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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_00332
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  15/68 : Bacteria  168/915 : Eukaryota  120/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
f.38.1
:587 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:RPS:PDB   113->310 2d33D PDBj 2e-07 7.1 %
:RPS:SCOP  34->198 1pw4A  f.38.1.1 * 5e-12 11.8 %
:HMM:SCOP  16->537 1pw4A_ f.38.1.1 * 7.7e-62 24.1 %
:RPS:PFM   50->538 PF00083 * Sugar_tr 6e-37 32.3 %
:HMM:PFM   50->539 PF00083 * Sugar_tr 8.5e-48 23.3 434/451  
:BLT:SWISS 4->538 PHO84_YEAST e-178 59.2 %
:PROS 159->184|PS00217|SUGAR_TRANSPORT_2
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID CIRT_00332 GT:GENE CIRG_00332 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 587 SQ:AASEQ MATLTAGGNSAFKNFHNQFAHIQDPNERRRLALAEIDKAPFGWYHIRAIVVAGIGFFTDAYDIFAINLASAMLGVVFWLDAKDKPGKIPSSADTAIKVATSGGTVIGQVGFGWLADVVGRKKMYGLELMVIIFATLAQALSSDSPGVSIVGLLIFWRVIMGIGIGGDYPLSSIITSEFATTKWRGAMMGAVFAMQGIGQFAAALVALIVAAGFKESLKTAESESQCSGVCQVAVDKMWRVVIGFGAVPGCIALYYRLTIPETPRYTFDVQRDVVKGAEDTKAYMLGKPEGSPDELQRIATLEQSQSQLQVPKASWSDFWTHYKQWKHGKVLLGTAGSWFFLDVAFYGLGLNNSIILSAIGYTGGKDMYEIMYNTAVGNLILICAGAIPGYWVTVATVDTLGRKPIQIMGFTMLTVLFIVIGFAYDKLLHSNNGLLALYVIAQFFFNFGPNSTTFIVPGECFPTRYRSTSHGLSAASGKVGAIIAQCVFGPLVSRGAKPGSSEKPWLKHVMQIFALFMLCGLITSFLIPETKRKTLEELAGEVPETPNYDPVTAGHARREGQQVKGGEETPETVSPDMQPNEKHTTIV BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 4->538|PHO84_YEAST|e-178|59.2|527/587| PROS 159->184|PS00217|SUGAR_TRANSPORT_2|PDOC00190| TM:NTM 12 TM:REGION 42->56| TM:REGION 62->81| TM:REGION 123->145| TM:REGION 147->169| TM:REGION 189->211| TM:REGION 231->253| TM:REGION 335->357| TM:REGION 375->397| TM:REGION 404->426| TM:REGION 433->455| TM:REGION 474->496| TM:REGION 506->528| SEG 201->211|aaalvalivaa| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 113->310|2d33D|2e-07|7.1|169/499| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 50->538|PF00083|6e-37|32.3|424/433|Sugar_tr| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 50->539|PF00083|8.5e-48|23.3|434/451|Sugar_tr| GO:PFM:NREP 4 GO:PFM GO:0005215|"GO:transporter activity"|PF00083|IPR005828| GO:PFM GO:0006810|"GO:transport"|PF00083|IPR005828| GO:PFM GO:0016021|"GO:integral to membrane"|PF00083|IPR005828| GO:PFM GO:0055085|"GO:transmembrane transport"|PF00083|IPR005828| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 34->198|1pw4A|5e-12|11.8|153/434|f.38.1.1| HM:SCP:REP 16->537|1pw4A_|7.7e-62|24.1|411/447|f.38.1.1|1/1|MFS general substrate transporter| OP:NHOMO 769 OP:NHOMOORG 303 OP:PATTERN ------5556665654-2-----------------------------1-------------774---- 2--2---1----11-----------1------------24------1--11-1-1-1---------2-----111-----1---1--1-----------------------------------------------------------11------11----1----------------------1------2-1--------1----------1-----------------------------------11-------------1111-----------------------------------------------------------------------------------------1-1-----1---------------------1-----1----11111111111------2-2-------------------------------1-1111111-----------------------------------------------1111211----11321-----413-111--1-1------------2-----------------------------------------------------------------------------22------------------1----1-11-1--------------1---1--1111111111-11111111111111111111-1----1111111111111111121--111-1-----------------22222-------1----------------2212221-------1--11-------111--1----1----------------------------------------------------------------------------------------- ----11------223547444437576441222333322222222296676999117442255232-215123242222215555432-6D5433A3333324635-221---11--------------------------------------2---1-----------------441--1--357DDK5B7346767- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 169 STR:RPRED 28.8 SQ:SECSTR ################################################################################################################TTcccccTTccccccHHHHHHHHHHHHHcccHHHH######TTccEETTEEccccccccccGGGccccEEEEccccTTccHHHHHHHHc######################ccEEEEEEEEccTTcTTcccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHH#HTHHHHHHHHHHTTcTTcEEccTTccccEEHHHHHHHH##################################################################################################################################################################################################################################################################################### PSIPRED cccccccccccccccHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHccccccc //