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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_00706
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  24/68 : Bacteria  384/915 : Eukaryota  95/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
f.38.1
:583 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   66->259 2d33D PDBj 1e-06 9.6 %
:RPS:SCOP  86->259 1pw4A  f.38.1.1 * 4e-17 16.7 %
:HMM:SCOP  50->583 1pw4A_ f.38.1.1 * 2.8e-59 24.9 %
:RPS:PFM   21->73 PF12005 * DUF3499 8e-04 34.6 %
:RPS:PFM   98->499 PF06609 * TRI12 3e-12 22.7 %
:HMM:PFM   92->496 PF07690 * MFS_1 5.4e-45 24.9 342/353  
:BLT:SWISS 86->558 FNX1_SCHPO 3e-49 30.8 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID CIRT_00706 GT:GENE CIRG_00706 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 583 SQ:AASEQ MSSPRRVTESTPLLHNGTASVPDIPDDIDEESLDRDLANVQSVPHGGETEPGFPPVPPRDGASEAAKQTTPKGSHHFINVSPAQFWVIFTGILFSYIIAFFDSTLMGSIHPVVTSYFNSSNSASWLSTGFLLTCTAFQPLFGRVSDTFGRRPVYLFAIFVFFITTAWCALAQSIGSFIAARVCCGLGAGAVASLGMIMSSDLIYVEYRGIYQSYINLAYGTGSSLGLAFGGLLADKLGWRAAFGIQLPFIFIYLVAAYFTTPQSLGPQLAYQEGFSLMQAIKSIDLKGSFLLVTGVTALMLGINLGGNVLSWDHPLVICSLAAFGAIVALFIKVEREAKRPVMPLPLLSSFPRANLILGNFCANITINTVLFNAPLYFQAVKLESPTNAGFRLVGASLMLMISSVFTGLLMTKTRRLKPPLILGSICLIYGTCSMSMLRRDAPGWIGMLSVSPASFGQGFAFPATMLSVLAVSEQGEQAVVTTTLGLFRNLGSVMGVAISSWVLQNSLRVYLNLSVTGDDKAEIIQRVRRSVAAISELDPIHQYQVIEAYERALRITFLSSIVSSALVFLLVAPVRLPRLRRR BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 86->558|FNX1_SCHPO|3e-49|30.8|467/531| TM:NTM 13 TM:REGION 86->108| TM:REGION 116->138| TM:REGION 152->174| TM:REGION 185->207| TM:REGION 239->261| TM:REGION 286->308| TM:REGION 314->336| TM:REGION 355->377| TM:REGION 389->411| TM:REGION 418->438| TM:REGION 447->469| TM:REGION 493->514| TM:REGION 555->577| SEG 220->238|gtgsslglafgglladklg| SEG 566->582|alvfllvapvrlprlrr| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 66->259|2d33D|1e-06|9.6|188/499| RP:PFM:NREP 2 RP:PFM:REP 21->73|PF12005|8e-04|34.6|52/121|DUF3499| RP:PFM:REP 98->499|PF06609|3e-12|22.7|396/526|TRI12| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 92->496|PF07690|5.4e-45|24.9|342/353|MFS_1| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 86->259|1pw4A|4e-17|16.7|174/434|f.38.1.1| HM:SCP:REP 50->583|1pw4A_|2.8e-59|24.9|410/447|f.38.1.1|1/1|MFS general substrate transporter| OP:NHOMO 2288 OP:NHOMOORG 503 OP:PATTERN ------4122112221-------1--------1-1---1----242-11-321--------11----- 2112E11644423132222-22--63222222433345462223322233313542-5---232523755----------1-2-----11-1-1-------1---3-1-1-----------------1---1111-4442221132--------------------1----------------243----172544545686466565721432464633323322233226E2333233333333333332133226722323441143425323211--------11-------------------------------------5411121211111222-111-----1--2-23332---231-------1-2---------12111211113---11-111111-111112-3-5--422134-333--11-------------111111113---------------------------------------1--11--24444433212244472222154472224--223--1--1----1-------1---------------12------11----1-12----1111131-2-----------------------1-3311--1---1-1-2222--1111----1-11-------------1-43121------------------------------13112-------------------2-------1-----------------34232------2-1---------------111-1-------11211323-2231-221-------------122222-----111-1--------------------------------------------------------1----------- ----11--------4HIWDPLROkfkNIICGFFXVNFKGHCJKA99SEERQSkQCDIKJCBD567258441185B3333345554586-IH6I5D6A76AA28B79---------------------------------------------------------------------------------1-Q--------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 188 STR:RPRED 32.2 SQ:SECSTR #################################################################EEEccHHHHTccHHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHH#####HccccEEEGGGcccccEEcTTcEEE#cTTcccGGGcTTcccccTTccccccHHHHHHHHHHHHHcccHHHHTTccEETTEEccccccccccGGGccccEEEEccccTTccHHHHHHHcccEEEEEEEEccTTcTTcccHHHHHHHHHHHHHHH#################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################### DISOP:02AL 582-584| PSIPRED ccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccc //