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Vibriophage VP2 (bpvp2)
Gene : AAR97633.1
DDBJ      :             hypothetical protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  10/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  4/175   --->[See Alignment]
:782 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   55->165 2ghiC PDBj 6e-04 27.3 %
:HMM:PFM   203->273 PF09484 * Cas_TM1802 0.00099 23.3 60/593  
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links DAD DDBJ Abbreviations Back to title page
GT:ID AAR97633.1 GT:GENE AAR97633.1 GT:PRODUCT hypothetical protein GT:DATABASE AY505112 GT:ORG bpvp2 GB:ACCESSION AY505112 GB:LOCATION 17012..19360 GB:FROM 17012 GB:TO 19360 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT hypothetical protein GB:NOTE similar to bacteriophage epsilon15p17 deposited under GenBank Accession Number AAO06080 GB:PROTEIN_ID AAR97633.1 GB:DB_XREF GI:40950042 LENGTH 782 SQ:AASEQ MPRKCFEGWKEEDIAKMFGKTDTDLITAEDIADAIKGKKQEKIAVYKQAEAIKKGNEVLTQSKDPASALLGMLSRDPNEEVKFLSADQRINAIRAVSKAKISDFMADLAPTTRQIFAGIATGERRLTKSQQRLLDDFVHELYGRQTGNADALKAAKGWKKATEDLNARFGQAGGHMAELDDWRLPQKHNRMAISKAGADVWVEKVWDLIDRDKMVKKLRKGKDEDNLREALYSVYNNIVTDGMSSSKTLSKKFTDMMRSERFITFKDSDSWLKYQREFGDTNVYASMLGHIDNMSRAIGMMETFGPDPDIGFNTLERAVKTKKGLTSRQPTGARPTFDMLMGYNMVEEQTVWGNRVAGLRNLWTASKLGAAVVSALTDSVYASMAASYNAMSPARVLRRMLSEVMKPSKSEASRKLWAQDFGFGAEFALDRMAMTSDYTQSFGGHRSRNLAEAVMVVSGMNQWTQSARASFQFEFATALTRAADSRWSDLPEKMRNSMGRYGITESDWAAIAAAPRTNYKGNKMIDPRNMDAELQTKLVGMVDGETMMAVPTPDARTRAFMAGGTKSGNFGGELHRSLFMFHSFPITTIMNQWRRVFTGKGYSGAFDRMSAAAIMVGATSVLGVGIIQAKDILNGKKPRSMSDPKLWIEGMAQGGSFNYIGDLMRNAASGYSHDMTSYVGGPVLAYGDWVAMTAADMAKGDAESAMARTANFATQQIPFNNLWYTKIATDRLLMDRIRRLSDPEYDKKQLNKMRKMQRTSQQEYWWSPPIGGQSNIESPFEE GT:EXON 1|1-782:0| SEG 379->392|svyasmaasynams| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 55->165|2ghiC|6e-04|27.3|110/248| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 203->273|PF09484|0.00099|23.3|60/593|Cas_TM1802| OP:NHOMO 15 OP:NHOMOORG 14 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----1---------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------1-------------------------------------1-------2--------------------------------------------------1-----------------1----1-------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------111---------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------ STR:NPRED 110 STR:RPRED 14.1 SQ:SECSTR ######################################################TEEGGGcccHHHHTTEEEEcccccccHHHHHHTTcTTcHHHHHHTTcHHHHHHcTTGGGcccccccccHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEcccTTccH#HHHHHHHHHHHHH######################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################### DISOP:02AL 1-2,405-414,755-755,775-783| PSIPRED cccHHHHcccHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHccccccccHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHccccccccccccccHHccccccccEEEEEEccHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHccHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHccccHHHHHHHHccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEcccHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHcccEEccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccc //