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Bacteriophage 44RR2.8t (bp441)
Gene : 7
DDBJ      :7            baseplate wedge initiator
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  6/175   --->[See Alignment]
b.1.2
:1019 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   5->96 3d1mC PDBj 5e-07 14.1 %
:RPS:SCOP  5->96 1a22B2  b.1.2.1 * 4e-08 9.8 %
:HMM:SCOP  3->98 2b5iB2 b.1.2.1 * 5.9e-08 23.2 %
:HMM:PFM   202->276 PF10355 * Ytp1 0.001 20.0 75/278  
:BLT:SWISS 1->1019 VG07_BPT4 0.0 55.3 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links DAD DDBJ Abbreviations Back to title page
GT:ID AAQ81461.1 GT:GENE 7 GT:PRODUCT baseplate wedge initiator GT:DATABASE AY375531 GT:ORG bp441 GB:ACCESSION AY375531 GB:LOCATION 82630..85689 GB:FROM 82630 GB:TO 85689 GB:DIRECTION + GB:GENE 7 GB:PRODUCT baseplate wedge initiator GB:NOTE similar to T4 accession NP_049765.1; C-terminus contains predicted integral membrane domain; gp7 GB:PROTEIN_ID AAQ81461.1 GB:DB_XREF GI:34732923 GB:GENE:GENE 7 LENGTH 1019 SQ:AASEQ MVIKAPSVTSLKIKILSANQVYITWDDVGSNFYYIVELARTRDSSVINWTTLGITPNEEWFEDKVIQSDTHYKMRVRVSGKGFEMSDWVETEEFQTFNTNAYYVSSMREFTPAATFINEKFTKNNKSYVDFNDDVIMASLMGEDFVFSPQFSNATNIADKIVTDENYHEIQGYIEGVCADIDRTMLAEIDDVLYLFERFQPMAKVSNDKGQNWKYYKAFNGRIGNPITRTVTYQTSTTTYVLGYENIYYGRRANDVRWSADDVRFSSDTVTFAKTGDELNLGFDVELFNSYARLPGDMYRKAEAIAADDDWIYVAARNNMRRIRTSNAPIETDPGSPNFGEKLFDPVAYMVTNDPSAIVKKMDTFNGKLYALVTGKVKSQWLDPTVPANIVSTDAIGVYMFDGATWTRVFGNTADERRWFSHEYTNMSTNGDELFISQVNFKFPGTLPDLELPEKNSQVIEAVKYQLLPGYNSDITIHMGTFRINQDDDVWKLGPQQYYNEAAYTWMARSGTRCWITNDNRALVVYPKIVYSKSIDDAGFADDSRVNKETHNKGTITLYANNVRFNGFKRYANGILFHKNTGEIIGYYEFPYRVRDEAYVFWKPNFVMLVAELRNQERETPWTPAPNYGLKDPDLRPLVTKMMPESYLDEDSNFGAFAKYYLQYLSDGNGTYYNKLLNLIKNKYPREQYAYEYLWSEVLKRNIYLDEAKRDSVARFFEARSFDFYSTKGVEQSYKFLFKLLYNEDVEIDIESKHGIEYDIVVYSTNISQDIVGRTIYTPTGRANVTYIEREYNEGKLRWRITIHNMIGKFFEGQEIKSETTGFKGDVIVGVRGKELLSDSIDYINRGRSYYTMTIKSVLPASRYSQDVLRFVHPVGFGFVGITLLTMFINSGLSMKHVETIIDNLKTYRWDAGYPLEQYDRVAKLDVDGNIETDPVTGEAVYLVGPNAGQPFDVPPEYDTEESSWHGKLPSERRFKMSPLFDQSAVTFSNFRRLVEQRLKDDAGNPRDPKVPTQVKIDE GT:EXON 1|1-1019:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 1->1019|VG07_BPT4|0.0|55.3|1016/1032| SEG 228->239|trtvtyqtsttt| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 5->96|3d1mC|5e-07|14.1|85/87| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 202->276|PF10355|0.001|20.0|75/278|Ytp1| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 5->96|1a22B2|4e-08|9.8|92/105|b.1.2.1| HM:SCP:REP 3->98|2b5iB2|5.9e-08|23.2|95/0|b.1.2.1|1/1|Fibronectin type III| OP:NHOMO 6 OP:NHOMOORG 6 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---1---------------1---------------111-1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 136 STR:RPRED 13.3 SQ:SECSTR TcccccEccEEEEEEcccccEEEEEEcccEcccEEEEEEETTcccTTccEEEEEETTccEEEEccccTTcEEEEEEEEETTEEccccccccEEEEcHHHcccccccEEEEEEETTEEEEEE#cccEEEEEETTEEEE################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################## DISOP:02AL 1-4,1013-1020| PSIPRED cEEEcccEEEEEEEEccccEEEEEEEEccccEEEEEEEEEEccccEEEEEEEcccccccHHHHHHcccccEEEEEEEEEEccccHHHcEEEccEEEEEcccEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEcccccEEEEEEcccccEEccccccHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEEccHHHHHHHHccEEEEEccccccEEEEEEccccccccEEEEEEEEcccEEEEEEccEEEEEEEccccEEccccEEEcccEEEEEEEcccccccEEEEEEccccccccccEEEEEEEEEcccEEEEEEccEEEEEEcccccccccccccccHHccccccEEEEEcccEEEEEEEEEEccEEEEEEEEEHHHHccccccccccccccccEEEEEEccEEEEEEcccHHHHHHcccccccccccccEEEEEHHccccccccccccccccHHHHHHHEEEccccccccccEEEEEEEEEcccccEEEccHHHHHcccccHHHHHcccEEEEEcccEEEEEEcccEEEEEEccccccccccEEEEEEcccEEEEEEccEEEEEEcccccEEEEEcccccEEEEEEccEEEEEEEEEEEcccEEEEEEEccccccccccccccccccccccccHHHHHHccccEEcccccHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEccccEEEEEEEEccccccccEEEEEEccccccEEEEEEEEEEccEEEEEEEHHHHHHHHccccEEEEcccccEEEEEEEcccccccccccHHHccccEEEEEEEEEcccHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEEHHHHHHHcccccccccccccccEEEEcccccccccccccccEEEEccccccccccccccccccccEEEccccHHHHHHccccccHHcccHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccEEccc 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