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Corynebacterium glutamicum R (cglu2)
Gene : BAF55245.1
DDBJ      :             hypothetical protein
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  17/68 : Bacteria  552/915 : Eukaryota  135/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.288.1
:659 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   472->633 2o70F PDBj 4e-10 22.4 %
:RPS:SCOP  480->630 2o8iA1  a.288.1.1 * 2e-35 24.6 %
:RPS:PFM   41->418 PF00860 * Xan_ur_permease 6e-28 31.4 %
:RPS:PFM   478->633 PF09349 * OHCU_decarbox 4e-17 29.7 %
:HMM:PFM   36->420 PF00860 * Xan_ur_permease 1.7e-96 38.3 376/389  
:HMM:PFM   477->635 PF09349 * OHCU_decarbox 2.1e-32 27.2 158/162  
:BLT:SWISS 28->477 YGFU_ECOLI 3e-82 39.4 %
:BLT:SWISS 472->645 URAD_XENLA 1e-13 28.1 %
:PROS 368->388|PS01116|XANTH_URACIL_PERMASE
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID BAF55245.1 GT:GENE BAF55245.1 GT:PRODUCT hypothetical protein GT:DATABASE GIB00498CH01 GT:ORG cglu2 GB:ACCESSION GIB00498CH01 GB:LOCATION 2471409..2473388 GB:FROM 2471409 GB:TO 2473388 GB:DIRECTION + GB:PRODUCT hypothetical protein GB:PROTEIN_ID BAF55245.1 LENGTH 659 SQ:AASEQ MDKFHIEDEGTTPNAVTTSTTTRVKHPVDQVPPAPKLAALGLQHVLAFYAGAVIVPLLIAQSLNLDTATTIHLINADLLTCGIATLIQSVGIGRHIGVRLPIVQGVTTTAVAPIIAIGLGVTDGQGGVASLPAIYGAVIVSGIFTFFAAPVFARFLKFFPPVVTGTVLLVMGASLLSVSANDFVNYADGVPAARDLAYGFGTLAVIILAQRFFRGFMGTLAVLIGLVGGTAVALILGDANLDEVGNAEAFDITTPFYFGVPEFNAVAIFSMIIVMIITMVETTGDVFATGEIVGKRTRRSDVTRALRADGLSTLIGGVMNSFPYTCFAQNVGLVRITGVKSRWVAAAAAGFMIILGVLPKAGAIVASIPSPVLGGASLALFANVAWVGIQTIAKSDLADSRNSVIVTSALGLAMLVSFRPDVAQAFPEWARIFVSSGMSVGAITAILLNLLFFHVGRQSGGQVATSKSGKRINLDAVNKMDRTDFVETFAPLFNSKTWPLETAWESQPFANVTELREAIQVAVLTAPLSDREELIHDYPDMAQLILATEEEASTISQDRGSIGLDDLDDVDQEKLITVTEQYRERFNMPYVAYFDTMDSVDTVVAAGLRRLDNSDEQEHRQALSEIIEIANDRFDILLADANPARSAFDRKFTETDFLG GT:EXON 1|1-659:0| BL:SWS:NREP 2 BL:SWS:REP 28->477|YGFU_ECOLI|3e-82|39.4|442/482| BL:SWS:REP 472->645|URAD_XENLA|1e-13|28.1|171/175| PROS 368->388|PS01116|XANTH_URACIL_PERMASE|PDOC00860| TM:NTM 11 TM:REGION 38->60| TM:REGION 69->91| TM:REGION 98->120| TM:REGION 130->152| TM:REGION 163->185| TM:REGION 208->230| TM:REGION 261->283| TM:REGION 311->333| TM:REGION 344->366| TM:REGION 370->392| TM:REGION 431->453| SEG 11->22|ttpnavttsttt| SEG 266->283|vaifsmiivmiitmvett| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 472->633|2o70F|4e-10|22.4|161/168| RP:PFM:NREP 2 RP:PFM:REP 41->418|PF00860|6e-28|31.4|360/381|Xan_ur_permease| RP:PFM:REP 478->633|PF09349|4e-17|29.7|155/159|OHCU_decarbox| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 36->420|PF00860|1.7e-96|38.3|376/389|Xan_ur_permease| HM:PFM:REP 477->635|PF09349|2.1e-32|27.2|158/162|OHCU_decarbox| GO:PFM:NREP 4 GO:PFM GO:0005215|"GO:transporter activity"|PF00860|IPR006043| GO:PFM GO:0006810|"GO:transport"|PF00860|IPR006043| GO:PFM GO:0016020|"GO:membrane"|PF00860|IPR006043| GO:PFM GO:0055085|"GO:transmembrane transport"|PF00860|IPR006043| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 480->630|2o8iA1|2e-35|24.6|138/155|a.288.1.1| OP:NHOMO 1562 OP:NHOMOORG 704 OP:PATTERN ------------------------2---211-1-----11111--1-1------11--111------- --1-1212111-211---------12------2111-332-----13-1--12224------11-133341322222211211-----2221-122----------------------------------1-1--1----------1--------------1---------------------131-----1122222222322222422233262221222232222222232222222222222222222232322223222222222223112222111211121122222222222222222222222211133111111432344434334451511133321-321211-11112--1121111-1----111-------1211----------11-111112-22221112-----111------3421---115----11122222222-2222--------------------------------------211114556544344455534444446437573--3312112251112--8-----121222222----1--12-2112111111-1-11-1---1111--1--111------1----------------41111-2-1111111111311111111111--1----------23224335555545555-555555555554555555244422212323333333332323333234444--311121111222-------------1112122222221111111133323351311-55554665445461222----------12252222222122-----------------1--------------1------1--------------------1-11111111--- ----12---------11112111121-11-111-------2---11-111111111111111111111-1--111-----1-111111-1111111111---1423--4-88576411-2-11-1-12-2B2-112--1-3111221-1-31-21232247B1D22-12143255-53-H---21969926531----2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 161 STR:RPRED 24.4 SQ:SECSTR #######################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################ccHHHHHTccHHHHHHHHTTccTTcHHHHHHHGGGcccccHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHTcccTTcHHHHTTcccHHHHHHHHHTTTTcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccGGGccHHH#HHHHHHHHTTccHHHHHHHHHHHHHHHHHHH########################## DISOP:02AL 1-2,6-25,461-480,544-565| PSIPRED cccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHccHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHcccccccccccccccEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHccccHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHccccccccccccccccccHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHcccHHHHHcccccccccHHHHHHHHcccHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEEcccccHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHcccccccc //