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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_00740
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  2/68 : Bacteria  62/915 : Eukaryota  187/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
d.37.1f.20.1
:875 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   184->551 1kplB PDBj 9e-09 26.2 %
:BLT:PDB   736->793 2j9lD PDBj 2e-09 43.1 %
:RPS:PDB   192->303 3ejyA PDBj 1e-29 25.2 %
:RPS:PDB   590->784 2d4zA PDBj 7e-13 20.5 %
:RPS:SCOP  105->587 1kpkA  f.20.1.1 * 8e-82 23.8 %
:RPS:SCOP  593->784 2j9lA1  d.37.1.1 * 9e-15 29.2 %
:HMM:SCOP  80->585 1kpkA_ f.20.1.1 * 5.8e-111 33.0 %
:HMM:SCOP  581->652 2d4zA2 d.37.1.1 * 1.3e-08 26.8 %
:HMM:SCOP  708->787 2d4zA1 d.37.1.1 * 2.2e-07 26.2 %
:RPS:PFM   186->561 PF00654 * Voltage_CLC 3e-67 44.9 %
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:HMM:PFM   593->645 PF00571 * CBS 2.2e-08 30.6 49/57  
:HMM:PFM   740->785 PF00571 * CBS 1.8e-08 37.0 46/57  
:BLT:SWISS 61->150,156->672,725->783 CLCNX_USTMA e-149 52.2 %
:PROS 740->750|PS01090|TATD_2
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Abbreviations Back to title page
GT:ID CIRT_00740 GT:GENE CIRG_00740 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 875 SQ:AASEQ MNPNISSHSAPRRRPSSHSIPAKRHSGLSFLSTVEHEPNTPITPVTPVAGEPHSQNPTITEEISEIKRYEDFTTIDWVQDAVHDRPDGARGGTRQLDFGTKRAWLVVTIVGAAIGLNAGFLNIVTEWLADVKLGYCTTAFYLNEAFCCWEAENGKCPEWKRWSTLPPINYVVYFVFAVLFASSGAVLVDAIAPYAAGSGISEIKVIIAGFIMKGFLGVRTLLIKSIGLPLAIAAGLSVGKEGPSVHIAVCTGNVISRWFSKYKRHAAKTREILTATSAAGVAVAFGSPIGGVLFSLEEMASHFPLKTLWRSYFCALVATGVLAAMNPFRTGQLVMFQVKYERTWHFFELIFFVILGVFGGLYGAFVMKWNLRAQAFRKKHLSRHPIIEATVLAGLTALVCYPNMFMRITMTEMMEILFRECEGKHDYNGICQATRRWSMVFSLFMATVLRVLFVIISYGCKVPAGIFVPSMAIGASFGRMVGILVQALQESFPHSKFFAACEPDVPCITPGTYAFLGAGAALSGIMHLTISVTVIMFELTGALTYILPTMIVVGVTKAVSDRFGRGGIADRMIWFNGFPFLDSKEEHIFNVPVSHAMTNKPVVLPATDFPVRKAERLLENNKFQGFPIVEDLTSRTLVGFIGRTEFQYAINRAKREDRLFSPEAKCRFVPQPSSFQTTSSTSLSTSNLSQSSGRYFDSSIATPSSSRPVEEHLPPQTFDDIATPSGVRSIDFSSYVDVAPITVHPRLALETVMEIFKKMGPRMILVEHRGRLSGLVTVKDCLKYQFKVEHQELADANATSSDRLAANGGKEEGLVEQKVWEIIQWVVGKVASWRRRGGRSERFEDGSRRPRDNSFDIIDGTEDVDTFDGIVELEE BL:SWS:NREP 1 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ccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHccHHHHHHHHHHcccHHHccccEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEccccccccHHEEccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEEEcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHcccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHcccEEEEEcccccHHHHHHHHHHccccEEEEEEcccccEEEEEEEHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHccccccccccccccHHHHHccHHHccccccccccccccccccccccccHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHccccEEEEccccEEEEEEEHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccHHHcccccccccccccccccccccc //