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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_00417
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  118/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.118.8
:762 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   307->500 3e6yA PDBj 4e-05 9.5 %
:RPS:SCOP  307->656 1hz4A  a.118.8.2 * 6e-07 15.8 %
:HMM:SCOP  302->666 2c2lA1 a.118.8.1 * 6.5e-07 17.1 %
:HMM:SCOP  572->764 1qqeA_ a.118.8.1 * 2.1e-06 18.8 %
:BLT:SWISS 4->616 APC5_SCHPO 9e-55 28.1 %
:TM

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID CIRT_00417 GT:GENE CIRG_00417 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 762 SQ:AASEQ MARYLTPSKLALLALVSIYSEGVVPNSAIVALLSFFMSHLLPLDSQDSKSRILEGGAHTISIKEFEEVTSSLTSSIPGRTVWDLFLKRLWQLDCLDSLEEFFGLVSDLVTKTREDQLRDQNSGMAPEPGKMRFSRTSPLGMFIRRAQLEYARLQFHDSVALWRAFIRYRMPTYYAWAKRNPMDSQTKVDVNLVELGLDVDSPLAKVVYGDLENDEEDTKVSLSTKDMERLLEFQVEEMQSKGTRVTEEMRKRLRQMLASGVAVPSLSHYVRFLDSWRAGDYPSSFDNLHRYFDYAMHNRDRACYQYALLNLATLQADFGCLGEAVSAMQEAISIARETQDMHCLNYCMSWLYHCRKAWPSAVRDVQNTGMLGSDREALAFLQAKARENEMWGLLSTSILAEAKLELCYGESISSVFEHVTKAAHLNATQNLNPSMGQLLVIQAVLFMRLGASHLAMAMYDVFRECYSEDAIFDDYLNATFRSSHLLFFSGNHSKAMQQLEEVASNDFHSLKSQQIWTFAHGLLKLRQQIHRDDKVAVEHLISQLQACVPSEPDQAISLSLLQTEFFISKGDYSSALRSIEQVAKSTQQGNFDVSLQIGLLNLKARVFQNTDQPERAFSLVMRAASIAYRARVLPGLWEALGNLAVILIAFQEFDAAADILESIMPQVLEGEDCMLGARTYSLLADANMGLAGRNKHDGVRQKEHIARASEFIDCAFEGYSKAEDVRGQCEMTSKKATLMHLSGDLALANDYAARYLDLKKAG BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 4->616|APC5_SCHPO|9e-55|28.1|565/737| TM:NTM 2 TM:REGION 14->36| TM:REGION 632->654| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 307->500|3e6yA|4e-05|9.5|189/234| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 307->656|1hz4A|6e-07|15.8|298/366|a.118.8.2| HM:SCP:REP 302->666|2c2lA1|6.5e-07|17.1|175/0|a.118.8.1|1/1|TPR-like| HM:SCP:REP 572->764|1qqeA_|2.1e-06|18.8|181/290|a.118.8.1|3/3|TPR-like| OP:NHOMO 129 OP:NHOMOORG 118 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----1-------1-11211111111111111111111211111111111111111111111111--111111-1111111-111111----1---------1-1-----1211111-11-111111-1251-11111111-111-11--1--1122-1----11----11------------------1--------1 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 305 STR:RPRED 40.0 SQ:SECSTR ###################################################################################################################################################################################################################################################################################TcHHHHHHHHHHHHHHHTTcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcHHHHHHHHHHHHHTcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccTHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccTTHHHHHHHHHHHHHHTcccHHHHHHHHHcccTTccccccccccHHHHHHHHHHTTccHHHHHHHHTcHHHHHHH####HHTcccTTTccccccHHHHHHHHHHHHHHTcGGG################################################################################################################################################################################## DISOP:02AL 762-763| PSIPRED ccccccHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHccccccccccHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHcc //