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Coccidioides immitis RMSCC 2394 (cimm2)
Gene : CIRG_01226
DDBJ      :             
Swiss-Prot:             

Homologs  Archaea  0/68 : Bacteria  0/915 : Eukaryota  171/199 : Viruses  0/175   --->[See Alignment]
f.39.1
:550 amino acids
:SECSTR
:PSIPRED
:DISOPRED
:RPS:PDB   407->506 2aelB PDBj 3e-12 11.3 %
:RPS:SCOP  366->479 1s7bA  f.39.1.1 * 3e-04 11.1 %
:RPS:PFM   331->478 PF03151 * TPT 3e-19 35.2 %
:HMM:PFM   331->479 PF03151 * TPT 6.9e-33 34.9 149/153  
:HMM:PFM   286->321 PF12155 * NADHdh-2_N 0.00026 31.4 35/88  
:BLT:SWISS 135->493 YDB1_SCHPO 2e-68 43.7 %
:TM
:SEG

SeqInfo AminoSeq See neighboring genes
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GT:ID CIRT_01228 GT:GENE CIRG_01226 GT:PRODUCT GT:DATABASE Broad_Institute GT:ORG cimm2 LENGTH 550 SQ:AASEQ MGLDPPQAQSGRSEELAANIFRRESSFSSSSSSSSPSSSSSSDRRPRSKHPEPECEPLVGGNKQDGGPGIGNTQGVGEAAQDTDLVSLAKDTDEGSCSEMEYAGSGDDFNDDEEAGLTTQQRKKRGLLRKKRREEADSKDITLSVAQKHLADKHVARRLAVNVVFILLWYLFSVSISLYNNWMFDPKHLDFSYPLFTTSLHMLVQFSLASSLLYFFPQLRPKNPAAPQATTSMTGGAPNTSPVVTRLFYFTRLVPCGTATSLDIGLGNMSLKFISLTFLTMCKSSTLGFVLLFALILGLETPSMKLIMIICTMTVGVVMMVADEATFNVIGFSLIIASAFFSGFRWALTQLLLLRHPATANPFSTLFFLTPIMFVSLLVLALLIEGPSQILTGLGILTDQFGTLRTLAVLIFPGTLAFCMIASEFALLRRSSVVTLSICGIFKEVITIAAAGILYDDRLTLINVAGLVVTTCCIATYNYMKITTMRKEAQKDIAEHPSELEHESDDEFGRRDTREYHNSEILTNTAEDSPYRPVSSDLDHPGSSSRSRRG BL:SWS:NREP 1 BL:SWS:REP 135->493|YDB1_SCHPO|2e-68|43.7|339/374| TM:NTM 7 TM:REGION 159->181| TM:REGION 199->220| TM:REGION 294->316| TM:REGION 328->350| TM:REGION 356->378| TM:REGION 432->454| TM:REGION 458->480| SEG 25->42|ssfsssssssspssssss| SEG 122->133|rkkrgllrkkrr| RP:PDB:NREP 1 RP:PDB:REP 407->506|2aelB|3e-12|11.3|97/353| RP:PFM:NREP 1 RP:PFM:REP 331->478|PF03151|3e-19|35.2|145/146|TPT| HM:PFM:NREP 2 HM:PFM:REP 331->479|PF03151|6.9e-33|34.9|149/153|TPT| HM:PFM:REP 286->321|PF12155|0.00026|31.4|35/88|NADHdh-2_N| RP:SCP:NREP 1 RP:SCP:REP 366->479|1s7bA|3e-04|11.1|99/106|f.39.1.1| OP:NHOMO 528 OP:NHOMOORG 171 OP:PATTERN -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------2-12--2233422233333322222122222211222222223343432433344421111-1111111111111111-111-232424222335224521132613222-1-1--2242-11443-111-1--1111-1111-21-1-2111--312111112-12212764*77454DFIF1I82112124 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- STR:NPRED 102 STR:RPRED 18.5 SQ:SECSTR ####################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################HHHHHHHHHHHHHTTcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTcHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcTTccHHHHHHHHHHHHHHHHHTTcccc############################################ DISOP:02AL 17-18,20-20,550-551| PSIPRED ccccccccccccHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccEEEEccccccHHHHHHHHHcccccHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHcc //