[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]
Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_00786
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  195/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
a.124.1a.4.1
:789 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:BLT:PDB   8->62 2dimA PDBj 5e-21 70.9 %
:BLT:PDB   57->121 2dinA PDBj 2e-13 55.9 %
:RPS:PDB   5->66 2dimA PDBj 3e-14 67.7 %
:RPS:PDB   52->112 2dinA PDBj 4e-14 67.2 %
:RPS:SCOP  1->171 1ak0A  a.124.1.2 * 9e-15 12.3 %
:HMM:SCOP  6->55 1guuA_ a.4.1.3 * 8.4e-11 46.0 %
:HMM:SCOP  31->116 1ug2A_ a.4.1.3 * 2.2e-18 37.3 %
:RPS:PFM   7->52 PF00249 * Myb_DNA-binding 8e-07 39.1 %
:RPS:PFM   346->709 PF11831 * DUF3351 1e-38 38.9 %
:HMM:PFM   342->710 PF11831 * DUF3351 2.2e-110 37.3 357/379  
:HMM:PFM   7->52 PF00249 * Myb_DNA-binding 6e-12 39.1 46/48  
:HMM:PFM   59->102 PF00249 * Myb_DNA-binding 2.1e-12 45.5 44/48  
:BLT:SWISS 1->789 CEF1_EMENI 0.0 68.1 %
:COIL
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
Abbreviations Back to title page
GT:ID CIRT_00786 GT:GENE CIRG_00786 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 789 SQ:AASEQ MPVVKGGVWTNIEDEIVKVAVSKYGLNQWARVSSLLARKTPKQCKARWSEWLDPAIRKVEWSKEEDEKLLHLAKLMPTQWRTIAPIVGRTATQCLERYQKLLDEAEARESDELGLGGPAGGETAAPSADDVRRLRPGELDPDPESKPARPDTIDLDEDEKEMLSEARARLANTQGKKAKRKARERQLEESRRLAVLQKRRELKNAGINIKVVTTKKGQMDYNADIPFEKKPAPGFYNTTEEQARNERQREMFDPRKQQLANKRKGDQDEEQDKKRQKNDKTGSSAAFAAAAKAGQMQRIREAEQSSKRRALVLPSPQVSEGELEEIVKMGMAGERASRMAGDDDNEGTRGLIANYSSIIGGTPIRTPRAPPEEDRIANEIRNIKALTETQSSLLGGENAPLLEGGGSTGFEGIAPRKHQMVTPNPMATPFRQGGAGTIGGTPLQAGPGATPLRTPRDNFMINKDTGLPVASTPKEMKIQENFIRRQLRQQLGSLPKPKETEWELEELPAEQPEPIMTDTLSEEDAAERDKRNKAAAEEAAKEKFKRQTQVYQRGLPRPRTLDIAALMKQVEEVEDPVKQMVAREMAIIIAHDAHKFPLQGMHIEGKAPKRQLFSNDLLAKAREDIAAEVSSEVLQQWQNNFDSSWASLHECPSALPGLSIYTDEDDFAKQEKDMTAAFDRVQNALIETAEQGNKLEKKVALHYGGYQARAKTLRNKILEANEALQKAKFDLDSFRTLQIAEESAVRGRVESLREEVTFVSRREREAQEVYRQRKEELDSLEAGSINGWH BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 1->789|CEF1_EMENI|0.0|68.1|784/791| COIL:NAA 29 COIL:NSEG 1 COIL:REGION 705->733| SEG 285->293|aafaaaaka| SEG 494->514|lpkpketeweleelpaeqpep| SEG 524->543|daaerdkrnkaaaeeaakek| BL:PDB:NREP 2 BL:PDB:REP 8->62|2dimA|5e-21|70.9|55/70| BL:PDB:REP 57->121|2dinA|2e-13|55.9|59/66| RP:PDB:NREP 2 RP:PDB:REP 5->66|2dimA|3e-14|67.7|62/70| RP:PDB:REP 52->112|2dinA|4e-14|67.2|61/66| RP:PFM:NREP 2 RP:PFM:REP 7->52|PF00249|8e-07|39.1|46/47|Myb_DNA-binding| RP:PFM:REP 346->709|PF11831|1e-38|38.9|350/373|DUF3351| HM:PFM:NREP 3 HM:PFM:REP 342->710|PF11831|2.2e-110|37.3|357/379|DUF3351| HM:PFM:REP 7->52|PF00249|6e-12|39.1|46/48|Myb_DNA-binding| HM:PFM:REP 59->102|PF00249|2.1e-12|45.5|44/48|Myb_DNA-binding| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 1->171|1ak0A|9e-15|12.3|162/264|a.124.1.2| HM:SCP:REP 6->55|1guuA_|8.4e-11|46.0|50/0|a.4.1.3|1/2|Homeodomain-like| HM:SCP:REP 31->116|1ug2A_|2.2e-18|37.3|83/0|a.4.1.3|2/2|Homeodomain-like| OP:NHOMO 785 OP:NHOMOORG 195 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1123454-311211111111111111211111122312122221111112112211123222221322121222211-1112222211-4611315111111263413986764677433334368291Hl41B49342242453242336-4B4B44525433312622211325338*77532986O1N834A8DE4 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 207 STR:RPRED 26.2 SQ:SECSTR HEEEEEEEEEEccccGGGTTcccEEEEETTEEHTEEEEEcTTcEEEEETTEEEEEcTTccEEEEccHHHHHHHccccccTTcccEEccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH#cccccHHHHHHHHHHHHHHTccccHHHHHHHcccEEEEEEETTEEEEEEEEEEEEEEcccEEcccEEEETTccEEEcccccEEETTEEEcGG##################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################### DISOP:02AL 789-790| PSIPRED ccccccccccHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccHHHHccccccccccHHcccccccccHHHHHHHHHHHccHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHcccccHHHHHcccHHHHccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHccccHHHHHHccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccEEEEccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccc //