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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_00306
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  99/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
:963 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:RPS:PDB   859->942 3ce7A PDBj 3e-04 17.1 %
:HMM:PFM   257->331 PF04191 * PEMT 8.3e-05 23.0 74/198  
:BLT:SWISS 48->948 CHO2_SCHPO 0.0 44.7 %
:PROS 798->810|PS00018|EF_HAND_1
:TM
:REPEAT 2|28->330|332->600
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID CIRT_00306 GT:GENE CIRG_00306 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 963 SQ:AASEQ MAEAPAVPMGGAGLRERKIQASRTQEPSPPADSLMSKMRTDESSKIESEKKTFGRTPDGTVFTVPHTRDMVSQLLSPSEPKNLSDILVLTILALHILLLRSLPASIRIPVFAVIFLSWRAAYNIGIGWLLHMQSNHRTLVLWARKLRLFVDPATGQNPHPFLYRFIKRELETKIPEDYTFESAPIEYNTWLVFRRVVDLILMCDFTSYCLFAVACGSRPIGEGLFVMMLRWLAGTSLVLFNLWVKLDAHRVVKDFAWYWGDFFYLIDQDLTFDGVFEMAPHPMYSVGYAGYYGISLMAASYKVLFISILAHAAQFAFLVLVENPHIEKTYNAPPPRKRVVDHDTALHEDVGSRSNSFNSDTTPPLPVPSTTQPRSTHALVGSMDVHRVTDVSVLLIHLLFFALTIITPSTPAYQFFFVLNAAVWRIWYSAGIGYILDRQSTRKSWTRHFVKFGEGQDEAWRQWKGIYHLSMTTCYASFIAAAWKMYTLPQDWGYGLAILRHVLGASLIALQIWTSMSIYESLGEFGWFFGDFFYDESPKLTYSGIYRFLNNPERVLGLAGVWGAVLITNSRAMIFLALLSHTLSIAFIQLVERPHMQKLYGRSLRRDAGLVKSIKRSLPNSLKQFQGSVDKILDESIEFVEEVIDTARPKLAAGVNTFVKDTTALLHKYPARITITRLEPDLAGYEMKDYSLTVEGTQLAQFDKSTDATNNKSRNSRRSEDLVLEYGAPIKVKWTAPLNHSKKDWIGLYMVTHNSSREITKVSSQGRWIATNEGAFDSLTSEVGLKSSDVIIKYAGNDNDKTREVASGEIIFSGEKLWWNQGVFEFRYHHNGKHNVMAISRPFEIRIAKFDENEIPLDNYAVVRPAIEGALLPIIQNCLDRDPDIAPQNAEEAFGSQVDRDSKYTKRVVFAVQHMFGIEFAPEVVSADGNVRNLAWRICNAKKVLAPYSMSCASGATTPVQED BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 48->948|CHO2_SCHPO|0.0|44.7|816/905| PROS 798->810|PS00018|EF_HAND_1|PDOC00018| TM:NTM 6 TM:REGION 82->104| TM:REGION 110->132| TM:REGION 196->218| TM:REGION 223->245| TM:REGION 299->321| TM:REGION 396->418| NREPEAT 1 REPEAT 2|28->330|332->600| SEG 86->102|ilvltilalhilllrsl| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 859->942|3ce7A|3e-04|17.1|82/90| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 257->331|PF04191|8.3e-05|23.0|74/198|PEMT| OP:NHOMO 110 OP:NHOMOORG 99 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----11--21--22111121111111111211111112112111111-11111111111111111111-11111121-1111112111-11111111111111211-1-1-----------------------------------------------------------------1-----------1-1--------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 87 STR:RPRED 9.0 SQ:SECSTR ##########################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################cHHHHHHHHHHHHHTTccTTccccTTcc##GGGcccTTcccccHHHHHHHHHHHHHHHTccccHHHHTTcccHHHHHHHHHHHHccccc################ PSIPRED cccccccccccccccEEEcccccccccccHHHHHHHHccHHHHHHcccccccccccccccEEEcccHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHcccccccHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHcccEEEccEEccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHcccccccHHccccccccHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHcccccEEEEEEccccccccccccHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHccccHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHccccccHHHccccccccccHHcEEEEEEcccccccccccccccccccccccccEEEEccccEEEEEccccccccccEEEEEEEEEccccEEEEcccccEEEEEcccccccccccccccccccEEEEccccccccccEEEEEEEEEcccccccccEEEEEEEEcccEEEEEEcccEEEEccccccccccccccccHHHHHHHHHccHHHHHcccccccccccHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccc //