVPVPKKDLPVKLPDDVTFDVPGNPLDRHSTWRHVSCPQCGHDARRETDTMDTFVDSSWYYTRFTAPWEDEPTDPQVANHWLPVDQYIGGIEHAILHLLYSRFFTRAMRETGHVGVKEPFKGLFTQGMVVHETYSRGEGLTREWVPPAELRIEENDGTRRAFLLSSGEEVKIGSIEKMSKSKKNVVDPDDIIASYGADTARFFVLSDSPPDRDVIWSEAGVEGANRFVQRVWRIIGEAAEQLKGVKPKPATEGEGLAASKAAHKTLKAVQEDLDKLAFNKAIARIYELVNALAGPLADVAAGGKPDNVKAAARDAVEILIRIIAPMTPHLAEECWSALGNEGLVAETPWPTFVASLVEENDVVMPVQVNGKKRGELTIARDADQDAVRTAALELDAVKSILAGGEPKKVIVVPQRIVNIVV GT:EXON 1|1-876:0| SW:ID SYL_AGRT5 SW:DE RecName: Full=Leucyl-tRNA synthetase; EC=6.1.1.4;AltName: Full=Leucine--tRNA ligase; Short=LeuRS; SW:GN Name=leuS; OrderedLocusNames=Atu2748; ORFNames=AGR_C_4985; SW:KW Aminoacyl-tRNA synthetase; ATP-binding; Complete proteome; Cytoplasm;Ligase; Nucleotide-binding; Protein biosynthesis. SW:EXACT T SW:FUNC + BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 1->876|SYL_AGRT5|0.0|100.0|876/876| GO:SWS:NREP 6 GO:SWS GO:0004812|"GO:aminoacyl-tRNA ligase activity"|Aminoacyl-tRNA synthetase| GO:SWS GO:0005524|"GO:ATP binding"|ATP-binding| GO:SWS GO:0005737|"GO:cytoplasm"|Cytoplasm| GO:SWS GO:0016874|"GO:ligase activity"|Ligase| GO:SWS GO:0000166|"GO:nucleotide binding"|Nucleotide-binding| GO:SWS GO:0006412|"GO:translation"|Protein biosynthesis| PROS 43->54|PS00178|AA_TRNA_LIGASE_I|PDOC00161| SEG 202->211|dlldeldeld| SEG 456->472|vvpvpkkdlpvklpddv| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 3->876|2bteA|0.0|46.0|846/876| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 3->876|2bteA|e-160|42.9|847/876| RP:PFM:NREP 2 RP:PFM:REP 14->172,249->669|PF00133|3e-37|39.4|506/593|tRNA-synt_1| RP:PFM:REP 718->814|PF08264|9e-07|34.0|97/153|Anticodon_1| HM:PFM:NREP 6 HM:PFM:REP 15->172|PF00133|4.6e-29|32.9|158/601|tRNA-synt_1| HM:PFM:REP 177->225|PF00133|3.8e-05|22.4|49/601|tRNA-synt_1| HM:PFM:REP 247->417|PF00133|2.8e-14|22.8|149/601|tRNA-synt_1| HM:PFM:REP 431->587|PF00133|9.6e-12|22.4|143/601|tRNA-synt_1| HM:PFM:REP 631->671|PF00133|3.5e-12|46.3|41/601|tRNA-synt_1| HM:PFM:REP 716->840|PF08264|4.6e-21|27.9|122/152|Anticodon_1| GO:PFM:NREP 12 GO:PFM GO:0000166|"GO:nucleotide binding"|PF00133|IPR002300| GO:PFM GO:0004812|"GO:aminoacyl-tRNA ligase activity"|PF00133|IPR002300| GO:PFM GO:0005524|"GO:ATP binding"|PF00133|IPR002300| GO:PFM GO:0005737|"GO:cytoplasm"|PF00133|IPR002300| GO:PFM GO:0006412|"GO:translation"|PF00133|IPR002300| GO:PFM GO:0006418|"GO:tRNA aminoacylation for protein translation"|PF00133|IPR002300| GO:PFM GO:0000166|"GO:nucleotide binding"|PF08264|IPR013155| GO:PFM GO:0004812|"GO:aminoacyl-tRNA ligase activity"|PF08264|IPR013155| GO:PFM GO:0005524|"GO:ATP binding"|PF08264|IPR013155| GO:PFM GO:0005737|"GO:cytoplasm"|PF08264|IPR013155| GO:PFM GO:0006412|"GO:translation"|PF08264|IPR013155| GO:PFM GO:0006418|"GO:tRNA aminoacylation for protein translation"|PF08264|IPR013155| RP:SCP:NREP 4 RP:SCP:REP 1->343|1f9dA|2e-45|9.1|317/629|a.102.1.2| RP:SCP:REP 330->429|2a4hA1|4e-16|9.5|95/117|c.47.1.23| RP:SCP:REP 428->681|1h3nA3|4e-42|42.1|254/494|c.26.1.1| RP:SCP:REP 681->865|1rqgA1|7e-23|16.5|182/210|a.27.1.1| HM:SCP:REP 3->681|1h3nA3|1.5e-146|37.0|476/495|c.26.1.1|1/1|Nucleotidylyl transferase| HM:SCP:REP 673->876|1ivsA2|4.3e-32|30.7|192/218|a.27.1.1|1/1|Anticodon-binding domain of a subclass of class I aminoacyl-tRNA synthetases|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b4433345572455465443 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 876 STR:RPRED 100.0 SQ:SECSTR EEcccccHHHHHHHHHHHHHHHTccccccccTTcEEEEEEccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcEEEcccccccccHHHHHHHHHTTccHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTccccGGGcccTTcHHHHHHHHHHHHHHHHTTcEEEEEEEEEEETTTTEEEcGGGcTTcccccTTcccEEEEEEEEEEcGGGGcHHHHHHTTTTccccHHHHHHHHHHHccEEEEEEEEEccccccEEcTcHcEEEEccGGGGGGccEEEEcTTcTHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHTTcTTccccEEEEEEEEcTTcTccEEEEEEcTTccTTcTTcEEEEcGGGcHHHHHHHHHTTccccccEEcEccccccccccccccccccEEcccGGGTTccHHHHHHHHHHHHHHHTcEcHHHHEEEEEccccccccEEcccccccccEEEETTTEEEEcccTTccccccccccccccccGGGGcHHHHEEEccccccEEEccccEEcHHHHTTTHHHHTTcTTccccccHHHHHHHccccEEEEcGGGTTTHHHHHHHHHHHHHHTTcccccccccccEEcccEEEcEEHHTTcEEEEEEETTEEEccHHHHHHHccHHHHTTcEEEEEcccccTTTTccccHHHHHHHccHHHHHHHHHccccTTccEEEcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHTccccTTccTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHTTTcHHHHHHHHHTTccccEGGGTccccccHHHHccccEEEEEEETTEEEEEEEEcccccHHHHHHHHTTccccHHHHHcccccEEEEETTTEEEEEc DISOP:02AL 1-3| PSIPRED cccccccHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccEEEEEcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEccccccccccHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccEEccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEccEEEEEEccccccccHHHHHcccccccccccEEEEccEEEEEcccHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHccccccEEEEEccccccccccccEEEEEEEEEHHHHccEEEEEccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccEEEcccccccEEEEEEEccccccccccEEEEcccccHHHHHHHHHcccccccccccccccccHHHHHHHHHHHccEEEEcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccEEEEccccEEEEEccccccccEEEEccccEEEccccHHHHHccHHccccccccccccccccccccccccccccEEEccEEEEEEcccccHHHcccccccccccHHHHHHccccEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHccEEcccccccccccccccccccEEEEccccccHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHcHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEccccccccHHHcccHHHHHHHHHHHHHHcEEEccccccHHHHHHHHHHcHHHHHHHccccEEEEEEEccEEEEEEc //