[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_00784
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  47/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
:1362 amino acids
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:SWISS 1173->1283 ATPB_BACTN 5e-04 28.8 %
:COIL
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Abbreviations Back to title page
GT:ID CIRT_00784 GT:GENE CIRG_00784 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 1362 SQ:AASEQ MAEQSSHDVVNQTRSGGDLSPSDVPASKPDKFTTGGDGVDVQTLDSKHQRRQDITTASQDKPDGKSITTQDDLATSTKKLEANGIESPIGDYGTSLNHLGDGSGGSDTDASRSDIRSSSKDSTQHSRTSSVKRPASFKPVSFAKFSISKSPNMAAASKYTAEQAPFSASNTSSAPAQQTSRPRLVAKSTSSMRDSTPRALAGSGRSGSGAPDPNQVWNKNRPVQPPPTKHLTDEELKQQYGIHMTSRIQADGDGKEAKWADIDDDEDDWAPETIEWNDGTKINLTQTETNPTPTQTKGETQDTTQQTTLPDKKLIGRGDAKVLASKPPNSLGPNATILKLGANADKQQARSGSDSTKGTNDKDSAIPKGLVPPAKSPWAPLPPIDKVPVTVNPPTQPHRHSRFFHGERSGVEPTPPLPVAAKEIAADDFNRSWRDTQSAAPRELYNSQSGRYEPVSEMRRGQYRNEAHFRPSSLLQRPNHNEQSGPAEPSPAFQTNRSSTSQENTSWSRRRASSNVSGGSGVMGRRLSMSKPDLSHKPHDLPQPRRGSQQNERSTSPRRQYQKGSYIARGASPSRPPVQGMPNHASSSHYTPPASHGGIVHPLATDSPLSQMPPMEDPIAMQQRIMREKREMARQRRLEEEAKEEAAKQERIRLKLEAMGPPPSEKKDSTSALESAKQTTVAPSPPKPPLPEPSGEPKQYGMMKVHPPEPVKKLVPSGERPDVKTGITGPQSHQISSPRESKFEAARTSMPPSINGVHSSTEMSAVQMPESQQDASGDRNLTWKGPMPATSSYSSWSGTKIGAHPSVGSLWGPPNNDKALGNGTFDKNLAGFPSRDISSHGPLMLSDQPPIGPPQHSAERINASERTNQHLHGVPKSIADNGSSLSPLPSPEQRPGRLAGADSLKPISRPGPIAPPNTYSQGQRWQQNQFPRRSEETAPWNNFHLAARKAELEENERFHRELQARREEEARSGVKPALQVTFDETWRQVKTDEAGQRNVVSVNKTTEKSAPLSPLPGLEPIDGLPFSDPNAKVGTTARGSRFFPHGSDQTKRPSDRDNVEPRSPSPPPPEEVSSHPAFTTDSPRPLVHLPAPKPRVRLPPRSSPPPAAPPATFASMVASGPPPPRGSQPIASTATWQDRFNGLFGKKTSQPPHAKRTVLAVASATKEPLEVLPDTLSASVSLPQFDDVESTRDAGKVASKEVEDEEAIFEDREAGSLPVVKVPHMAPKAAWQPALPPSHQRLRSRFQRPVQVQSIEPYIFSSPDRNNPGGVTIIIHLPGTEILKTLTMPGKGGVSSGNNQTRHRSHNFKHRRGAKSREGSGPSSGPYHTSQPPKKMSSPTSGPSRSHSGHGNWASRVAGTAV BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 1173->1283|ATPB_BACTN|5e-04|28.8|111/100| COIL:NAA 22 COIL:NSEG 1 COIL:REGION 630->651| SEG 100->123|gdgsggsdtdasrsdirssskdst| SEG 198->210|ralagsgrsgsga| SEG 255->269|keakwadidddeddw| SEG 285->308|tqtetnptptqtkgetqdttqqtt| SEG 372->383|ppakspwaplpp| SEG 508->530|srrrassnvsggsgvmgrrlsms| SEG 633->651|arqrrleeeakeeaakqer| SEG 683->698|psppkpplpepsgepk| SEG 960->971|relqarreeear| SEG 1060->1076|eprspsppppeevsshp| SEG 1092->1111|pkprvrlpprsspppaappa| SEG 1337->1351|ssptsgpsrshsghg| OP:NHOMO 53 OP:NHOMOORG 47 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------1-231111111111112111121112111111111111111111111-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- DISOP:02AL 1362-1363| PSIPRED ccccccccHHHHHHccccccHHHccccccccccccccccEEEEcccHHHHHccccccccccccccEEEccccccHHHHHHHccccccccccccccHHHHccccccccccHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEEEccccccccccEEEccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEEcccccccccccccccccccccccccEEcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEEEcccEEEEEEccccccccEEEEEccccccEEEEcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHcccccccccccccccccccccccHHHHcccccc //