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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_00320
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  186/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.118.1c.1.19
:1215 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:BLT:PDB   733->856 1fvpA PDBj 2e-04 34.0 %
:RPS:PDB   320->516 2db0A PDBj 3e-06 18.0 %
:RPS:SCOP  352->516 1b3uA  a.118.1.2 * 5e-09 12.7 %
:RPS:SCOP  702->801 1dioA  c.1.19.3 * 1e-04 18.9 %
:HMM:SCOP  376->1045 1b3uA_ a.118.1.2 * 4.1e-11 19.9 %
:RPS:PFM   247->359 PF08514 * STAG 1e-26 43.8 %
:HMM:PFM   244->362 PF08514 * STAG 2e-39 41.0 117/118  
:HMM:PFM   397->446 PF04240 * DUF422 0.00056 24.0 50/215  
:BLT:SWISS 171->798 SCC3_SCHPO 2e-78 30.7 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID CIRT_00320 GT:GENE CIRG_00320 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 1215 SQ:AASEQ MEDPAHSNERDSSALSEPTGASLAEETDRRQSGRVRRKPELFSSQTFTPGSTKRKRANSPREDDENDASDEGDAEEDPHEEVEDEEVDDESEGESDEEELRERRRAAKKATKKRAKEGNKKTKRAAKKPKIGNGVETELALRPFINGEAKKPKKPKKQHLRPSGFVGEEGLYAEVFARGHTTDAVAAEWLTRYEEHNINAMCDLVNFILRCTGADSKVDVHDIEDVDNVANRLNDLQEEYQSQNITEYPLISKSKKFRGFQSVLTGYFESLIRTIHSASILYNDAALLENIQAWITSMSSAPIRPFRHTATIISLTIVTTLCHLAKEVSTTLSNTRKQLETEKKKKTVNKGRVGALQSKVQENEQKLETIDGIIHDSFDTVFVHRYRDVDPKIRAECMTALGVWIITYRQVFFEGQYLRYLGWVLSDTFAHTRSVVVHQLRRLFQNKDNIPGLRAFTERFRPRVVEMAVRDAESSVRAAAVDLSDLIRDAGLLEPDDIDSIGRLVLDTEAKVRKAAGKFFVANIQDVYDSQVEGLEEELNESFGDDDEDDDFKIPKRSWIKYKCLVDMLQAYDMQQSELTEEQEASSKTNLFANQVESRFALATDSIYPHLQELSQWESLAGYLLYDHSQIPESAADDTSGNTIKQLYRLDDGQEAILLEVLGAAVKLYTQEVSKSDTDKKGRRTKQLVEMMEAKQEAIAHSLSQIIPQLLNKFGAVPEAASAVLRLEHLVNLDLIQDLQKDAAAYAEILNNINKQFLIHSDQNVLAEATVAFLHARTSEELREAMENKVQELWDDTLDALCTVVANKHVQSNDTLSLSILGSLKDTIVRISNLASIFDCTSVLETSPQGSNKRKSRAEPPVDILLTIAKRGLRLPDSDEEVDLIEEELIFSTFKTLLVYFMWKIQSLKSGISNGKASFNGQFFERLSNRQEACIAILTAIMDTRKGVDRTRIAAATTLLDLQTAFGTLRHISTRDREGDDETMSQIEDLVRDISPAASASISRIHDAVLKAYAKKTHHAIDLPADEEPLSQEDLEDSSDEEDEDMDDDVDDVQSSARRMRAQLLAEQKLCEFTGKIVLAIIGHVLDSSGSQAGKLKTKLLRNRTRLGHNYKAVVAYLEDDKAPARRTSKPNPRNQQINGATGNLSNGKVKSAERVVDDEEDDEGEGVQHVEEDEEDDLRARGLVGDENNPVTDYGEGEDAESPLTPAEDDIMGD BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 171->798|SCC3_SCHPO|2e-78|30.7|606/962| SEG 70->130|degdaeedpheevedeevddesegesdeeelrerrraakkatkkrakegnkktkraakkpk| SEG 150->157|kkpkkpkk| SEG 545->551|dddeddd| SEG 879->890|deevdlieeeli| SEG 954->965|aaattlldlqta| SEG 994->1005|ispaasasisri| SEG 1026->1056|deeplsqedledssdeededmdddvddvqss| SEG 1095->1107|klktkllrnrtrl| SEG 1154->1178|ervvddeeddegegvqhveedeedd| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 733->856|1fvpA|2e-04|34.0|106/231| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 320->516|2db0A|3e-06|18.0|183/239| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 247->359|PF08514|1e-26|43.8|112/119|STAG| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 244->362|PF08514|2e-39|41.0|117/118|STAG| HM:PFM:REP 397->446|PF04240|0.00056|24.0|50/215|DUF422| RP:SCP:NREP 2 RP:SCP:REP 352->516|1b3uA|5e-09|12.7|157/588|a.118.1.2| RP:SCP:REP 702->801|1dioA|1e-04|18.9|95/551|c.1.19.3| HM:SCP:REP 376->1045|1b3uA_|4.1e-11|19.9|342/0|a.118.1.2|1/1|ARM repeat| OP:NHOMO 399 OP:NHOMOORG 186 OP:PATTERN 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----111-211-11111111111111111111111111211111111111111111111111111111-1111111111111-11122-1111111111111112111112755765323322357152Th9-72531223133533223322A2545313311151112211111111-11111111211111-211- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 644 STR:RPRED 53.0 SQ:SECSTR 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PSIPRED cccccccccccccccccccccccccccccHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHcccHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHcHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccHHHHHHccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHcHHHccccHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHcccccccccccccccccccHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccHHHcccc 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