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Agrobacterium tumefaciens str. C58 (atum0)
Chromosome : circular
Gene : tphA
DDBJ      :tphA         MFS permease
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  21/68 : Bacteria  509/915 : Eukaryota  64/199 : Viruses  1/175   --->[See Alignment]
f.38.1
:443 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   83->223 2d33D PDBj 5e-08 9.5 %
:RPS:SCOP  2->362 1pw4A  f.38.1.1 * 4e-13 11.7 %
:HMM:SCOP  1->425 1pw4A_ f.38.1.1 * 1.2e-60 26.3 %
:RPS:PFM   23->223 PF00083 * Sugar_tr 9e-14 32.1 %
:HMM:PFM   64->385 PF07690 * MFS_1 3e-31 26.2 301/353  
:BLT:SWISS 26->424 PROP_STAAR 9e-47 29.4 %
:TM

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID AAK87901.1 GT:GENE tphA GT:PRODUCT MFS permease GT:DATABASE GIB00072CH01 GT:ORG atum0 GB:ACCESSION GIB00072CH01 GB:CHROMOSOME circular GB:LOCATION 2118701..2120032 GB:FROM 2118701 GB:TO 2120032 GB:DIRECTION + GB:GENE tphA GB:PRODUCT MFS permease GB:PROTEIN_ID AAK87901.1 GB:DB_XREF GI:15157295 GB:GENE:GENE tphA LENGTH 443 SQ:AASEQ MSPTTTPAAARPLNSQDFRTLGLSALGGALEFYDFIIFVFFATVIGHLFFPPEMPDWLVMIQTFGIFAAGYLVRPLGGIVLAHYGDRYGRKRVFAFSILLMALSTLGMALMPTYATIGVAAPILLIILRMLQGAAIGGEVPGAWTFVAEHVPFRRVGLACGFLTSGLSFGIMLGSLIAFAINSLFTPEDVAGYAWRIPFLLGGVFGLIAVYLRRWLEETPIYMEMKKSKSLTDKLPLGLVLKHHRRGVIISALLTWVLSAAIVVTTLMTATFLQKLYGYTPTQALAGTSFGTLFLIFGVIIAGALIDRVGSGIFFMGASIFFGIATFTFYSYAGTSLETMFVLYGVMGLSVGMAGAVPYVMVRAFPASVRFSGLSFAYNVSYAVFGGLTPIGVTTALAINPMAHAWYLVFIAFLAFAIGLYLHLRGSEVESHVGIEELAALRS GT:EXON 1|1-443:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 26->424|PROP_STAAR|9e-47|29.4|395/466| TM:NTM 10 TM:REGION 24->46| TM:REGION 59->81| TM:REGION 103->125| TM:REGION 156->178| TM:REGION 191->212| TM:REGION 248->270| TM:REGION 298->320| TM:REGION 341->363| TM:REGION 374->396| TM:REGION 402->424| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 83->223|2d33D|5e-08|9.5|126/499| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 23->223|PF00083|9e-14|32.1|184/433|Sugar_tr| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 64->385|PF07690|3e-31|26.2|301/353|MFS_1| GO:PFM:NREP 4 GO:PFM GO:0005215|"GO:transporter activity"|PF00083|IPR005828| GO:PFM GO:0006810|"GO:transport"|PF00083|IPR005828| GO:PFM GO:0016021|"GO:integral to membrane"|PF00083|IPR005828| GO:PFM GO:0055085|"GO:transmembrane transport"|PF00083|IPR005828| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 2->362|1pw4A|4e-13|11.7|341/434|f.38.1.1| HM:SCP:REP 1->425|1pw4A_|1.2e-60|26.3|399/447|f.38.1.1|1/1|MFS general substrate transporter| OP:NHOMO 3265 OP:NHOMOORG 595 OP:PATTERN ------79889988A5-6233221-------------------------------------6461--- 1141132677C-5154422-27--2U2222215999DNpp--224-2--551PJL726-----438R87311222222-13-B-2112--------1--1-2---2-2-3-----------------1-1---1-------11112--------------131---1-----1-----1-----1------312444444432444443--22--445-262-1-------1111111111111111121212---14413---111112---24-----------------------------------------11---------------------111--------------43-------1-------1--44461442452H551-33323255555554547-66D55J8D241-666622455645F4-1---5-----1-43444444555221-144233444114467BD86G6676673233-1564-73346aSSZUWCFHHDYYfRKNKJDIcJgFMHB-5IE832711911-9437---1142-------11--1-1--1----21--------------111112-----1-5455341-2222212-------1-1---------------1--------------1---------8878287677A788866-777678867778877677789866--39989899998889898B44754552-444443344443--1-11111575711-11---1-1-22211--2CCBCD7A1125-AAC9CHE91FHIG-BAB96655A666----------1----55555544441111---------------------------------------------------------1- ----1-------1111211-1111112-----------------------11-1--11-111511-----11-1--1--1------1--222224721-111-324--6------------------------------------------------------3-2----------11-----1-2AA4153241---1 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------- STR:NPRED 126 STR:RPRED 28.4 SQ:SECSTR ##################################################################################TTcccccTTccccccHHHHHHHHHHHHHcccHHHH########TTccEETTEEccccccccccGGGccccEEEEccccTTccHHHHHHHHcccEEEEEEEEcc#######TTcTTcccHHHHHHHHHHHHHHHHccccccc############################################################################################################################################################################################################################ DISOP:02AL 1-15, 226-232, 427-437, 441-443| PSIPRED ccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHcc //