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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_00708
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  60/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
g.38.1
:693 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:BLT:PDB   86->117 1qp9D PDBj 9e-06 46.9 %
:RPS:PDB   90->121 1ajyA PDBj 3e-07 45.2 %
:RPS:SCOP  85->128 1f4sP  g.38.1.1 * 4e-11 22.7 %
:HMM:SCOP  91->131 1d66A1 g.38.1.1 * 1.4e-09 46.3 %
:RPS:PFM   94->121 PF00172 * Zn_clus 2e-05 50.0 %
:HMM:PFM   92->122 PF00172 * Zn_clus 3.9e-08 38.7 31/40  
:BLT:SWISS 88->122 YOG2_SCHPO 2e-09 62.9 %
:BLT:SWISS 416->513 PFA4_EMENI 5e-04 36.2 %
:PROS 93->121|PS00463|ZN2_CY6_FUNGAL_1
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID CIRT_00708 GT:GENE CIRG_00708 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 693 SQ:AASEQ MSSTVGGHLLPQNDFDIPLNLAASPSVSAIPDYSGNGGAYQIAAKLDSNPSQNATVKQQSAVGSTVAGAAAAGRGAGPATRPDAPKSKRVRTGCLTCRERHLKCDETLPRCQNCQKSDRLCKRGVRLNFIDTQVAAPPYAVPSSHDWQVNFHDESREIASEYLGGYERYPSLKKETPSRRAGPVYAYRETQAMATPHPGPTSASLLTPFAEHPQPDITAEPIFHGTPQAPAPDSAYTEHAMARSPFDAPKHPLAPANELRPYLNTAEEVLLMQVYVEEVGLWMDSMDPGKHVFNPSFGEEKALYYYNISTRDLLTCLQDPNRDTVLCATTAVVLNVYEVMCEKAMQRMNHIAGARALIKECRWNAKTTGIGGACFWLNVGMELLSCLHFNWKMAWDPDTWDIDMNMSLNQGSIAGDEEFWTHRMLYICAKIANYRATMAYQGLDRSSHDPRLNQRCEEWNALRAWCDEWARCAPRSMMPLGYLHPWETNSKSSFPEVWLIKRSAVVGRLFYHTACCLLAKVHPTESEYSDEMLSMQHSHAHDICGIVAHVKDRGVASVSIRCLAIAAECVVGREAQEEVIAILDKIIKETGWQVGFLQHELIEKWGWNSATSHMSPHQSQHPQMAAAGPSTDLGSSLLNSALPSAPPSRPRMPQGIVNPLMATADFSFDNHPYQNHYVAPHNNHLNNYHYGSY BL:SWS:NREP 2 BL:SWS:REP 88->122|YOG2_SCHPO|2e-09|62.9|35/419| BL:SWS:REP 416->513|PFA4_EMENI|5e-04|36.2|94/435| PROS 93->121|PS00463|ZN2_CY6_FUNGAL_1|PDOC00378| SEG 60->82|savgstvagaaaagrgagpatrp| SEG 635->653|ssllnsalpsappsrprmp| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 86->117|1qp9D|9e-06|46.9|32/75| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 90->121|1ajyA|3e-07|45.2|31/71| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 94->121|PF00172|2e-05|50.0|28/38|Zn_clus| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 92->122|PF00172|3.9e-08|38.7|31/40|Zn_clus| GO:PFM:NREP 4 GO:PFM GO:0003700|"GO:transcription factor activity"|PF00172|IPR001138| GO:PFM GO:0005634|"GO:nucleus"|PF00172|IPR001138| GO:PFM GO:0006355|"GO:regulation of transcription, DNA-dependent"|PF00172|IPR001138| GO:PFM GO:0008270|"GO:zinc ion binding"|PF00172|IPR001138| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 85->128|1f4sP|4e-11|22.7|44/65|g.38.1.1| HM:SCP:REP 91->131|1d66A1|1.4e-09|46.3|41/41|g.38.1.1|1/1|Zn2/Cys6 DNA-binding domain| OP:NHOMO 114 OP:NHOMOORG 60 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------33224462433311111112221111111111223115233321222212----1--2-1------11111------3------------------------------------------------------------------------------------------------1--------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 37 STR:RPRED 5.3 SQ:SECSTR #####################################################################################cccccccccHHHHHTTcccccccccccHHHHTTcccc########################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################### PSIPRED ccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccEEcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHcccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccEEccccccccccccccEEEccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHccccccccccccccHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccc //