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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_00746
DDBJ      :             
Swiss-Prot:IML1_COCIM   RecName: Full=Vacuolar membrane-associated protein IML1;

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  3/915 : Eukaryota  165/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.4.5
:1833 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:BLT:PDB   1322->1396 1o7fA PDBj 8e-09 30.7 %
:RPS:PDB   1302->1389 2csoA PDBj 2e-17 21.8 %
:RPS:SCOP  1308->1396 1o7fA1  a.4.5.31 * 3e-25 28.1 %
:HMM:SCOP  1296->1439 1o7fA1 a.4.5.31 * 9.2e-31 26.1 %
:RPS:PFM   180->488 PF12257 * DUF3608 5e-95 63.0 %
:RPS:PFM   1318->1386 PF00610 * DEP 3e-17 52.2 %
:HMM:PFM   180->488 PF12257 * DUF3608 2.3e-76 41.3 281/281  
:HMM:PFM   1317->1387 PF00610 * DEP 9.7e-33 54.9 71/74  
:BLT:SWISS 1->1833 IML1_COCIM 0.0 100.0 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID CIRT_00746 GT:GENE CIRG_00746 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 1833 SQ:AASEQ MRATIASLQDSKVDSARPDSPQYSPKSPSKRSCTLWVHDETFSREEVLCNLQALPDFGLNVGYLVEVSVAQGDHLGSQLKPEAGSRYLQDEGSFTSPRWPIGAGGSASRSTFGGDAKLRSRKTPGKFLFIVKPFPPEVRAKHPNLQVSVANHVANAFGFKNRSQIHLTVRKRAQCSASHVELIFRDQFLLRSDMWRLTMSELVDRPIYKGQKILFMGSIKATVKSVYISGNKTLSAYFSPNTIPIFRSESARFVLFIQMSKEMWDFDSEGTGDILFSRVINSLMPELFKRWANIDAHHLVTIVLFTRVQYDFATPTSGPATLNSSFLNRGPDGSAPKTQDFYRVVVNDMPSGQWTTILDSLKKEFRTFLRDVSIPPPYFPDTPIAAEDIPRFTESHPPKIAGRPTSALRGNILEAIHVASSYLAFEHIGRDLVRTGTSIVIITPGTGVFEVPFKILSLTSDVLTSRAIGIDLICLSPMPLHSVPLFKYKLPRDTSCRPGSSISSRLAPYEHRRMSATFSTAHMSPLDRPGTALSDQALQGIGSSPQEEEWGYGIPHWVDISYWDPKLDRASRAAAKKKTTMSPVIATIAKNSQLFVPKVRMYEIQMMGVMESEQSNISIPHMSSTSSRTQKRPGTLASLAASIGNSPSPDSSYRSQAGDGFRPKSFMYNIKDSKKSMLPPDAKERTNLVEWMDSYDQSIFHLHPKQKRPRRRSKAKQAAETETSRPSQHETPKLRSSMDLGQPDNRHLSPFGQPHLQLRYERIEEESLVTPRRITQPPTQTNMKSIMKPKPKLPIPRISRSISFALRGLGSAPPRAHASTEVKTEHAQALPTSGGRTPEDPASEASNTVTPRQNSPLNSGAATPKPERSEADAPSNVEAMTPSKPILIRAIRRTGEDGSVEPLPLEGSFSTQGTEPRHDLLQHHDSQGAFPVKRTGRRLDLLSSGDPTSPPTVSATDALSPWVSPINPWNPPKLAPSRSSWYGRWQHVYPRIPKTTSVKWKSLKSPASLPITAEELPTESELTSNFLQTPYRVYQNDEADAEVPKTREMLLRDMISLRLSHGFQIVVGKKVEEQSTGYSNIFDTNALSKDGTTVFMARGNVIHRLVCVEGEIEVTKFTRRPLNGFPTDELNDASISYSPAVKTILSAQYCKNTISLGAPPEEYNWNSADAFLAGHRDHITNSIRQLRFWRTRFVLIPVQVPLAARRHISSFHEDNEEEIHLLGIYKLTQMWQRHRYIPPEERQFQSAARKSKDQNPLNIIYQTSDPSVVVAAELDRLLLEDPGLDNAPAQLLPDSELLQRYNITLAFLAQKIQGEKGVRMMDRRWHWRLHYNCFVGMEFTTWLLQNFRDIDTREEAVEFGNDLMTHGLFHHVQRRHNFRDGNYFYQIADEYRVVRPESRGGWFQPRKVDKSNPNTPMGEAMKDSASSIRARAEKSIDETGSKLDIPGSSKPSRPKPSISLAKSLKYDVDPRKRSDRPEVIDLHYDRIHNPENCFHIELSWMNATPKLVEDAIMSWVGTAEKYGLKLVELPISEASSIVERQVFRRPYPIKLKVDPPPTPVSTYLTATSFTSQAVPDHHFYQKAILKKFDFVLDFEAKSAFPANVDVCYSWGKPDYQFPQYVHRTGAVLAQITDEGHFLLLANRFHNSHNPVSLKDSNKFDRSSEYFPRPRAATFDPLDRRSPLLSPVARPTPGTDSSIPSASPPYISASDASQNSYRVTDQIKDSMRAFCSDAEQLEAFFAEMAMAKGKTATTAGPASLSSVKLSPTTPATVDSSIPSLELPASVVARNLHLPQPVALAAAQASAETPQVAGSIDAVMRSTSVSSPRNGAFRH SW:ID IML1_COCIM SW:DE RecName: Full=Vacuolar membrane-associated protein IML1; SW:GN Name=IML1; ORFNames=CIMG_00704; SW:KW Complete proteome; Membrane; Vacuole. 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OP:NHOMO 231 OP:NHOMOORG 168 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- 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----111-----11111111111111111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111111-13111111111111111-11131111111-1111174121BG21732111111111111--11131111112-11112311--1211-------------1--112232- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 95 STR:RPRED 5.2 SQ:SECSTR 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PSIPRED 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