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Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 (bsub0)
Gene : ypbR
DDBJ      :ypbR         putative GTP-binding protein
Swiss-Prot:YPBR_BACSU   RecName: Full=Uncharacterized protein ypbR;

Homologs  Archaea  1/68 : Bacteria  76/915 : Eukaryota  3/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
c.37.1
:1193 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   50->299 2j69A PDBj 2e-09 31.0 %
:BLT:PDB   754->878 2j69A PDBj 3e-05 25.0 %
:RPS:PDB   46->337 3a1uB PDBj 2e-04 24.7 %
:RPS:SCOP  46->226 1f60A3  c.37.1.8 * 1e-05 12.6 %
:RPS:SCOP  770->876 1tpzA  c.37.1.8 * 1e-07 22.0 %
:HMM:SCOP  13->254 2akaB1 c.37.1.8 * 2.3e-24 24.6 %
:HMM:SCOP  587->900 2akaB1 c.37.1.8 * 1.6e-26 24.9 %
:RPS:PFM   46->184 PF00350 * Dynamin_N 5e-06 28.8 %
:RPS:PFM   206->573 PF03999 * MAP65_ASE1 4e-04 25.7 %
:RPS:PFM   738->819 PF00350 * Dynamin_N 1e-06 33.3 %
:RPS:PFM   994->1177 PF05879 * RHD3 6e-04 23.5 %
:HMM:PFM   46->201 PF00350 * Dynamin_N 1.8e-31 27.6 152/168  
:HMM:PFM   615->838 PF00350 * Dynamin_N 2.3e-41 31.3 166/168  
:HMM:PFM   573->632 PF08298 * AAA_PrkA 8.5e-06 35.0 60/358  
:BLT:SWISS 1->1193 YPBR_BACSU 0.0 100.0 %
:COIL
:REPEAT 2|121->503|754->1144
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links GIB DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID CAB14120.1 GT:GENE ypbR GT:PRODUCT putative GTP-binding protein GT:DATABASE GIB00011CH01 GT:ORG bsub0 GB:ACCESSION GIB00011CH01 GB:LOCATION complement(2312529..2316110) GB:FROM 2312529 GB:TO 2316110 GB:DIRECTION - GB:GENE ypbR GB:PRODUCT putative GTP-binding protein GB:NOTE Evidence 3: Function proposed based on presence of conserved amino acid motif, structural feature or limited homology; Product type pe: putative enzyme GB:PROTEIN_ID CAB14120.1 GB:DB_XREF GOA:P54159 InterPro:IPR001401 SubtiList:BG11604 UniProtKB/Swiss-Prot:P54159 GB:GENE:GENE ypbR LENGTH 1193 SQ:AASEQ MTDQNRKELLHKTGELYKQFIENQDEQRAAKLAAVMKKAADEEVYIAFTGHYSAGKSSLLNCLLMENILPTSPIPTSANLVVIRNGEKRVRLHTTDGACAELEGTYQKDKVQQYCKDGEQIESVEIFDRYTEIDSGVAYIDTPGIDSTDDAHFLSAASILHQADALFYVVHYNHVHAEENVKFLRSIKESIPNVYFIVNQIDRHDETETKFGDYQAQVEEMLCNEGISREALYFTSVTEPDHPFNQMGALREELSRIEQQSKSNMQALTEQKVRNLLKEHTEMLKKDETGAPSFAEQLNIHTGLVQSLRDQLDEAEKQMTEAEKRMQEEINRILKNANLTPFEMRELAAAFLESQEPSFKTGFFFSKAKTAQERDKRRNAFFSDVAKRTEAEADWHMIDTLHKLAKVFDVYTAESEKLIQAYRTPLDISIIEHAVKHGAAFSSEYVLQYTKDLAELIRKEAKREAADIIKVLSAMVKERVSKDVQTINDRLVQESEKLVFLQEQARLENNAREKTDRLWAIWEEESACPMHIDTEWFKSKKTRVAAPEQKQGRSQLTAQPMPKSEIKMEQEMPLQDQIKRFYTLSDILGECSMLLKQTSAFRERVKRLEERKFTLALFGGFSSGKSSFANALVGERVLPSSPTPTTATINKITKPINGNLNKTANVVFKTEDDLTAEILQLTGIPKEPAGRSFTEKWEKAVKKNRLQEEHVKLISNFLLAYEKYQQYIQEQKKLTIPLSELKPYVAEETTACAVKEVTVYYTCPLTEKGITIVDTPGASSMNKRHTELAFQYIKDADAFFYMTYYQHSFSKGDRSFLRKLGLVKESLSMDKMFFIINAADLAKDKTELETVTDYVSAELVKEGVYEPQLFTVSSKEELVGKPESFYNQFSKVRKHLDRFIEVDVKKASAAQLSSEADKLCETVFQLHQSQHQSREEKEAQKQCLMLSFERTAADIEKRRNSKTIIEKVKKDTREQLYHIAQRLSYFANDLLKSAFHPGLQNGDWKKNVSKAMTTALHEYLFEYIQEIKTLDVRMSGFIERHINEEWLDHFQKTLNEDGYFSVYAGDQHSNGIQLKEVEPEIEERAFEQELKEIKSPKQFFEQKGKATFIEAVRMKLTKITEAWIKNEEESLISHYTAHLRRLQEDMGEKAIAQITDQKETYLRGYAEGEHAKEIEMAYQACISWKNSDNTIKM GT:EXON 1|1-1193:0| SW:ID YPBR_BACSU SW:DE RecName: Full=Uncharacterized protein ypbR; SW:GN Name=ypbR; OrderedLocusNames=BSU22030; SW:KW ATP-binding; Complete proteome; Nucleotide-binding. SW:EXACT T SW:FUNC + BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 1->1193|YPBR_BACSU|0.0|100.0|1193/1193| GO:SWS:NREP 2 GO:SWS GO:0005524|"GO:ATP binding"|ATP-binding| GO:SWS GO:0000166|"GO:nucleotide binding"|Nucleotide-binding| COIL:NAA 43 COIL:NSEG 1 COIL:REGION 294->336| NREPEAT 1 REPEAT 2|121->503|754->1144| SEG 29->40|aaklaavmkkaa| SEG 618->628|fggfssgkssf| SEG 721->733|yekyqqyiqeqkk| BL:PDB:NREP 2 BL:PDB:REP 50->299|2j69A|2e-09|31.0|226/671| BL:PDB:REP 754->878|2j69A|3e-05|25.0|118/671| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 46->337|3a1uB|2e-04|24.7|227/246| RP:PFM:NREP 4 RP:PFM:REP 46->184|PF00350|5e-06|28.8|139/165|Dynamin_N| RP:PFM:REP 206->573|PF03999|4e-04|25.7|338/493|MAP65_ASE1| RP:PFM:REP 738->819|PF00350|1e-06|33.3|81/165|Dynamin_N| RP:PFM:REP 994->1177|PF05879|6e-04|23.5|179/690|RHD3| HM:PFM:NREP 3 HM:PFM:REP 46->201|PF00350|1.8e-31|27.6|152/168|Dynamin_N| HM:PFM:REP 615->838|PF00350|2.3e-41|31.3|166/168|Dynamin_N| HM:PFM:REP 573->632|PF08298|8.5e-06|35.0|60/358|AAA_PrkA| GO:PFM:NREP 4 GO:PFM 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DISOP:02AL 319-330, 594-595, 881-882, 884-886, 933-938, 1192-1193| PSIPRED 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