[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_00772
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  40/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.25.1
:803 amino acids
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:SCOP  211->312 1t0qB  a.25.1.2 * 3e-05 11.6 %
:BLT:SWISS 3->103 YJL4_SCHPO 1e-06 31.9 %
:BLT:SWISS 401->617 SEPT9_MOUSE 1e-05 31.5 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Abbreviations Back to title page
GT:ID CIRT_00772 GT:GENE CIRG_00772 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 803 SQ:AASEQ MAIIRYQPEELLRLRESPLVIKPDNLPPIEEWMGPIPDPTAQKKNPRDPTNQLESANNQRRPSFFESRHISRTSNSEDLVLGPPKTSFASATRGFGKSIDATDRSFKNNDHDDTKQDRFGGFRDKFFKDREYGDRDKDPDRRDNRTNLTNGRRMNRDDREDWNSRPRRNFGLEEDRDRRPRRSGDGDRWDGRDSKEHRDQQDGGERVNRDRDQGRFPGRRDTPARQRHDQFWHRDGESQDTGEPEEDKTPIRNREWRRGLHGPDRDWNRPVKQEQDPEWMDSTARSDTKEAHTQEDFQRWKERMKAGAAQVSGDTKKEVEPEPPKQEPKTVETKRVDGEMFSSLDPSFQTDAGLDNFFGLFGGHKATQDSPLENLAPESKKETPKPVKSSRFAGFFNTQNEAKEAEPPQSGTPRPASTDADQEGFQRILQMLGGNKSRNATPQVEEPNQPRPPLMQIPQSDFAKAPPPATSPLRETFNRQEYMNFQDQAPRDKAPPGLENLLAQKAPKENNAHGRDTEFLLRLMQQSKLSTQTPTGQNPPSSQGPAGRGLIDLLAGNQGVQVQKNPVYIDDPAIANFRQSNANDPRNQLRRRPTGGPTGYFDEMPYPGATSGNHTPSNPPGLRPQGPPQQPMNIQRPPGLEHVNPNNWPNQQIPQQSNQMMLPPGLPAPQTRNINANFSPAHPMPLPAGMTPSAERPQFQRGASANGPTGFAPPPGIMPPPGYLNMNAPPPSGFPLMPHSVEAMMNLSHGHPGHYGAGPQQGPHQPSSRQLLEMFTQHGGNPGDGNVGARSGAGMMGPAGPYR BL:SWS:NREP 2 BL:SWS:REP 3->103|YJL4_SCHPO|1e-06|31.9|94/497| BL:SWS:REP 401->617|SEPT9_MOUSE|1e-05|31.5|203/100| SEG 9->16|eellrlre| SEG 134->145|drdkdpdrrdnr| SEG 175->193|drdrrprrsgdgdrwdgrd| SEG 315->334|tkkevepeppkqepktvetk| SEG 619->631|ppglrpqgppqqp| SEG 644->659|npnnwpnqqipqqsnq| SEG 708->722|ptgfapppgimpppg| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 211->312|1t0qB|3e-05|11.6|95/322|a.25.1.2| OP:NHOMO 40 OP:NHOMOORG 40 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----------------11-111111111111111111111111111---1-1-11-111111------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- DISOP:02AL 803-804| PSIPRED ccEEEEcHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHcccccHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHcccccccccccccHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccc //