[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Lactococcus lactis bacteriophage TP901-1 (bptp0)
Gene : tmp
DDBJ      :tmp          TMP
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  2/68 : Bacteria  175/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  34/175   --->[See Alignment]
:937 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   77->379 2ch7B PDBj 8e-10 12.2 %
:RPS:PDB   510->766 2a01A PDBj 7e-04 15.3 %
:RPS:PFM   96->293 PF10145 * PhageMin_Tail 1e-33 40.9 %
:HMM:PFM   96->296 PF10145 * PhageMin_Tail 6.3e-59 42.8 201/202  
:HMM:PFM   522->573 PF09718 * Tape_meas_lam_C 1.5e-05 23.1 52/78  
:HMM:PFM   730->781 PF09718 * Tape_meas_lam_C 0.00054 15.4 52/78  
:HMM:PFM   312->390 PF07464 * ApoLp-III 0.00023 22.8 79/189  
:HMM:PFM   448->529 PF05221 * AdoHcyase 0.00089 21.5 79/268  
:BLT:SWISS 74->355 YOMI_BACSU 1e-10 18.9 %
:BLT:SWISS 468->595 YQBO_BACSU 4e-08 29.3 %
:BLT:SWISS 571->656 NAT3_ARATH 5e-04 28.9 %
:BLT:SWISS 689->890 TOP2_ASFWA 8e-05 27.2 %
:TM
:REPEAT 4|481->515|521->555|682->716|717->760
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links Genpept Abbreviations Back to title page
GT:ID NP_112708.1 GT:GENE tmp GT:PRODUCT TMP GT:DATABASE NC_002747 GT:ORG bptp0 GB:ACCESSION NC_002747 GB:LOCATION 23138..25951 GB:FROM 23138 GB:TO 25951 GB:DIRECTION + GB:GENE tmp GB:PRODUCT TMP GB:NOTE tape measure protein, experimental GB:PROTEIN_ID NP_112708.1 GB:DB_XREF GI:13786576 GB:GENE:GENE tmp LENGTH 937 SQ:AASEQ MESFSVQAYLKATDNNFVSTFKDAAKQVQNFEKNTNSTMSTVGKVATSTGKTLTKAVTVPIIGIGVAAAKIGGDFESQMSRVKAISGATGSSFEELRQQAIDLGAKTAFSAKESASGMENLASAGFNAKEIMEAMPGLLDLAAVSGGDVALASENAATALRGFNLDASQSGHVANVFAKAAADTNAEVGDMGEAMKYIAPVANSMGLSIEEVSAAIGIMSDAGIKGSQAGTSLRGALSRLADPTDAMQAKMDELGLSFYDSEGKMKPLKDQIGMLKDAFKGLTPEQQQNALVTLYGQESLSGMMALIDKGPDKLGKLTESLKNSDGAADKMAKTMQDNMNSSLEQMMGAFESAAIVVQKILAPAVRKVADSISGLVDKFVSAPEPVQKMIVTIGLIVAAIGPLLVIFGQAVVTLQRVKVGFLALRSGLALIGGSFTAISLPVLGIIAAIAAVIAIGILVYKNWDKISKFGKEVWANVKKFASDAAEVIKEKWGDITQWFSDTWNNIKNGAKGLWDGTVQGAKNAVDSVKNAWNGIKEWFTNLWKGTTSGLSSAWDSVTTTLAPFVETIKTIFQPILDFFSGLWGQVQTIFGSAWEIIKTVVMGPVLLLIDLITGDFNQFKKDFAMLWQTLFTNIQTLVTTYVQIVVGFFTAWGQTVSNIWTTVVNTIQSLWGAFTTWVINMAKSIVDGIVNGWNSFKQGTVDLWNATVQWVKDTWASFKQWVVDSANAIVNGVKQGWENLKQGTIDLWNGMINGLKGIWDGLKQSVRNLIDNVKTTFNNLKNINLLDIGKAIIDGLVKGLKKKWEDGMKFISGIGDWIRKHKGPIRKDRKLLIPAGKAIMTGLNSGLTGGFRNVQSNVSGMGDMIANAINSDYSVDIGANVAAANRSISSQVSHDVNLNQGKQPASFTVKLGNQIFKAFVDDISNAQGQAINLNMGF GT:EXON 1|1-937:0| BL:SWS:NREP 4 BL:SWS:REP 74->355|YOMI_BACSU|1e-10|18.9|280/2285| BL:SWS:REP 468->595|YQBO_BACSU|4e-08|29.3|116/1585| BL:SWS:REP 571->656|NAT3_ARATH|5e-04|28.9|83/551| BL:SWS:REP 689->890|TOP2_ASFWA|8e-05|27.2|184/1192| TM:NTM 2 TM:REGION 389->411| TM:REGION 429->451| NREPEAT 1 REPEAT 4|481->515|521->555|682->716|717->760| SEG 56->73|avtvpiigigvaaakigg| SEG 442->459|vlgiiaaiaaviaigilv| RP:PDB:NREP 2 RP:PDB:REP 77->379|2ch7B|8e-10|12.2|295/307| RP:PDB:REP 510->766|2a01A|7e-04|15.3|235/243| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 96->293|PF10145|1e-33|40.9|198/202|PhageMin_Tail| HM:PFM:NREP 5 HM:PFM:REP 96->296|PF10145|6.3e-59|42.8|201/202|PhageMin_Tail| HM:PFM:REP 522->573|PF09718|1.5e-05|23.1|52/78|Tape_meas_lam_C| HM:PFM:REP 730->781|PF09718|0.00054|15.4|52/78|Tape_meas_lam_C| HM:PFM:REP 312->390|PF07464|0.00023|22.8|79/189|ApoLp-III| HM:PFM:REP 448->529|PF05221|0.00089|21.5|79/268|AdoHcyase| OP:NHOMO 297 OP:NHOMOORG 211 OP:PATTERN --------------------------------1--------1-------------------------- -----1----1--1211---------------1---1--1--------1-------------1-1----------211--1----------1-----------1---------------------------------------12------------------------1----------------------1-222122-121121313232----3-111--13---11--1212221122442421--2-4-1-13-----22--11-1211-22112-1-----------11--11112231-12-12------------4-1321-2412321--2211-1-311---1----1-1---1-------------------------------------------1----------------1----------------------------------------------------------------1--2--------------------------------------------------1---------------------------------1---------1----------1----------------------------------1---1-----1--------------------------------11--11--1-21--1--1121--111-------1--1-111---1---1---1-11-11------------2-----12---------------111-----------1-1------1-----------1---------------------1----1-11---------------------7-----------------------------------------------1-------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1------------------------11---11111------------------------------------------1-1-1-1----11--------11---1--1-11--11-11--11-1-11--------111-----------1----1--------------------- STR:NPRED 561 STR:RPRED 59.9 SQ:SECSTR ###########################################################################HccTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTccGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHcTTTHHHHHHHHcTTccc############################################################################################################ccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTcccccccccTTHH###############HHHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHH#######HHHHHHHHHHHHcccccccTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH########################################################################################################################################################################### DISOP:02AL 1-1,15-47,123-125,127-129,131-131,225-226,244-245,247-247,317-325| PSIPRED ccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEccccHHccccccccccccHHHHcccccccEEEEHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHccccc //