[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Corynebacterium glutamicum R (cglu2)
Gene : BAF54942.1
DDBJ      :             hypothetical protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  418/915 : Eukaryota  0/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.173.1d.218.1
:692 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   327->430 2dqbE PDBj 2e-08 21.6 %
:RPS:SCOP  38->88 1no5A  d.218.1.5 * 5e-05 19.6 %
:RPS:SCOP  292->456 1ou5A1  a.173.1.1 * 4e-16 9.1 %
:HMM:SCOP  25->128 1v4aA2 d.218.1.9 * 1.2e-07 25.0 %
:HMM:SCOP  292->527 1miwA1 a.173.1.1 * 7.2e-07 25.6 %
:HMM:PFM   131->245 PF08335 * GlnD_UR_UTase 1.1e-12 33.0 115/142  
:HMM:PFM   384->469 PF01966 * HD 3.1e-13 35.4 79/118  
:HMM:PFM   29->87 PF01909 * NTP_transf_2 7.5e-08 25.4 59/93  
:BLT:SWISS 1->692 GLND_CORGL 0.0 76.6 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Links DAD Abbreviations Back to title page
GT:ID BAF54942.1 GT:GENE BAF54942.1 GT:PRODUCT hypothetical protein GT:DATABASE GIB00498CH01 GT:ORG cglu2 GB:ACCESSION GIB00498CH01 GB:LOCATION complement(2133497..2135575) GB:FROM 2133497 GB:TO 2135575 GB:DIRECTION - GB:PRODUCT hypothetical protein GB:PROTEIN_ID BAF54942.1 LENGTH 692 SQ:AASEQ MNDPAQLRHGAEQDALALLGSLALPAGTTLAATGSLARSELTPYSDLDLILIHSPGQTPEGVEDLWYPIWDAKKRLDYSVRTPAECVEMISADSTAALAMLDIRFIAGEEDLFATTRRKILDKWRQELNKNFDAVVQTAIARWRRSGPVVAMTRPDLKHGRGGLRDFELINALALGHLCDVPKLDSQHRLLVDVRTLLHVHARRSRDVLDPEFAVDIALDLGFVDRYHLGREIADAARAIDDALTAALATARGLLPRRGGFAFRNTVRRPLDVDVVDANGTIALSKKPDLTDPALPLRVAAAAAKTGLPVSDSTWARLAECPELPEPWPPAASADFFRILSSPENTRRVVKQMDRHHLWERYVPEWDRIRGLMPREPSHVSTIDEHSLNTVAGCALETVTVARPDLLVLGALYHDIGKGTDRPHEQVGAEMVAKAASRMGLNLRDRASVQTLVAEHTTLAKIASRLDPRSEEAVEKLLDAVHYDLVTLNLLEVLTEADAEATGPGVWSTRLEQALRIVCQCARSRLIDIRPVAPMLVHRGDIALVEKDGTNTVRWHGDDLRKIFSVMAAKGWTVNAARMVANGEWTGEFDVRANGPQDFDPQLFLQSYQSGIYSDVPAPAPGLTATFWYGNILEVRTELRIGAIYALLRTLPSALWINAITRGATLIVQAALAPGFDRVAVERDVMKVLAAS GT:EXON 1|1-692:0| BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 1->692|GLND_CORGL|0.0|76.6|692/692| SEG 15->37|alallgslalpagttlaatgsla| SEG 233->252|iadaaraiddaltaalatar| SEG 300->304|aaaaa| SEG 485->496|lvtlnllevlte| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 327->430|2dqbE|2e-08|21.6|102/356| HM:PFM:NREP 3 HM:PFM:REP 131->245|PF08335|1.1e-12|33.0|115/142|GlnD_UR_UTase| HM:PFM:REP 384->469|PF01966|3.1e-13|35.4|79/118|HD| HM:PFM:REP 29->87|PF01909|7.5e-08|25.4|59/93|NTP_transf_2| RP:SCP:NREP 2 RP:SCP:REP 38->88|1no5A|5e-05|19.6|51/100|d.218.1.5| RP:SCP:REP 292->456|1ou5A1|4e-16|9.1|164/204|a.173.1.1| HM:SCP:REP 25->128|1v4aA2|1.2e-07|25.0|104/285|d.218.1.9|1/1|Nucleotidyltransferase| HM:SCP:REP 292->527|1miwA1|7.2e-07|25.6|195/265|a.173.1.1|1/1|Poly A polymerase C-terminal region-like| OP:NHOMO 424 OP:NHOMOORG 418 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- 111-1111111-1-11111-11--1111111-11111111111111--1-----------111-1--111-1111111-------111-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11111-----111111111111111111111111-11111111111-111111111111111111111111111--------1111-111------------------------------11-11111111111111111111111111111111111-111111111111111112111111--11-11--1111-1111111-11111-1111111111111---2-----------------------1111111-111-1111111122111111112121---1111------11111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111---1-----111111111111111-111-11111111111--11111111111111111111---------111111111111111-1-----111----111-----11-----------------------------------------------1- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 193 STR:RPRED 27.9 SQ:SECSTR ######################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################cccccGGGcccccccccccccccHHHHHHHHHHHcTcHHHHHGGGcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHTccHHHHHHHHHHTTTTccccccHHHHHHHHHHGGGTcccHHHHHHHHHHTTccccTTccccccccccccHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHTTccccEEcTTccccccccccTTccc############################################################################################################################################################################# DISOP:02AL 1-3,261-266,533-535,692-693| PSIPRED cccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEEcccccccccccccEEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEcccccccccccccHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHcccccccccccccEEEccccEEEcccHHHHcHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHccHHHHcccHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHccccccccEEEEEEEEHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHccccccHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHccccccEEccHHHHHHHHHHHccccccHHHHHEccccEEEEEEEEEccccccccHHHHHHHHcccccccccccccccEEEEEcccEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHcc //