[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Corynebacterium glutamicum R (cglu2)
Gene : BAF54212.1
DDBJ      :             hypothetical protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  15/68 : Bacteria  612/915 : Eukaryota  2/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
:513 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   117->199 2j7nB PDBj 4e-04 31.2 %
:RPS:PFM   6->473 PF01654 * Bac_Ubq_Cox 2e-85 46.7 %
:HMM:PFM   6->473 PF01654 * Bac_Ubq_Cox 1.5e-161 45.4 434/436  
:BLT:SWISS 1->487 CYDA_BACSU 1e-95 43.7 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID BAF54212.1 GT:GENE BAF54212.1 GT:PRODUCT hypothetical protein GT:DATABASE GIB00498CH01 GT:ORG cglu2 GB:ACCESSION GIB00498CH01 GB:LOCATION complement(1344699..1346240) GB:FROM 1344699 GB:TO 1346240 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT hypothetical protein GB:PROTEIN_ID BAF54212.1 LENGTH 513 SQ:AASEQ MDVVDIARWQFGITTVYHFIFVPLTIGLAPLVAIMQTFWQVTGKEHWYRATRFFGTVLLINFAVGVATGIVQEFQFGMNWSEYSRFVGDVFGGPLALEGLIAFFLESVFLGLWIFGWGKIPGWLHTASIWIVAIATNISAYFIIVANSFMQHPVGAEYNPETGRAELTDFWALLTNSTALAAFPHAVAGGFLTAGTFVLGISGWWIIRAHRQAKKAEAEIESKHSMHRPALWVGWWTTVVSSVALFITGDTQAKLMFVQQPMKMASAESLCETATDPNFSILTIGTHNNCDTVTHLIDVPFVLPFLAEGKFTGVTLQGVNQLQAAAEQAYGPGNYSPNLFVTYWSFRAMIGLMLGSLAIAVIAWLLLRKKRTPTGKIARLFQIGSLIAIPFPFLANSAGWIFTEMGRQPWVVHPNPESAGDARTEMIRMTVDMGVSDHAPWQVWLTLIGFTILYLILFVVWVWLIRRAVLIGPPEEGAPSVKAKTGPATPIGSDMPMTPLQFTASAPTTGEKE GT:EXON 1|1-513:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 1->487|CYDA_BACSU|1e-95|43.7|453/468| TM:NTM 8 TM:REGION 16->38| TM:REGION 53->75| TM:REGION 91->113| TM:REGION 126->148| TM:REGION 177->199| TM:REGION 346->367| TM:REGION 379->401| TM:REGION 444->465| SEG 232->243|wvgwwttvvssv| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 117->199|2j7nB|4e-04|31.2|80/931| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 6->473|PF01654|2e-85|46.7|428/432|Bac_Ubq_Cox| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 6->473|PF01654|1.5e-161|45.4|434/436|Bac_Ubq_Cox| GO:PFM:NREP 3 GO:PFM GO:0016020|"GO:membrane"|PF01654|IPR002585| GO:PFM GO:0016491|"GO:oxidoreductase activity"|PF01654|IPR002585| GO:PFM GO:0055114|"GO:oxidation reduction"|PF01654|IPR002585| OP:NHOMO 969 OP:NHOMOORG 629 OP:PATTERN -----1-----------1-1-11--421-1--------------------11-----1---222---- 11111-11111--111111-11--1211111-11112111111111111111111-11--11111121112--------111-11-111111-111----11-1-1-1-111111111111111111-11-11-11--------2-1111---1111-------11141---------------1------12233333333233333312222233312111111111112-111111111111111111111-1-22-11-1111122-1-1111111111---------------------------------------1----------------------------2--1-11-1----11--------111111-----122111-11113111111111111-33234133211-3111-111111131-1-11111111--2222222221111-31------------11111111111111-1---12-1333233332333222255533333124542222-1112-1---11111-11--2-211----------12--1211111121111121211111122221113111-111111--1--------111-11221311211121222211221221121211--1-11-------23122322222222222-2222222222222222222332223233333333333333232222222221-211111111111---12222122221111311111111111111122222121112111212222112112111211112121-111133333122112234344333-------------------------------------------------------------11 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------1------------------------ ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 80 STR:RPRED 15.6 SQ:SECSTR ####################################################################################################################ccccccccccccH###HHHTTTTTTccTTcccccccTTccccccccTTcccccccccccccccccccccHHHcTTEETTEEEE########################################################################################################################################################################################################################################################################################################################## DISOP:02AL 471-493,504-514| PSIPRED ccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEcccEEEEccHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccEEEEEEccccccEEEEEEEccccHHHHHcccccccEEccccHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccccHHHHHcccccccccc //