[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_00779
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  149/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.118.1c.45.1c.72.1
:1773 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   907->1009 2bkuB PDBj 8e-09 10.8 %
:RPS:SCOP  304->372 1rxdA  c.45.1.1 * 1e-04 25.0 %
:RPS:SCOP  865->1009 1b3uA  a.118.1.2 * 3e-11 14.6 %
:RPS:SCOP  1373->1509 1wyeA1  c.72.1.1 * 4e-04 17.1 %
:HMM:SCOP  664->1341 1b3uA_ a.118.1.2 * 5.5e-21 18.6 %
:HMM:PFM   907->932 PF02985 * HEAT 0.00016 26.9 26/31  
:BLT:SWISS 232->1571 MIS4_SCHPO 2e-73 24.7 %
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Abbreviations Back to title page
GT:ID CIRT_00779 GT:GENE CIRG_00779 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 1773 SQ:AASEQ MQQQRQPGLAVVIQGNGTSSRASQRLPRPLSVDEALQYSPMTSAPVFGLDSIMRPDVGQPSLSGWPRPYDSQVAGRITDSLDNETQASSGLGESTRLETAREYLQQLLRQDNLTDFNFKVPPSLRSDSSPQKNGESLSRSQLGPFAKLILDSTDATFHYSTPTTTNSEKHHQSSNTLPTPLSSSKPPYSANKEDQMRQQLEKLMKPMVIIPGLAPSSNIEDFKYVSGEGSAKRRKLDSNNEEKQDPLPLRDQKELSDTALVKLQSLLHEIFEAEEQLLPDAPLDAQAGGKFFKFPNTIGDLGPIMSSETHEVLSKALQKVSDYRRLGDIPTEYIKHIQRLCEAPIMAVQSADFKLESPPSDTDIERWITQLEDVQNALLAIITLLQTMPGNQSTKDLCPEDLIHAIPTALGQVFDHCIIPVVECRSSGKDSTHFHVFSAQKQVISNVIHQTKRVLSRLAVFLSNVDLAEGPITAIEFLAARLIFVENAPNDKESAIGVQKYEASRRAAMDVLAKIFAKYPEQRPFILDEILVSLEKLPSNRQSARQFKLIDGKSIQLLSALVIQLVQTTALRQTSSRLTVAKGSLQKATNSLDESDEEDEEDSNNGSERKTSPIKQLSKQVELLYDNAIHSAQYVTKFIVQRAMTSTKSGDQPYRNLLDIFTEDLISVLGSTDWPGAELILRVLASQMITIADHDKSSANAKNMSLELLGWMGSAISDLTSTAQHLSNTLEDGHTDLTDHLRNLFHDYSNRALHIQDIVSLDGPYRMTLEYLEEGDLGSWQLSSARGYLIAQWAKLVCSGYEDSAQGGSTKNPQGAGKLAKALSHILSNPKWLESNSAFDRISTQQARFAYLIIVLSSGFCKGFDTIVKVLLNSITSDQAKVRSRSLKSVIHMLERDPSLLDRDGSVISLILRCATDSSPMVRDSALSLIAKCMFLKPGLEENCCRAILACSSDPTVGVRKRAIGLMKDVYIQTSNQELKLTIIEQLLLRVTDYESSVAVQASQALEEIWFSPLHSSFTESTQGTPQSKVSLKNLMNLIVGSVRRNEGVIATFEAFVKDELSAEAKSASLNFNVCKAVVAAMFDRIIHDSDKTDKRTLQSLLQSITVFARANAKLFTPDQLETLHPYIGHLSNADDLMLFRSVVVIYRCVLPYLSTSHNTLLKDIQNDLFKSVSKLARTELNEVMACLWTINGVLQNTERLVKLTISVLKGINQAVSAKVDPSTSADVLGRVRSYIRIAGCVGKHCDLESFLAFFSQSFPHMKATSVSGLMVDFISPFASSKYPHELRVMALESLGAICETWPAQYSREPAKIAFTSVFEEDSPDLQNIVLKGFLAFFSIHEGKSEKLIQTKDTNGKSEGSTRLGGSLKASENDGAAALIAQHFLQQMLHAALSKEDSHALTGIELIASINRQGLIHPKECAGVLVALETSTNASIANVAFETHKMLHQQHESMFDREYMRAVQDAFYYQRDVVGDPTGASTRPFTAKLAALFEIIKISNSKYQKKFLTNLCSKVDFQPRALDVAGSPPEHMLLARFVCQNLAYFEYAQIGELLATVACMERIVASTGTTVAHAIETDIFPVKIDCPNEQMQVDGAAADQAPHSVDPNSLKQLATAAATLSMLWETRTYLRRLYGVGFHSMPKESKASAKDLNKSLTKVQGIGGDRLWDAISKTMASLENTEGMTRVCREFATLMSIDDELRVAADDDRDGNDSAADFGNMSAMLGATNGSRPSKRRSSVSSGNAPKRPRQKGRPKNTKKRGSTDSEQDGDFD BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 232->1571|MIS4_SCHPO|2e-73|24.7|1243/1583| SEG 173->189|ssntlptplssskppys| SEG 590->608|nsldesdeedeedsnngse| SEG 1704->1717|aadddrdgndsaad| SEG 1731->1742|srpskrrssvss| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 907->1009|2bkuB|8e-09|10.8|102/857| HM:PFM:NREP 1 HM:PFM:REP 907->932|PF02985|0.00016|26.9|26/31|HEAT| RP:SCP:NREP 3 RP:SCP:REP 304->372|1rxdA|1e-04|25.0|60/150|c.45.1.1| RP:SCP:REP 865->1009|1b3uA|3e-11|14.6|144/588|a.118.1.2| RP:SCP:REP 1373->1509|1wyeA1|4e-04|17.1|129/308|c.72.1.1| HM:SCP:REP 664->1341|1b3uA_|5.5e-21|18.6|479/0|a.118.1.2|1/1|ARM repeat| OP:NHOMO 171 OP:NHOMOORG 149 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----1-------11111111111111111111111121112111111111111111111111111111-111111-1-1-1111-111-11111111111111111-1-112222311-1111111-1-252-1111-111-11111-1-2-11-1-111331111121121111-------------111--1----- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 673 STR:RPRED 38.0 SQ:SECSTR #####################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################HHHHHHHHcccHHHHHHHHHTTHHHHHHHHTTcc##cHHHHHHHHHHHHHHTTcGGGTTHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHcTTcHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHTcccGGGcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGcccT######HHHHHHcHHHTTcccHHHHHHHHHHHHTTccccHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHTTcHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHcHHHHcHHHHHHHHHHHHHcTTccHHHHHHHHHHHHTTTccccHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHTccHHHHHHHHHHTcccHHHHHHHGGGHHHHTTTccHHHHHHHHHHHHHHHTcccHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHTcccHHHHTTHHHHHHHHHHHccHHHHHHHTHHHHHHHHTcHHHHHHHHcHHHHHHTHHHHHHHHHTcccHHHHHHHHHHHHHHHHTccTTTHHHHHHHTHHHHHHHHHTcccHHHHHcHHHHTTGGGGHHHHcHHHHHHHTHHHHHHHHTcccHHHHHHHHTTcHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcGGGccHHHHHHHHHGGGcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHH############################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################### DISOP:02AL 1772-1774| PSIPRED cccccccccEEEEccccccHHHHHHcccccHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHccHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEccccccccccccccccccccHHHccHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccHHHcccccccHHccccccccccccHHHHHcccHHHHcccccccccccccccccccccHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccEEEEcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHcccEEEEEccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHccccccccccccEEHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHccccccccccccccHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHEEcccHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHccHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHccHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccEEccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHEEEEcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHccccccHHcccHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc //