[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Agrobacterium tumefaciens str. C58 (atum0)
Chromosome : circular
Gene : smc
DDBJ      :smc          chromosome segregation protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  40/68 : Bacteria  633/915 : Eukaryota  197/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
c.37.1d.215.1
:1155 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   5->166 1xexA PDBj 4e-24 38.4 %
:BLT:PDB   1002->1155 1xewY PDBj 4e-29 42.3 %
:RPS:PDB   1->52,1042->1145 1e69A PDBj 9e-15 51.5 %
:RPS:PDB   26->146 1bifA PDBj 7e-05 9.1 %
:RPS:SCOP  2->162 1w1wA  c.37.1.12 * 1e-23 21.5 %
:RPS:SCOP  559->619 1gxjA  d.215.1.1 * 2e-04 19.7 %
:RPS:SCOP  930->1145 1w1wA  c.37.1.12 * 3e-34 24.9 %
:HMM:SCOP  1->1150 1w1wA_ c.37.1.12 * 7.4e-78 30.1 %
:RPS:PFM   5->233,930->1132 PF02463 * SMC_N 7e-39 47.8 %
:HMM:PFM   4->1138 PF02463 * SMC_N 1.8e-61 38.4 216/220  
:BLT:SWISS 6->141 SMC6_YEAST 1e-06 32.3 %
:BLT:SWISS 22->44 RECF_MYCSM 7e-04 73.9 %
:BLT:SWISS 637->769 TPM1_BOMMO 2e-06 27.9 %
:BLT:SWISS 931->996 MYH10_RAT 7e-04 30.3 %
:BLT:SWISS 990->1154 YAT3_RHORU 7e-49 58.8 %
:COIL
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID AAK86610.2 GT:GENE smc GT:PRODUCT chromosome segregation protein GT:DATABASE GIB00072CH01 GT:ORG atum0 GB:ACCESSION GIB00072CH01 GB:CHROMOSOME circular GB:LOCATION 796372..799839 GB:FROM 796372 GB:TO 799839 GB:DIRECTION + GB:GENE smc GB:PRODUCT chromosome segregation protein GB:PROTEIN_ID AAK86610.2 GB:DB_XREF GI:159139780 GB:GENE:GENE smc LENGTH 1155 SQ:AASEQ MKFNKLRVVGFKSFVEPSEFIIEPGLTGVVGPNGCGKSNLVEALRWVMGENSYKNMRASGMDDVIFSGSGNRPARNTAEVGLYLDNSDRTAPAAFNDADEIQVTRRIERENGSVYRINGKEARAKDVQLLFADASTGARSPSMVGQGRIGELINAKPQARRQLLEEAAGISGLHSRRHEAELRLRAAETNLERLEDVTAQLESQIESLKRQARQANRFKMLSADIRAREATLLHIRWVEAKEAEGEAESALNQATNIVAEKAQGQMEAAKQQGIASLKLPELREDEARVAAALQRLQIARTQLDDEANRLLRRRDELARRLSQLGEDIVREERLVADNAQILARLDEEEAELLDILSDSGRHADEMREAFEAAAVKLAESEAVFTSITAERAEAAAGRQQLERAIRDLSDRKLRLERQSQEASAEIDTIDEKLSGLPDPAERREAVEAAEIAVEDALIVAEEAEAAVAEARSAEALARGPLETAKNRLNALDTEARTITKMLATSAAANGSFTPVAEEMTVERGYEAALGAALGDDLESPLDASAPAYWGGNGNGADDPGLPQGAKPLLDYAQAPDALRRALAQIGVVADVSEARRLLPSLKAGQRLVTREGALFRWDGHIASADAPGAAALRLSQKNRLAEIEAELDEARSILEEAEDQLAAKTEDIRSSELRLSEVRDRSRLATRQLAEAREALTSAERASGDLLRRRDVVSEAQNQIGAQIDEIAVQEENARIEMEDAPDLSVLDLRLRESQLEVATDRGLLAEARARHEGVSREAESRQRRIQAIGQERSTWASRAASAADHIATLREREEEAREEIAELDIAPEEFDEKRRNLLNELQKTEDARRAAADRLAEAENLQRAADRVAATALSELAEAREKRGRAEERLVSAREKRLETEHRIRETLNTEPHMAFRLTGLGPDQPKPDIRDVERDLDRLKIERERLGAVNLRAEEEQAELSGKLEALIKERDDIIDAVRKLRAGIQSLNREGRERLIAAFDVVNSQFQRLFTHLFGGGTAELQLIESDDPLEAGLEILARPPGKKPQTMTLLSGGEQALTAMALIFAVFLTNPAPICVLDEVDAPLDDHNVERYCNLMDEMVASTETRFVIITHNPITMARMNRLFGVTMAEQGVSQLVSVDLQTAEQLREAV GT:EXON 1|1-1155:0| BL:SWS:NREP 5 BL:SWS:REP 6->141|SMC6_YEAST|1e-06|32.3|130/1114| BL:SWS:REP 22->44|RECF_MYCSM|7e-04|73.9|23/384| BL:SWS:REP 637->769|TPM1_BOMMO|2e-06|27.9|129/284| BL:SWS:REP 931->996|MYH10_RAT|7e-04|30.3|66/1976| BL:SWS:REP 990->1154|YAT3_RHORU|7e-49|58.8|165/173| COIL:NAA 401 COIL:NSEG 9 COIL:REGION 169->219| COIL:REGION 285->337| COIL:REGION 376->379| COIL:REGION 381->383| COIL:REGION 385->428| COIL:REGION 440->474| COIL:REGION 633->715| COIL:REGION 829->904| COIL:REGION 930->981| SEG 173->195|lhsrrheaelrlraaetnlerle| SEG 239->250|eakeaegeaesa| SEG 303->321|lddeanrllrrrdelarrl| SEG 341->356|ilarldeeeaelldil| SEG 389->404|aeraeaaagrqqlera| SEG 440->478|aerreaveaaeiavedalivaeeaeaavaearsaealar| SEG 527->537|aalgaalgddl| SEG 797->804|asraasaa| SEG 811->823|rereeeareeiae| SEG 846->860|edarraaadrlaeae| SEG 878->890|aearekrgraeer| BL:PDB:NREP 2 BL:PDB:REP 5->166|1xexA|4e-24|38.4|159/166| BL:PDB:REP 1002->1155|1xewY|4e-29|42.3|149/160| RP:PDB:NREP 2 RP:PDB:REP 1->52,1042->1145|1e69A|9e-15|51.5|153/263| RP:PDB:REP 26->146|1bifA|7e-05|9.1|116/432| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 5->233,930->1132|PF02463|7e-39|47.8|425/536|SMC_N| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 4->1138|PF02463|1.8e-61|38.4|216/220|SMC_N| GO:PFM:NREP 2 GO:PFM GO:0005524|"GO:ATP binding"|PF02463|IPR003395| GO:PFM GO:0005694|"GO:chromosome"|PF02463|IPR003395| RP:SCP:NREP 3 RP:SCP:REP 2->162|1w1wA|1e-23|21.5|135/274|c.37.1.12| RP:SCP:REP 559->619|1gxjA|2e-04|19.7|61/161|d.215.1.1| RP:SCP:REP 930->1145|1w1wA|3e-34|24.9|197/274|c.37.1.12| HM:SCP:REP 1->1150|1w1wA_|7.4e-78|30.1|412/0|c.37.1.12|1/1|P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases| OP:NHOMO 1512 OP:NHOMOORG 870 OP:PATTERN -----------------------111111111---111111111111111111-11111111111-11 1111111111111111111-11111111111111111111111111-111111111-1--111-1111111----1111111111111-----------------11-1---------------111111111-1111111---11111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11-1-111111111-111111111-----111111111111111111111111---1-11--111-1111111111111111111111111111111111111111111-----------------------------11111-1111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111-1-----------111111111111111---------------------------1111-111-111-1111111111111111121--11111--------------------------------------------------------------------------------------------11111111111111----------------11111111111111111111111111111------------------------11111111111111---11111111111111111-----1-11111111111111111111111111111-1- 2234422-A4423343244444444444434444444434444444333344244444343344444414434434414444444444-4542544343442434334434444764131233264391CV716484323424452332462253A24359J243445558H7334234X4334333163514334553 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 392 STR:RPRED 33.9 SQ:SECSTR cEEEEEEEEccTTccccEEEEccccEEEEEccTTTccTHHHHHHHHTcccccHHccEEEEEHHHHHHHHHcccccGGGGcTTcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTccccEEEEEcccccHHHHHTTcEEEEEEEccccHHHHHHTHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHc########################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################HHHTTTccGGGEEEcccccEEEcTHHHHHH###ccTTccccEEEEEHHHHHHHHTTccEEEEEHHHHHHHHHcccccGGGGcTTcHHHHHHHHHHHTTcGGGHHGHHHHHHHEcTTcccccGGGccHHHHHHHHHHHHHHHTTTccccEEEEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHcHTTTcEEEEEcccTTGGGGccEEEEEEEcccccEEEEEcccHHHHHHcTTH DISOP:02AL 53-64,153-154,201-201,249-276,289-289,293-294,308-327,346-436,475-495,621-642,669-706,708-708,730-730,768-783,867-867,869-875,889-896,1046-1055| PSIPRED cEEEEEEEEEEEEEccEEEEEccccEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHccccccccccEEEEEEEEEccccccccccccccEEEEEEEEEEcccEEEEEccEEccHHHHHHHHHHHccccccccEEEccHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccEEEEEEEcHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHcccccccccccccccHHHHHHccccHHHHHHHccEEEEccHHHHHHHHHcccccEEEEEccccEEcccEEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEccccccccccEEEEEEccccccccHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEccccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEcccHHHHHHccEEEEEEEEcccEEEEEEEEHHHHHHHHHcc //