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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_00364
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  31/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.4.1
:755 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   662->724 2ebiA PDBj 2e-05 17.5 %
:RPS:SCOP  663->715 1x58A1  a.4.1.1 * 6e-08 27.1 %
:HMM:SCOP  656->727 1ityA_ a.4.1.4 * 1e-06 33.3 %
:RPS:PFM   283->449 PF02614 * UxaC 4e-04 27.2 %
:HMM:PFM   663->689 PF00249 * Myb_DNA-binding 4e-07 44.4 27/48  
:HMM:PFM   420->623 PF05760 * IER 0.0002 22.7 163/300  
:BLT:SWISS 641->739 TAZ1_SCHPO 5e-06 28.6 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID CIRT_00364 GT:GENE CIRG_00364 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 755 SQ:AASEQ MPVATRSSSRPLASSIIPNSPAKRWRAEPHLPSEHPRGPAEEDLDDIDGTTLHQPPPESSISSGSDSDPDSDSDNPISSVTPINKQSAGFSRTKNPHSNPSPTVRKGPLSLPVKSPRGKGVKISHVEVPASPLDNPDIRLSPPQRAQRTPYQLNPRLMLNALPKLERWSDKILLLWSQYGSSYSRLKRHITNSTVKIKIEESWGDSYLGYKRHFGDRHFINVARALDAFPSIEDLNWSPTGIYQKANLAQLTLDIIYFCNGTRSDSPLDIIDSLFPSPFIPGEDEPLSEDTTRRIFEIGLEIRTQRCILEMIESGKEKKPESILKDIFYGDIFEDSPLRGWEVDGLDETDLPEEFRDRIEERIGNIRETFREDDTAVEISRLKTAFPWSEFVVRVASWVRETTDQINDQLKAQDDCNTAIAKLRSEFEPRAILDRQKTDEISQRTPPLESSPKWSRGLHRGERIFRPPRGREGSPELGSRPSEDAAVTIEHEQIPEQVQTASLPETAAPQKNFVSRALLRHFRQFMDRTHTTASTTHQQVGEASRHTAPPPATFLDRQKNAERISPIQSSPLGDRGPRRKTKRARSEENEDEESAFETTSRPSKRPRVVTEIRRRSPSRTAADRPQRAVSVASSSGRRLPESLQSRESTPTLEDRPTGGIVQRVRWTIEEDRQLIRLVGKYGSSWSRIKAADSNEENPKLENRNQVQLKDRGRQITFDYLRTRQKLPKNFKRINITKPQRKRLEEIGVDPDKREE BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 641->739|TAZ1_SCHPO|5e-06|28.6|98/663| SEG 55->79|pppessissgsdsdpdsdsdnpiss| SEG 587->597|eenedeesafe| SEG 628->635|avsvasss| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 662->724|2ebiA|2e-05|17.5|63/86| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 283->449|PF02614|4e-04|27.2|147/463|UxaC| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 663->689|PF00249|4e-07|44.4|27/48|Myb_DNA-binding| HM:PFM:REP 420->623|PF05760|0.0002|22.7|163/300|IER| GO:PFM:NREP 2 GO:PFM GO:0006064|"GO:glucuronate catabolic process"|PF02614|IPR003766| GO:PFM GO:0008880|"GO:glucuronate isomerase activity"|PF02614|IPR003766| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 663->715|1x58A1|6e-08|27.1|48/49|a.4.1.1| HM:SCP:REP 656->727|1ityA_|1e-06|33.3|66/67|a.4.1.4|1/1|Homeodomain-like| OP:NHOMO 33 OP:NHOMOORG 31 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----------------1-1111111121111111111121111111----------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------1--------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 87 STR:RPRED 11.5 SQ:SECSTR ####################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################cccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccTccccccHHHHHHHHHH######## DISOP:02AL 17-18,20-20,25-25,45-45,48-48,53-53,67-67,81-81,115-115,123-123,129-129,137-137,143-144,146-146,151-151,179-179,185-186,188-188,193-193,207-208,213-214,216-216| PSIPRED ccccccccccccHHHccccccHHHHccccccccccccccccHHHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEEEEEEcccccccccccEEccHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEEccccHHHHHHHHHcccEEEEEEEcccccccccHHHccccccEEEHHHHHHHcccHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHccccccccEEcccccccccccccccccHHHHHHHccccccHHHccccccccccHHHHcccccHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHccccccccccHHcccccccccccccccccHHccccccccccHHHHHHHcccccccccccccccccEEEccccccccHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHccccHHHHHHHcccccccccc //