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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_00412
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  91/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
b.55.1
:893 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:RPS:PDB   139->242 1dynA PDBj 7e-06 16.1 %
:RPS:SCOP  139->242 1dynA  b.55.1.1 * 1e-06 16.1 %
:HMM:SCOP  137->253 1v88A_ b.55.1.1 * 0.0003 20.4 %
:RPS:PFM   287->371 PF10296 * DUF2404 9e-13 36.5 %
:HMM:PFM   287->376 PF10296 * DUF2404 7.1e-32 46.7 90/91  
:HMM:PFM   147->191 PF00169 * PH 0.00092 22.2 45/104  
:BLT:SWISS 147->484 YP091_YEAST 1e-59 37.9 %
:BLT:SWISS 783->848 BSCL2_RAT 2e-04 43.9 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID CIRT_00412 GT:GENE CIRG_00412 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 893 SQ:AASEQ MGSLFVLFLVYVLGGVTFIPVVFGLLFLHAYLTLPSVENAPELDKDGSDGIHRSADDQSSVQSGTDVLAEKFQRTHESDVAAGYFTVCREYVPGGVNGKPPERTTPAGEVITPESPSVYQSMYRSIFERKQAPTIDPAKPNGKNIKKGRNVFYIVLRHGHLMLYDDSEQVEVRYVISLSHYDVSIYGGGESIPEGELWIKRNAVCLSRKSSQSDVNNPQVTALPFYIFSDNPSEKEDLYFAILKNLEKLPDSPISPPTAQHFDVKDIVNLVKRLHSSEENLQTRWFNALVGRLFLALYKTSELESHIWMKIAKKISRVKKPNFITSIVLRKINAGEGAPLITNPRLKDLTVDGNCCVEADVMYDGNFRIEIAATARIDLGTRFKAREVDLVLAVVLKKLKGHGLVRFKPPPSNRLWVSFETMPEMEMTIEPIVSSRQITYGVILRAIESRIREVIGETLVKPFWDDVPFLDTSRQPHRGGIWQETSRPISDHGVADDFGVEQRPAKEPSDEVLGSEGQTVGVVSLSPPPSPDSNEQNKSTLTLDDAPAEVDNISQVDLHPPPGQGSSEPELPLTSDSSSAEHMALDTKLEDTDATSTMVDLPTYSNNTYAGSLHHRSRQRSISFQKSHDHFTNSRSRTDSILSKASTSSIPESSDGDSAGLTAKNINHQEGSPTTRLGSSPSSPKPLETRQTMSSLGSAAAAAAKKWGWNVLGRTDQSHKVGGTVIPDHPIGRGRPLPPPGTPLPPPEKSTFRVNPISMPKRKPLAPHLFPETAERSEKNLPERRPMRHRKSTSSTKTEDSRTQEELLIIRAPSGSEPNSPLPAEAESPEKPPLNGENTDKQSVQNGNLPGLSASPTTKANVLDANGHEESRHALDATEEVIAAVNPVENLVS BL:SWS:NREP 2 BL:SWS:REP 147->484|YP091_YEAST|1e-59|37.9|338/770| BL:SWS:REP 783->848|BSCL2_RAT|2e-04|43.9|57/377| TM:NTM 1 TM:REGION 9->31| SEG 4->16|lfvlflvyvlggv| SEG 388->405|vdlvlavvlkklkghglv| SEG 420->432|etmpememtiepi| SEG 524->533|slspppspds| SEG 699->704|aaaaaa| SEG 730->747|pigrgrplpppgtplppp| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 139->242|1dynA|7e-06|16.1|93/113| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 287->371|PF10296|9e-13|36.5|85/91|DUF2404| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 287->376|PF10296|7.1e-32|46.7|90/91|DUF2404| HM:PFM:REP 147->191|PF00169|0.00092|22.2|45/104|PH| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 139->242|1dynA|1e-06|16.1|93/113|b.55.1.1| HM:SCP:REP 137->253|1v88A_|0.0003|20.4|108/0|b.55.1.1|1/1|PH domain-like| OP:NHOMO 104 OP:NHOMOORG 91 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-12111111111111446-----------------------------------------------------------------------------------1--------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 93 STR:RPRED 10.4 SQ:SECSTR ##########################################################################################################################################EccccGGGTccEEEEEEEEccEEEEEccTTcccEEEEEEcTTEEEEEcccccccccEEEEEEETTcccccTTccc###########EEEEEccHHHHHHHHHHH########################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################### PSIPRED ccEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHccccccccccccEEEEEEEccEEEccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHcccccccccccHHHHccccccccEEEEEEEcccEEEEcccccccEEEEEEEcccEEEEEccccccccHHHHHHccEEEEEEccccccccccccccccEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHccEEEEEEEEccccccEEEccEEccccccccEEEEEEEEEcccEEEEEEEEEEcccccccccEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEccccccEEEEEEccccEEEEEEEEEEccEEccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHc //