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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_00762
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  9/68 : Bacteria  904/915 : Eukaryota  162/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
b.40.4
:189 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   65->188 1vs5L PDBj 2e-36 57.7 %
:RPS:PDB   65->187 3bbnL PDBj 2e-43 56.6 %
:RPS:SCOP  66->188 1fjgL  b.40.4.5 * 2e-41 59.0 %
:HMM:SCOP  66->190 1fjgL_ b.40.4.5 * 7e-44 56.8 %
:RPS:PFM   65->187 PF00164 * Ribosomal_S12 5e-33 61.5 %
:HMM:PFM   66->187 PF00164 * Ribosomal_S12 6e-46 52.9 121/122  
:BLT:SWISS 41->186 RT12_YEAST 6e-42 56.2 %

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID CIRT_00762 GT:GENE CIRG_00762 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 189 SQ:AASEQ MPATPSTFTIRLLRHLVHRQFPSIASKPVHPALQLRACKSSSPLATLLHQKTQIAHFSSTSRPQATYNQVRRGCRKEQQARKPRSPALVNRPEMKGVCLKTGITKPKKPNSGERKIARIRLSSGRVVTAYIPGEGHNIQQHSVVLVRGGRAQDCPGVRYHVVRGALDLSGVGGRITSRSKYGTKKPKSG BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 41->186|RT12_YEAST|6e-42|56.2|144/153| BL:PDB:NREP 1 BL:PDB:REP 65->188|1vs5L|2e-36|57.7|123/123| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 65->187|3bbnL|2e-43|56.6|122/123| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 65->187|PF00164|5e-33|61.5|122/122|Ribosomal_S12| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 66->187|PF00164|6e-46|52.9|121/122|Ribosomal_S12| GO:PFM:NREP 4 GO:PFM GO:0003735|"GO:structural constituent of ribosome"|PF00164|IPR006032| GO:PFM GO:0005622|"GO:intracellular"|PF00164|IPR006032| GO:PFM GO:0005840|"GO:ribosome"|PF00164|IPR006032| GO:PFM GO:0006412|"GO:translation"|PF00164|IPR006032| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 66->188|1fjgL|2e-41|59.0|122/125|b.40.4.5| HM:SCP:REP 66->190|1fjgL_|7e-44|56.8|125/0|b.40.4.5|1/1|Nucleic acid-binding proteins| OP:NHOMO 1101 OP:NHOMOORG 1075 OP:PATTERN -------1----------------------------------------------11111111------ 1111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111121111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111121111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112-11111111111111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111--111111111111111-11-111111111111111111111111--111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111 11------1---11111111111111111111111111-111111111111111111111-111111111111111111111111121-11111111111111111-1--21211--1111-1111121323-111111111111-1111111111111211111111-111121211--------3-7112------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 124 STR:RPRED 65.6 SQ:SECSTR ################################################################ccTTHHHHTccccccccccccccTTTcccEEEEEEEEEEEcccccccccEEEEEEEETTccEEEEEcccccccccTTcEEEEccccccccTTccEEccTTcTTccccTTcccccccTTcccccc# DISOP:02AL 8-20| PSIPRED ccccccEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccHHHccHHHHHHHHccccccHHHHHHHcccccccccccccccccccccccEEEEEEEEEcccccccccccEEEEEEccccEEEEEEcccccccccccEEEEccccccccccccEEEEcccHHcccccccccccccccccccccc //